任務
研究所的任務是：全面開展軟體工程及其相關領域的學術研究，出高水平的研究成果；全面開展軟體工程實踐探索，使之直接服務於社會、造福於人民；培養軟體工程領域的高級研究人才和工程技術人才，為我國軟體技術研究和軟體產業發展做出我們的貢獻。
東南大學軟體工程研究所近年來承擔著近20項國家級和省部級的科研項目（包括國家863高技術計畫項目、國家自然科學基金項目、江蘇省自然科學基金、教育部博士點基金等），同時也承擔了一些橫向合作項目的研究與開發工作。研究所近年來取得了一系列令人滿意的成果：出版高水平學術專（譯）著3部，發表國際著名學術期刊論文10多篇、著名國際會議論文近百篇、國內一級學報論文20篇，申請發明專利9項，獲得軟體著作權登記11項，為社會輸送博士和碩士研究生20多名。
研究所承擔了計算機科學與技術學科、軟體工程學科大量的基礎課和專業課的教學工作，通過教學與科研的緊密結合，促進教學質量不斷提高。
東南大學軟體工程研究所希望和世界範圍內軟體工程領域的研究者和實踐者建立廣泛的交流與合作。
主要研究方向
1）軟體工程的基礎理論和實踐技術
2）軟體分析與測試的基本理論和方法
3）軟體維護過程的基礎理論和方法
4）軟體模式識別與提取
5）網際網路（物聯網）軟體基礎
6）軟體的可信性、可靠性和安全性
