林志祥在工作中積極探索,努力實踐,主持和參加完成了滇池污染治理、潤滇工程等十餘項水利水電工程,主持科研基金項目“中小水電工程安全監測管理及安全評價體系”,參加了10餘項科研課題的研究。他在工作中先後有多項創新成果:在全國第二、雲南第一把混凝土梯度設計理論套用於工程設計,取得較好的技術經濟效果;提出的強化預處理+人工濕地+自然濕地的處理模式,為滇池治理提供了新的思路和新的模式;在全省第一把三維有限元套用到水庫的滲流計算中,並率先提出“基於築壩土料物理力學指標衰減條件下的土壩長效性評價理論”;針對全國最大規模水工隧洞——滇池西園隧洞提出的防腐加固方案,並成功套用。林志祥目前共發表論文16篇,其中EI 源刊2篇,核心期刊10篇,國際會議論文2篇,發表論文中第一作者5篇,通訊作者2篇,參與編寫《水工建築物》、《大壩安全監測》、《水利專業英語》,編寫工程初步設計報告、項目可行研究報告、大壩安全評價報告等21餘部。獲國家發明專利申請授權5項,同時,他先後獲得雲南省“教學成果二等獎”和雲南省水利學會“優秀論文一等獎”。
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