易錯PCR是在採用DNA聚合酶進行目的基因擴增時,通過調整反應條件,如提高鎂離子濃度、加入錳離子、改變體系中四種的dNTPs濃度或運用低保真度DNA聚合酶等,來改變擴增過程中的突變頻率,從而以一定的頻率向目的基因中隨機引入突變,獲得蛋白質分子的隨機突變體。其關鍵在於對合適突變頻率的選擇,突變頻率太高會導致絕大多數突變為有害突變,無法篩選到有益突變;突變頻率太低則會導致文庫中全是野生型群體。理想的鹼基置換率和易錯的最佳條件主要依賴於突變的DNA片段的長度。
通常,經一次突變的基因很難獲得滿意的結果,由此發展出 連續易錯 PCR(sequentialermr-PronePCR)策略。即將一次擴增得到的有益突變基因作為下一次擴增的模板,連續反覆地進行隨機誘變,使每一次擴增得到的正向突變累積而產生重要的有益突變。由於易錯PCR涉及的遺傳變化只發生在單一分子內部,故屬於無性進化 (asexualevolution)。它雖然可以有效的產生突變,且操作方法簡單,但其一般只適用較小的基因片段,且突變鹼基中轉換高於顛換,套用範圍較為有限。