一、主要職責
（一）貫徹落實國家、自治區有關鄉鎮企業、農業產業化、農產品加工業的法律法規。研究提出鄉鎮企業、農業產業化、農產品加工業發展戰略和重大發展政策，負責編制鄉鎮企業、農業產業化、農產品加工業中長期發展規劃並組織實施。
（二）指導鄉鎮企業集聚和園區建設；加強指導休閒農業、旅遊農業等農村二、三產業發展，引導農村富餘勞動力向二、三產業轉移。
（三）發展農業產業化經營；負責國家和自治區級農業產業化重點龍頭企業評審、上報、認定和監測工作；負責農業產業化評價體系建設。
（四）促進農產品加工業結構升級，推進農產品精深加工業發展；引導農產品加工企業集中連片發展；負責農產品加工業研發中心、創業基地建設。
（五）指導鄉鎮企業、農業產業化、農產品加工業體制機制創新；引導企業發展外向型經濟，組織開展區域間、國際間經濟技術交流合作。
（六）指導有關鄉鎮企業、農業產業化、農產品加工業市場體系建設，指導企業名牌戰略實施、品牌創建和質量體系建設；會同有關部門為企業提供融資、技術、人才、信息、創業等服務工作。
（七）負責鄉鎮企業、農業產業化、農產品加工業信息化建設、統計調查和經濟運行分析工作。
（八）負責鄉鎮企業、農業產業化、農產品加工業項目管理、財政專項扶持資金、績效考核和項目庫建設等工作。
（九）指導鄉鎮企業、農業產業化重點龍頭企業、農產品加工企業職工教育培訓、職業技能鑑定、科技創新和信息化服務等工作；指導鄉鎮企業協會、農業產業化研究會工作。
（十）承辦自治區人民政府交辦的其他工作。
二、內設機構
根據上述職責，自治區鄉鎮企業局(自治區農業產業化發展局、自治區農產品加工局)設7個內設機構：
（一）辦公室
協助局領導組織綜合性政策調研，擬定鄉鎮企業、農業產業化和農產品加工工作重大政策；負責綜合協調機關政務、事務工作；負責會議組織、文秘檔案、機要保密、機關財務、後勤、新聞宣傳、信息信訪等工作。
（二）組織人事處
按照幹部管理許可權負責局機關及直屬單位幹部管理工作；負責局機關及直屬單位的人事管理、機構編制、勞動工資、社會保險以及外事等工作。
（三）鄉鎮企業處
研究擬定鄉鎮企業政策、編制發展規劃並組織實施；指導鄉鎮企業產業、產品結構調整和體制機制創新；指導鄉鎮企業聚集和園區建設；制定休閒農業、旅遊農業發展規劃並組織實施；參與農村二、三產業發展，協同有關部門制訂農村富餘勞動力向二、三產業轉移的規劃並組織實施；負責鄉鎮企業項目管理、績效考核和項目庫建設等工作。
（四）農業產業化發展處
研究擬定農業產業化經營政策、編制發展規劃並組織實施；指導農業產業化經營和機制創新；組織國家和自治區級農業產業化重點龍頭企業評審、上報、認定和監測工作；指導農業產業化經營組織、農民專業合作組織工作；負責農業產業化評價體系建設工作；負責農業產業化項目管理、績效考核和項目庫建設等工作。
（五）農產品加工處
研究擬定農產品加工業政策，編制發展規劃並組織實施；指導農產品加工企業產業、產品結構調整和體制機制創新；引導農產品加工企業集中連片發展，推進農產品精深加工業發展；負責農產品加工業研發中心、創業基地建設；負責農產品加工業項目管理、績效考核和項目庫建設等工作。
（六）規劃統計財務處
負責規劃統計財務政策研究；組織編制鄉鎮企業、農業產業化、農產品加工業發展規劃，並對規劃執行情況進行評估；負責統計調查、經濟運行分析和預警體系建設等工作；組織各業務處做好項目管理、財政專項扶持資金、績效考核和項目庫建設等工作；編報部門預決算並組織實施；指導機關、事業單位財務和內部審計工作。
（七）市場信息處（科技質量處）
研究擬定市場信息、科技質量政策，編制發展規劃並組織實施；指導企業開展區域間、國際間經濟技術交流合作，制定外向型經濟發展規劃並組織實施；負責市場信息項目管理、績效考核和項目庫建設等工作；指導鄉鎮企業、農業產業化、農產品加工業科技創新體系和質量體系建設；指導企業開展創名牌、創品牌工作；指導全系統信息化服務、教育培訓和職業技能鑑定工作。
機關黨委負責局機關及直屬單位的黨群工作。
監察室（與紀檢組合署辦公）負責局機關及直屬單位的紀律檢查和行政監察工作。
離退休幹部工作處負責局機關離退休幹部工作，指導直屬單位離退休幹部工作。
三、人員編制
自治區鄉鎮企業局（自治區農業產業化發展局、自治區農產品加工局）機關行政編制43名（含紀檢監察）；局領導職數5名（含紀檢組長），其中廳級領導職數2名；處級領導職數22名（含機關黨委專職副書記1名、離退休幹部工作處領導職數2名）。
