成立背景
2010年8月29日17時許，“打假鬥士”方舟子在其住所附近遭2名男子襲擊，面部被噴不明液體，腰部被鐵錘砸中後“破皮出血”。“鑒於方玄昌先生(《財經》編輯)、方是民先生(筆名方舟子)分別於2010年6月24日夜、2010年8月29日下午遭遇襲擊，科技打假人士的生命遭遇危險……”同年9月2日，彭劍在“新語絲”網站上刊登《通告》，以個人名義發起“科技打假基金”募集活動。截至2010年9月3日下午，賬戶已獲得累計3萬元左右的捐款。
“科技打假基金籌備組”目前有四位成員，都是目前國內著名的學術打假人士，包括中科院院士何祚庥、中國科普所原所長郭正誼、民間打假人士司馬南、中國醫學科學院院長助理袁鍾（後退出）。律師彭劍目前是該組織的事務秘書。
用途
募集到的款項將用於科技打假人士人身保護、相關線索懸賞等事務。這些資金不僅用於對方舟子、方玄昌的安全保障，還將其他科技打假人士列入待定保護名單，公示並商議通過後給予支持。
資金管理
“方舟子打假基金”賬目支出一直未公開和50多萬的安保費用成輿論焦點。負責管理打假資金募集小組的彭劍表示，打假資金募集小組是一個網路上的私募性質的組織，資金會接受內部監管小組的監督，監督小組成員由兩位人士組成，並希望有足以讓公眾信賴的註冊在北京的基金會能夠無償代管資金募集賬戶。
質疑
中國民間另一打假人士羅永浩提出質疑：
1.如果沒有註冊、沒有資質的公募基金，就可以到民政部門舉報。但方舟子的基金網站上這是由個人發起的捐贈行為，是“資金”而不是“基金”，所以在民政部門的舉報會有難度。不過也有律師指出，用於公益目的的資金，如打假是不能由個人發起和收受的，所以這個“資金”也是有問題的。
2.如果打假的錢不是公募基金，那大家捐錢的行為就是個人捐贈。但大家捐贈給了彭律師，彭律師又捐助給方舟子花，那兩次轉手都需要交很高的個人所得稅，我懷疑他們沒交稅，所以要去稅務部門舉報。
3.發起公募基金或者資金募集時發起人承諾過賬目會有監督，但現在方舟子和彭律師拒絕公布賬目明細，捐款人有理由據此懷疑方舟子和彭律師搞欺詐，那就可以報警處理。
