腸易激綜合症
腸易激綜合徵是出現這些症狀時首先應考慮的一個最常見原因。腸易激綜合症是由小腸和結腸不能正常平滑收縮導致的疾病，通常與飲食有關。改變基本飲食模式往往能解決這一問題，如吃的更健康，晚飯早一點吃，選擇低鹽和刺激性小的天然食物等。建議吃包含活性菌的優酪乳和香蕉，這是兩種有促進大便穩定作用的食物。此外，對特定食品過敏反應也會導致腸易激綜合症。
藥物反應
一些藥物也會影響排便，如抗生素就容易帶來問題。儘管與抗生素有關的問題可以發生在一天中的任何時候，但以早上醒來後拉肚子最常見，因為身體內臟器官也是在這個時間開始變得活躍。在這個“重啟”階段，血液中徘徊一晚上的藥物往往造成最嚴重反應。
疾病
各種疾病也會導致早上排便問題，尤其以克羅恩氏病最顯著，這是一種影響結腸內襯的疾病。此外還包括結腸癌，結腸炎和大腸發炎這三種慢性疾病，症狀都包括早晨腹瀉。
細菌和病毒
吃腐爛食物引起的細菌或病毒感染有時也會誘發早晨腹瀉。標準的食物中毒和大腸桿菌通常是最常見原因。這類感染通常導致整天嘔吐和腹瀉，但在反應輕微或睡前吃了不好的東西時，也會只在早上腹瀉。
尋求幫助
找出問題根本原因並不是很容易，因為有許多潛在原因。最安全的方法是及時看醫生，他們首先會了解病人生活習慣，如飲食，壓力水平和鍛鍊模式等；有時候，僅僅改變生活習慣就能看到明顯改善。此外，醫生還可能根據情況要求病人採集大便樣本做化驗。
慢性早餐腹瀉的人還可能需要做結腸鏡透視。這種醫學檢查能觀察腸道內部的真實情況，對診斷結腸癌和克羅恩氏病等問題很有幫助。
