組織勢力
在官方設定的數碼世界裡，存在所有的軍團、勢力，或者說有的曾經存在，而在遊戲、動畫、漫畫中的數碼世界裡，多數情況下這些集團中的一個或多個都被設定為“不存在”。
皇家騎士團
指位於網路安全最高位，或被稱為網路守護神的13位聖騎士型數碼獸。
在預言書中登場，據說在數碼世界發生重大災難之時皇家騎士被預言引導而集結。不過，沒有絕對的“善”，他們為了維持數碼世界的持續如果判斷需要的話，通常會行使大量破壞和殺戮等無情手段。而且他們每個人的思想都微妙地有所差異，因為只按照各自所相信的“正義”而行動，所以圍繞著這個有時候會引起內部紛爭。
| 成員 | 首次登場 |
|---|---|
| 奧米加獸 |X抗體|茲瓦特 | 1999年 WS 陽級馴獸師 |
| 瑪格納獸 |X抗體 | 2000年 D-3 |
| 公爵獸 |深紅形態|X抗體 | 2001年 D-Ark |
| 杜納斯獸 |X抗體 | 2002年 D-Scanner |
| 劍皇獸 | 2002年 數碼怪獸卡片遊戲 |
| 聖輝V龍獸 |X抗體 | 2002年 搖擺機進步版 龍之怒吼 |
| 阿爾法獸 |王龍劍 | 2003年 數碼獸搖擺機X |
| 顱骨獸 | 2005年 數碼怪獸卡片遊戲 |
| 斯雷普獸 | 2005年 數碼獸加速器 究極基因 |
| 芳香獸 |獵豹形態|X抗體 | 2006年 數碼獸拯救者 |
| 艾可薩獸 | 2007年 數碼獸戰鬥終端 |
| 頑固獸 | 2013年 數碼獸大冒險 |
| 傑斯獸 | 2014年 數碼器 15周年紀念版 |
奧林匹斯十二主神
希臘神話中的奧林匹斯十二主神，用羅馬神話的通稱作為原型的究極體神人型數碼獸們，一般認為存在12尊。身姿像各自戴了什麼動物的面罩一樣。擁有與網路守護神“皇家騎士”相匹敵的能力，和皇家騎士們守護彼此的領地並且共存。在數碼世界發生的事變以中立的立場關注。 另外，據說黑暗的執行者普路托獸擁有與奧林匹斯十二神族相匹敵的力量。
| 成員 | 原型（羅馬名|希臘名） | 首次登場 |
|---|---|---|
| 朱庇特獸 |雷霆形態 | 朱庇特 | 宙斯 | 2013年 官網圖鑑 |
| 朱諾獸 |癔病形態 | 朱諾 | 赫拉 | 2014年 數碼獸收集者 |
| 尼普頓獸 | 尼普頓 | 波塞冬 | 2005年 數碼獸加速器 自然基因 |
| 刻瑞斯獸 | 刻瑞斯 | 得墨忒耳 | 2013年 數碼獸十字軍 |
| 巴克科斯獸 | 巴克科斯 | 狄俄倪索斯 | 2013年 數碼獸收集者 |
| 阿波羅獸 | 阿波羅 | 阿波羅 | 2007年 數碼獸傳說：日光&月光 |
| 黛安娜獸 | 黛安娜 | 阿耳忒彌斯 | 2007年 數碼獸傳說：日光&月光 |
| 墨丘利獸 | 墨丘利 | 赫耳墨斯 | 2005年 數碼獸加速器 自然基因 |
| 密涅瓦獸 | 梅爾瓦獸 | 密涅瓦 | 雅典娜 | 2005年 數碼怪獸卡片遊戲 |
| 瑪爾斯獸 | 瑪爾斯 | 阿瑞斯 | 2002年 數碼獸世界3 |
| 維納斯獸 | 維納斯 | 阿佛洛狄忒 | 2011年 數碼獸Jintrix |
| 伏爾坎獸 | 武爾坎努斯 | 赫淮斯托斯 | 2011年 數碼獸Jintrix |
三大天使·眾神軍團
三大天使以“天使等級”中的上三級為原型。是因為“神”而被分配給“神”的三個側翼的3位天使型究極體。還有以中三級、下三級為原型的數碼獸組成的眾神軍團。
| 成員 | 天使等級 | 首次登場 |
|---|---|---|
| 熾天使獸 | 熾天使 | 2000年4月 數碼怪獸卡片遊戲Starter 3 |
| 智天使獸 | 智天使 | 2000年7月 數碼獸大冒險02 |
| 座天使獸 | 座天使 | 2001年9月 數碼怪獸卡片遊戲Starter 6 |
| 成員 | 天使等級 | 首次登場 |
|---|---|---|
| 鑰匙天使獸 | 力天使 | 2005年 數碼獸世界X |
| 斬擊天使獸 | 能天使 | 2002年 數碼獸世界2 |
| 神聖天使獸 | 大天使 | 1998年 數碼獸大冒險 V馴獸師01 |
| 天女獸 | 大天使 | 1998年 數碼怪獸 Ver.S |
| 天使獸 | 天使 | 1997年 數碼怪獸 Ver.2 |
| 貞德獸 | 天使 | 2002年 數碼獸最前線 |
| 炎天使獸 | 天使 | 1999年 數碼獸世界 |
七大魔王
七大魔王是君臨惡魔·黑暗係數碼獸頂點的七位魔王型數碼獸。原型是“七宗罪”。因為各自分別獨立存在而稱王，所以關係一般，亦無共同行動的立場。
| 成員 | 罪 | 行星徽章 | 首次登場 |
|---|---|---|---|
| 光明獸 |墮落形態|幼蟲 | 傲慢 | 太陽 | 2002年 D-Scanner |
| 別西卜獸 |疾風形態|X抗體 | 貪食 | 金星 | 2001年 數碼獸馴獸師 |
| 利維坦獸 | 妒忌 | 水星 | 2003年 數碼怪獸卡片遊戲 |
| 莉莉絲獸 | 色慾 | 月亮 | 2002年 搖擺機進步版 末日軍團 |
| 究極魔獸 | 憤怒 | 火星 | 1999年 數碼獸大冒險V馴獸師01 |
| 巴魯巴獸 | 貪婪 | 木星 | 2003年 數碼怪獸卡片遊戲 |
| 貝爾菲獸 |睡眠形態|憤怒形態 | 懶惰 | 土星 | 2004年 數碼怪獸卡片遊戲 |
古代十鬥士
古代十鬥士是從“神聖的敵人（光明獸）”手中拯救古代數碼世界的自古就存在的十尊究極體數碼獸。首次登場於2002年數碼怪獸卡片系列。
| 成員 | 屬性 | 力量繼承者 |
|---|---|---|
| 古代暴龍獸 | 火 | 龍型數碼獸 |
| 古代加魯魯獸 | 光 | 獸型數碼獸 |
| 古代彩虹獸 | 風 | 鳥人型、妖精型數碼獸 |
| 古代甲蟲獸 | 雷 | 昆蟲型數碼獸 |
| 古代大懶獸 | 冰 | 哺乳型、冰雪型數碼獸 |
| 古代獅身人面獸 | 暗 | 魔獸型、幻獸型數碼獸 |
| 古代火山獸 | 土 | 礦石型、礦物型數碼獸 |
| 古代木馬獸 | 木 | 植物型數碼獸 |
| 古代人魚獸 | 水 | 水棲型數碼獸 |
| 古代賢者獸 | 鋼 | 突然變異型數碼獸 |
黃龍獸·四聖獸·十二神將
黃龍獸（ファンロンモン/Huanglongmon）是統治著守護數碼世界東西南北的四聖獸，鎮座中央掌管“大地（世界）”的皇帝數碼獸。擁有最高統治者身份的設定，卻在動畫『數碼獸合體戰爭』中淪為多盧比克獸胯下坐騎。
四聖獸（四聖獣，Four Holy Beasts）是守護數碼世界東西南北各個方位的四個究極體聖獸型數碼獸，他們擁閃耀的4隻眼和12個數碼核，擁有如神般的力量。
十二神將（十二神將/デーヴァ，Deva）是以乾支為原型的12個完全體數碼獸，他們為四聖獸服務。
以及立於他們頂點，掌管“大地（世界）”的黃龍獸（ファンロンモン，Huanglongmon），其擁有8隻眼和12個數碼核。
| 皇帝 | 四聖獸 | 座下帝魔 | ||
|---|---|---|---|---|
| 黃龍獸 | 玄武獸 （北） | 毗羯羅獸 (亥豬) | 宮毗羅獸 (子鼠) | 伐折羅獸 (醜牛) |
| 青龍獸 （東） | 迷企羅獸 (寅虎) | 安底羅獸 (卯兔) | 頞儞羅獸 (辰龍) | |
| 朱雀獸 （南） | 珊底羅獸 (巳蛇) | 因達羅獸 (午馬) | 波夷羅獸 (未羊) | |
| 白虎獸 （西） | 摩虎羅獸 (申猴) | 真達羅獸 (酉雞) | 招杜羅獸 (戌狗) | |
四大龍
在數碼世界最強的四隻龍數碼獸，據說他們擁有接近神的力量。一般認為不是軍團或組織而是來自周圍對他們的尊稱，不過因為在斬龍獸的官方介紹中提到了“四大龍的考驗（四大竜の試練）”而登場，所以他們作為某個組織進行活動的可能性還是有的。
| 成員 | 首次登場 |
|---|---|
| 聖龍獸 |X抗體 | 1998年 Digital Monster Ver.S |
| 神龍獸 |X抗體 | 1999年 數碼獸大冒險：陽極馴獸師 |
| 青龍獸 | 2000年 D-3 V-mon Version |
| 滅世魔龍獸 |X抗體 | 2001年 數碼獸馴獸師 |
番長
與強大的對手戰鬥內心沒有“屈折”並持續勝利的數碼獸才能獲得“番長”的稱號，數碼世界觀測史上，擁有這個稱號的數碼獸只有5尊被確認。
| 成員 | 因何原因獲得稱號 | 首次登場 |
|---|---|---|
| 番長獅子獸 | 貫徹自己的“正義” | 2005年3月數碼怪獸卡片遊戲 |
| 番長豆豆獸 | 以一己之力在不失去同伴的情況下將敵人擊退 | 2014年3月數碼獸收集者 |
| 番長百合獸 | 在弱肉強食的數碼世界懷有為弱者而戰的信念 | 2014年5月數碼獸收集者 |
| 番長刺釘獸 | 不許任何妥協的自尊心 | 2014年6月數碼獸收集者 |
| 番長魔像獸 | 無論對誰都十分嚴格不允許有一丁點兒驕縱 | 2014年7月數碼獸收集者 |
D-旅團
D-旅團由龍型改造數碼獸構成的機械化旅團，對絕不公開的機密任務而投入的特殊部隊。由世界樹幕後進行操控。
| 成員 | 職責 |
|---|---|
| 突擊龍獸 | 步兵 |
| 海豹龍獸 | 暗殺 |
| 坦克龍獸 | 暴徒鎮壓、強襲驅逐 |
| 暗龍獸 | 排除名為"BANT-TYO"的"目標" |
破解隊
由多名改造型數碼獸組成的神秘隊伍，與金屬帝國有關。混沌龍獸主要是破解隊的首領作為代理人使用的數碼獸。
| 成員 | 所處位置 | 首次登場 |
|---|---|---|
| 混沌龍獸 |X抗體 | 作為破解隊首領的代理人 | 2002年搖擺機 進步版| 2004年數碼怪獸卡片遊戲 |
| 無限龍獸 | 1999年數碼獸世界 | |
| 金屬巨龍獸 |X抗體 | 1998年數碼怪獸| 2003年數碼怪獸卡片遊戲 | |
| 百萬龍獸 | 1998年數碼怪獸 | |
| 金屬海龍獸 | 1998年搖擺機 | |
| 十億海龍獸 | 破解隊的制海權 | 2003年數碼怪獸卡片遊戲 |
| 槍龍獸 | 與無限龍獸處於相同的戰鬥位置 | 2014年數碼怪獸卡片遊戲 |
巨死星
巨死星（Big Death-Star，ビッグデスターズ）是由統帥著眾多數碼獸的將軍所構成的勢力。在動畫《數碼獸合體戰爭》中以巴格拉軍“死亡指揮官”的名義登場。
| 成員 | 所屬軍團 | 軍團數碼獸 |
|---|---|---|
| 新種吸血魔獸 | 月光軍團 | 不死型數碼獸 |
| 多盧比克獸 | 火烈軍團 | 龍型數碼獸 |
| 激流獸 | 水虎軍團 | 改造型數碼獸 |
| 扎米埃爾獸 | 木精軍團 | 妖精型、植物型數碼獸 |
| 奧列格獸 | 金賊軍團 | 水棲型、海獸型數碼獸 |
| 重力獸 | 土神軍團 | 神獸型數碼獸 |
三槍手
三槍手（三銃士 , Three Musketeers），是大多數數碼獸對槍龍獸、瑪格納基德獸、貝爾斯塔獸三個使槍的病 毒種究極體數碼獸的統稱。其中槍龍獸又從屬於神秘的改造型數碼獸組織“破解隊”。
| 成員 | 首次登場 |
|---|---|
| 瑪格納基德獸 | 2013年6月數碼獸十字軍 |
| 貝爾斯塔獸 | 2014年2月數碼怪獸卡片遊戲 |
| 槍龍獸 | 2014年2月數碼怪獸卡片遊戲 |
