動畫版簡介
數碼寶貝可是有一天，數碼世界出現了新的黑暗勢力，三大天使之一的基路比獸受到了來自光明獸的邪氣感染，很多數碼獸被基路比獸傳染而變得殘暴，不斷吞食數碼世界的數據。十個鬥士之魂，歸於三天使（究極天使獸、神聖天女獸和基路比獸），作為三大天使之一的基路比獸擁有了其中五個鬥士之魂（土、水、木、鋼、暗），並以此做出了五位邪惡鬥士。
一天，現實世界有許多孩子收到了來自數碼世界神聖天女獸的求救SMS，終選召出6位繼承了傳說中的鬥士（其中的輝一本是邪惡鬥士），踏入數碼世界。一開始，他們都不合群且以自我為中心，然而隨著劇情發展，他們都變得成熟。
途中與邪惡鬥士角力，後5位邪惡鬥士被逐一擊破，救出被黑暗操控的輝一，並打敗基路比獸。
然而基路比獸消滅後，黑暗勢力並未消散，6位鬥士發現了基路比獸被光明獸暗中利用，而基路比獸並不知情。光明獸派出劍皇獸和杜納斯獸兩位皇家騎士繼續收集數碼世界的數碼密碼，只要得到整個數碼世界的數據，光明獸便會復活。光明獸復活後，除了想要統治數碼世界外，還妄想侵略現實世界，最終被須佐之男獸消滅。
劇場版簡介
拓也他們到了數碼世界的一個浮起的島，這個島上的人型數碼寶貝和寶貝型數碼寶貝是完全對立的，人型的數碼寶貝幫助了拓也、友樹和純平，而寶貝型的數碼寶貝則協助輝二和泉，拓也和輝二竟就此打起上來，後來因其它數碼寶貝哭了起來而停此。人型的劍道獸，與獸型的小熊獸是好朋友，他們說起洞穴里有古代數碼獸，認為如果仍然存在，必定可解這個島。兩種型態再，拓也進化成炎龍獸，輝二進化成為野狼獸，欲阻止這場紛爭，但是......
本作設定
本季的設定又再度變更，主角們無搭檔直接進化成數碼獸，另外像是前作電影版中出現的列車是雙軌，而本作中大量出現單軌列車。
數碼文字也不是原來的文字系統，字比以前的簡單，以前的以長方形為主，本作則以圓形、三角形和正方形為主。
本季的CD出現了百張紀念碟，收錄四部八首主題曲的主角唱版，配音演員對角色的評論，還有全體數碼歌手唱曲《繼承勇氣的孩子們》。
本作對數碼系列的影回響該是前衛的人物設計了，聲優也是邀請的有名的聲優擔任。
在數碼世界的設計方面雖不及第三輯特別，但仍值得一提。特別的是整個數碼世界和數碼獸都是由條狀的數據組成，當它們消失時，這些數據便會流出來，並不像前作般碎開，但在劇場版中這個特徵並沒有出現。
而且數碼世界變得四通八達，有好幾個市集，出現了不少路人甲，而這些路人甲中有不少是曾在前作中是重要角色，如加魯魯獸、V仔獸、花仙獸、公爵獸、天使獸、超比多獸和哥瑪獸等，數不盡，也有不少是第二輯中沒有出現的裝甲體如變色龍獸、萬聖獸、塞匹克獸、蜜蜂獸等。
登場角色
主要角色
包括出場人物及同行者。
| 姓名：神原拓也 羅馬音：kanbaratakuya 年齡：11歲 暴龍機顏色：紅/黑 屬性：炎 掃描語：污穢邪惡的靈魂，讓我用數碼暴龍機淨化你吧。 聲優：竹內順子（日）、袁淑珍黃鳳英（劇場版）（港）、王瑞芹（台） |  |
| 姓名：源輝二 羅馬音：minamotokouji 年齡：11歲 暴龍機顏色：深藍/白 屬性：光 掃描語：活在黑暗之中的靈魂啊，接受神聖的光淨化你吧。 聲優：神谷浩史（日）、梁偉德（港）、詹雅菁（台） |  |
| 姓名：織本泉 羅馬音：orimotoizumi 年齡：11歲 暴龍機顏色：紫/粉紅 屬性：風 掃描語：乘著清爽的風，讓我用數碼暴龍機淨化你的心靈變得美麗純潔 聲優：石毛佐和（日）鄭麗麗（港）、謝佼娟（台） |  |
| 姓名：柴山純平 羅馬音：shibayamajunpei 年齡：12歲 暴龍機顏色：藍/黃 屬性：雷 掃描語：沾染邪惡的的靈魂啊，讓雷神來淨化你吧 聲優：天田真人（日）、陳卓智（港）、于正昇（台） |  |
| 姓名：冰見友樹 羅馬音：HimiTomoki 年齡：8歲 屬性：冰 暴龍機顏色：深藍/綠 掃描語:欺負別人是不可原諒的，讓我用堅定如凍的勇氣淨化你吧 聲優：渡邊久美子（日）、林元春（港）、雷碧文（台） |  |
| 姓名：木村輝一 羅馬音：Kimurakouichi 年齡：11歲 屬性：暗 暴龍機顏色：黑/灰 掃描語：混亂而邪惡的心靈，永遠在黑暗中沉睡下去吧，讓我用數碼暴龍機淨化你吧 聲優：鈴村健一（日）、蘇強文（港）、于正昇（台） |  |
十鬥士
炎系鬥士：火神獸、炎龍獸、火龍獸簡介：繼承著傳說中十鬥士"古代暴龍獸"的力量，炎之屬性的人型數碼獸。拓也進行魂進化的數碼獸。由於"電腦核（Digicore）"被稱為"魂之火"的聖焰包圍，可以自在的操縱火焰。使用東洋武術。光系鬥士：野狼獸、銀狼獸、戰狼獸
簡介：繼承傳說的十鬥士之一的光系鬥士“古代加魯魯獸”的力量，持有光之屬性的數碼獸。在光纜內生活，移動速度快。一旦發誓對某個人忠誠就絕不背叛。背中裝備著「翼之刃（wingblade）」。風系鬥士：仙女獸、風神獸
簡介：具有傳說十鬥士“古代彩虹獸”的力量，擁有風之能力的數碼獸。自由操縱大氣，擅長既讓敵人看到海市蜃樓，又製作出真空狀態「鐮鼬現象」的攻擊。
冰系鬥士：冰熊獸、巴撒獸
簡介;繼承了傳說中十鬥士"古代大懶獸"的力量，冰之屬性的人型數碼獸。是冰見友樹進化的數碼獸。生存知識豐富，自稱為"polar軍（極地軍）"極地區防衛部隊所屬的軍曹。裝備發射各種各樣雪球的發射裝置「Romeo（羅米歐）」。雷系鬥士：雷光獸、電光獸
簡介：柴山純平使用雷系獸型戰魂進化的姿態。具有傳說十鬥士的力量，擁有雷之能力的數碼獸。因為是參考在金字塔最內部所發現的聖甲蟲（scarab）寶庫的警備系統而製造，所以性格十分地小心謹慎。
土系鬥士：古洛頓獸、巨岩獸
簡介：基路比獸的手下。他是拓也等人最先遇到的鬥士，曾以人型的姿態打敗拓也等人，更曾搶去小泉及友樹的鬥士之魂。後來被打敗，獸型鬥士之魂被搶去。後來追逐眾人到了究極天使獸的城堡，被其重創，其後更被雷光獸消滅。在後期曾在創始村出現，與拓也等人對付皇家騎士。
木之鬥士：聖樹獸、花龍獸
簡介：基路比獸的手下。十分愛吃的鬥士，總是莫名其妙說奇奇怪怪的話。被輝二搶去獸型鬥士之魂後，黑暗系鬥士（輝一）認為沒有獸型鬥士之魂的聖樹獸，已無利用價值，故將其消滅。在後期曾在創始村出現，與拓也等人對付皇家騎士。
水系鬥士：娜娜獸、卡瑪拉獸
簡介：基路比獸的手下，擁有很多追求者的鬥士（但全都因為獸型鬥士之魂卡瑪拉獸的醜陋而離開她的冬粉俱樂部）。娜娜獸很可愛，但獸型形態卻是上人下章魚的樣子，而且很自戀。與泉是死敵，後來在魔彈獸體內被消滅。在後期曾在創始村出現，與拓也等人對付皇家騎士。
鋼系鬥士：銀鏡獸、魔彈獸
簡介：基路比獸的手下，戰鬥時常先冷靜再選擇合適的戰鬥方式去戰鬥的完美策略家。表面上他效忠基路比獸，實際上暗中打算利用究極天使獸的數據和拓也的數據，取代基路比獸，成為新數碼世界的統治者。後來他不惜犧牲自己的人型鬥士之魂，以魔彈獸姿態再度與拓也等人對戰，由於魔彈獸能拷貝並使用拓也等人的招式，必殺技對十數獸沒有效，令拓也等人再陷入苦戰，但在被後來拓也等人利用臨時想到的策略：合併絕招打敗了。在後期曾在創世村出現，與拓也等人對付皇家騎士。
黑暗系鬥士（邪）：暗黑獸、黑鷹獸
簡介：基路比獸的手下，因為其黑暗力量過於強，基路比獸才利用輝一，和其他邪惡鬥士不同，原身是人類，唯一被十鬥士等人打敗能變回原貌的邪惡鬥士。個性冷酷、不合群，其力量不遜其他四鬥士。初期曾在黑暗大陸和拓也等人對戰，亦是令拓也第一次因對感受到恐懼的數碼獸。後期為了解開輝二的謎團，多次主動挑戰輝二，為了壓制輝二的光明力量，更從基路比獸得到鬥士之魂力量，終被輝二打敗，其真正身份為輝一。
黑暗系鬥士（善）：黑獅獸、凱撒獅子獸
簡介：輝一被打敗後，找回了真正的暗之鬥士精神。解除黑暗後的真正姿態，絕不是帶來災禍的不詳姿態，“暗之鬥士之魂”的真正繼承者。
古代十鬥士
古代十鬥士分別為古代暴龍獸（炎）、古代加魯魯獸（光）、古代彩虹獸（風）、古代甲蟲獸（雷）、古代大懶獸（冰）、古代獅身人面獸（暗）、古代火山獸（土）、古代木馬獸（木）、古代人魚獸（水）、古代賢者獸（鋼）。三大天使
十鬥士打敗光明獸後，便把各自的鬥士之魂（人型，獸型各一個）交給了掌管數碼世界的三大天使——究極天使獸，神聖天女獸，基路比獸【其中究極天使獸有兩個（光，風），神聖天女獸有三個（火，雷，冰），基路比獸有五個（木，水，土，鋼，暗）】，然後傳說中的十鬥士就永遠沉睡了，數碼世界在三大天使的領導下經過了一段不算短的太平日子，然後基路比獸因意志不定，不理解究極天使獸和神聖天女獸的做法，受到光明獸的蠱惑發動叛亂，將究極天使獸打傷，使其沉睡。神聖天女獸為了保護究極天使獸，自願被基路比獸關起來，並呼喚沒有受基路比獸影響的地區的孩子前往數碼世界，這才有了這部《數碼獸無限地帶》
究極天使獸類型：究極體三大天使一的熾天使，高等級的天使型數碼寶貝
簡介：十鬥士沉睡後，擁有其中兩個鬥士之魂，並與其餘兩位天使數碼寶貝掌管數碼世界，負責法律和維持秩序。在基路比獸被邪氣感染後，更被基路比獸突襲打傷，自此被封印在自己的城堡里，一直受到冰巫師寶貝的保護囊守護。後來被拓也等人喚醒，可惜此時古洛頓獸等來襲，為保護拓也等人而被銀鏡獸暗算，慘遭自己的絕招反彈打敗，在拓也搶回本來屬於他的數據後，重新變回數碼蛋，分別為拓也及輝二創造雙魂進化，後以巴達獸的姿態轉生。銀鏡獸曾利用它的數據進化為【黑究極天使獸】
招式：
七星天堂：作出七個超熱光球，向敵人放射技。
聖約：以自己的生命為價引起宇宙爆炸，消滅對手奇蹟的終奧義。
神聖天女獸（聲優：深見梨加）
神聖天女獸介紹：在十鬥士沉睡後，擁有其中三個鬥士之魂，並與其餘兩位天使數碼獸掌管數碼世界，負責數碼世界愛的傳遞和生命傳承。在基路比獸被邪氣感染後，為使基路比獸不要傷害究極天使獸而自願被他囚禁。為了令數碼世界恢復和平，便向人類傳送求助，於是她選中了拓也等人，將拓也等人的手機變成“武裝暴龍機”便指引他們尋找鬥士之魂。後來被拓也等人救出，她很希望可以感化基路比獸，可惜失敗，唯有把他消滅。不過基路比獸的力量遠遠超乎她的想像，不敵反被其消滅。臨終將拓也、輝二的武裝暴龍機進行進化，令他們可以得到更強的力量。在故事後以成長期的小狗獸的姿態轉生。
招式：
神聖水晶：召喚十個水晶，撞擊對手技。
伊甸鏢槍：淨化邪噁心，導向樂園技。
基路比獸（聲優：大友龍三郎）
基路比獸介紹：本身性格善良而且擁有智慧，全身閃耀著白色的聖光，使有邪噁心的人無法正視他。在數碼世界中，在十鬥士沉睡後，與其餘兩位天使掌管數碼世界，負責掌握數碼世界的知識和道路。擁有五個鬥士之魂。與其餘兩個天使數碼寶貝意見不合，基路比獸認為他們不理會獸型數碼寶貝的利益。為了找出與基路比獸相處的方法，究級天使獸和神聖天女獸經常悄悄探討，可惜基路比獸以為他已被孤立。後來被光明獸使用邪氣感染了，大肆進攻人型數碼寶貝，還暗算打傷究極天使獸。但因太喜歡神聖天女獸，所以應她的請求，沒有殺死究極天使獸。後來，基路比獸把他守護的鬥士之魂變成邪惡鬥士，其指使他們去掠奪數碼世界的數據，後來被拓也等人一一打敗。不過基路比獸死後，他所收集的數據全被光明獸吸收了，這對後來光明獸的復活有很幫助。在故事後以成長期的黑大耳獸的姿態轉生。
招式：
天國裁決：從天空召喚多道雷電，範圍向對手落下。
閃電長矛：從手中召喚一支巨形的閃電狀長矛，猛力向敵人投擲。
其他角色
劍皇獸劍皇獸（聲優：置鮎龍太郎）
類型：聖騎士型，究極體，皇家騎士之一
統帥所有騎士獸的王，亦是“皇家騎士”之一的聖騎士型數碼獸。騎士領主獸衡量善惡的準則，是忠實自己所認為的“正義”，為此不擇手段。即便是“用力量支配”，如果能帶來一定的和平，騎士領主獸就能從中找到價值。進行任務時有著冷酷無情的一面，對弱者也毫無憐憫。必殺技是從鎧甲伸出四條帶刃斬切敵人的“迴旋華舞”，以及瞬間沖入對方懷中在零距離用右腕的衝擊錐擊出衝擊波的“急迫恐懼”。
武器：利用炸藥的爆炸力將內部的長槍衝出的近武器，被人稱為連格林機關槍見了都要哭著逃跑的粗魯攻城兵器。
杜納斯獸（聲優：三宅健太）
類型：聖騎士型，究極體，皇家騎士之一
登場：聖騎士“皇家騎士”之一，擁有飛龍的能力。在皇家騎士中是個特異的存在，忠誠心強烈，絕對服從與自己所認同的正義相符的主人。即使那是被稱呼為“惡”的存在，為了自己所認同的正義不惜捨棄生命。為此騎士道·武士道精神很強，是重視忠義，信義，禮儀的性格。龍一般強韌的力量，高純度時之數碼合金制的龍鎧，以這無雙的強度而自豪。必殺技是從雙手的手掌發射與十鬥士同樣屬性的能量彈“龍之怒吼”，和將全身能量變化為巨大飛龍靈氣的“飛龍之息”。
須佐之男獸
屬性：究極體、人型、疫苗種
絕招：八雷神天羽羽斬
簡介：〖須佐之男獸〗通常是由〖凱撒暴龍獸〗以及〖瑪格納加魯魯獸〗進化而誕生的神人型數碼獸。〖須佐之男獸〗的左手具有〖凱撒暴龍獸〗的力量，右手則具有〖瑪格納加魯魯獸〗的力量，同時，〖須作之男獸〗也是在網路系統出現異常時將其錯誤系統全部破壞，再構築從組新的系統的〖掌控破壞與再生神〗，持有著神器〖ZERO-ARMS蛇〗。在數碼獸第四部TV版中，〖須佐之男獸〗也是被選召的孩子們利用十鬥士所有的鬥士之魂進行〖遠古魂進化〗而成的數碼獸。
光明獸（台譯“六翅獸”）、光明獸墮落形態、光明獸撒旦形態、光明獸幼蟲形態
必殺技：宏偉十字架（GrandCross）：雙手展開宇宙空間並從中將9顆行星與1顆恆星直列為十字架放出，10顆超熱光球能引起所有災難同時發生，在一瞬間淨化世界，能給縱然是究極體數碼獸的對手帶來毀滅性的打擊。此技能在天使族中擁有著除同歸於盡的“遺言狀”以外最強大的威力。
簡介：以孩子般的身姿，制止了人形數碼獸和獸型數碼獸之間的鬥爭，被稱為“天賜之子”的神聖數碼獸，是這個世界的救世主。後逐漸變的專制，在超古代發動黑暗的戰爭，此後古代的十尊究極體十鬥士以生命為代價將光明獸封印於黑暗區域之中。他強大的善之力量被三大天使繼承。而他則等待時機復活，後來引誘三大天使之一的基路比獸墮落，使之為其收集數碼世界的資料。在三大天使殞命後，又招來皇家騎士劍皇獸、杜納斯獸繼續收集整個數碼世界的資料，最終得以復活。
數碼獸配音
| 數碼獸 | 日文配音 | 中文配音（台） | 粵語配音 |
|---|---|---|---|
| 十鬥士 | |||
| 火神獸 | 竹內順子 | 王瑞芹 | 袁淑珍（tv）、黃鳳英（劇場版） |
| 野狼獸 | 神谷浩史 | 詹雅菁 | 梁偉德 |
| 仙女獸 | 石毛佐和 | 謝佼娟 | 鄭麗麗 |
| 雷光獸 | 天田真人 | 于正昇 | 陳卓智 |
| 冰熊獸 | 渡邊久美子 | 雷碧文 | 林元春 |
| 黑獅獸（暗黑獸） | 鈴村健一 | 于正昇 | 蘇強文 |
| 古洛頓獸 | 西村朋紘 | 馮錦堂 | |
| 聖樹獸 | 乃村健次 | 陳永信 | |
| 娜娜獸 | 寺田春日 | 梁少霞 | |
| 銀鏡獸 | 增谷康紀 | ||
| 三大天使 | |||
| 究極天使獸 | 檜山修之 | ||
| 神聖天女獸 | 深見梨加 | ||
| 基路比獸 | 大友龍三郎 | ||
| 皇家騎士 | |||
| 劍皇獸 | 置鮎龍太郎 | ||
| 杜納斯獸 | 三宅健太 | ||
| boss | |||
| 光明獸 | 西原久美子（普通形態）、中尾隆聖（墮落形態） | ||
專有術語
D-Scanner數碼終端機（台譯“武裝暴龍機”）
數碼機的一種，功能有掃描並數碼寶貝圖鑑、儲存數碼暴龍的數據、儲存鬥士之魂、傳遞信息（與神聖天女獸）、與其他數碼終端機通訊
通過鬥士之魂可以進行魂進化
Spirit
鬥士之魂（台譯“鬥士精神”）
它們是傳說的十鬥士打敗光明獸後消失後留下的精神與力量的結晶
每個鬥士有兩個魂，一個是人型鬥士之魂，另一個是獸型鬥士之魂
Trailmon
機車獸
數碼世界裡的交通工具，也是主角們來往數碼世界和現實世界的工具，外型似單軌火車
各話目錄
| 話數 | 日文標題 | 中文標題 | 收視率 |
|---|---|---|---|
| 1 | 伝說の闘士！ 炎のアグニモン | 傳說中的鬥士！炎之火神獸登場 | 10.3% |
| 2 | 光のヴォルフモン 下迷宮の戦い! | 光之野狼獸 地下迷宮之戰！ | 9.5% |
| 3 | いじめは許さない! 氷のチャックモン進化 | 不許欺負他人！冰之冰熊獸進化 | 9.6% |
| 4 | 私のキックは痛いわよ! 女闘士フェアリモン | 我的飛腿很痛的喔！女鬥士仙女獸 | 8.5% |
| 5 | を揺るがす雷パワー ブリッツモン! | 搖動大地的雷之力量，電光獸！ | 8.7% |
| 6 | 伝說の五闘士VS新たなる闘士！ | 傳說中的5鬥士VS新的鬥士！ | 9.9% |
| 7 | 空に浮かぶ街！ トイアグモンのおもちゃの國 | 漂浮在空中的小鎮！玩具亞古獸的玩具之國 | 8.8% |
| 8 | みんなをえ! 進化するんだツノモン | 救出大家！進化吧獨角獸！ | 8.3% |
| 9 | 敵はチャックモン!? 謎のテレビの森 | 敵人是冰熊獸！？謎之電視森林 | 9.2% |
| 10 | ビーストスピリットは制御不能！? ガルムモン進化！ | 獸型鬥士之魂無法控制！？銀狼獸進化！ | 8.5% |
| 11 | 俺を倒せ! 伝說の闘士ヴリトラモン暴走 | 打倒我吧！傳說中的鬥士炎龍獸暴走 | 8.3% |
| 12 | ほえろヴリトラモン! 倒せギガスモン! | 咆哮吧炎龍獸！打倒巨岩獸！ | 7.8% |
| 13 | 目覚めよセラフィモン! 十闘士の秘密 | 覺醒吧究極天使獸！十鬥士的秘密 | 9.5% |
| 14 | 雷よ! 岩をも砕け! ボルグモン決死のチャレンジ | 雷啊！擊碎岩石吧！雷光獸決死的挑戰 | 8.3% |
| 15 | イカしたビースト進化！ カルマーラモン | 異常的魂進化！卡瑪拉獸 | 7.0% |
| 16 | 強いだけじゃだめなのよ! 美しき闘士シューツモン | 只靠強大是不夠的！美麗的鬥士風神獸 | 7.2% |
| 17 | ブリザーモン 吹けよ雪、呼べよ氷河！ | 暴雪獸！吹襲吧，雪花；呼喚吧，冰河 | 6.6% |
| 18 | チキチキ! トレイルモン猛レース | 轟隆轟隆！機車獸猛烈的競賽 | 6.2% |
| 19 | バーガモンをえ! 友樹のピュアな心 | 拯救漢堡獸！友樹純真的心 | 5.8% |
| 20 | 闇にひそむ謎の闘士ダスクモン! | 潛藏在黑暗中的謎之鬥士！昏暗獸 | 7.2% |
| 21 | 五闘士全滅！? 恐るべき闇のパワー! | 五鬥士全軍覆沒！？恐怖·的黑暗力量！ | 8.2% |
| 22 | 我が家へ! 拓也たった一人の帰還 | 回到我的家！拓也獨自一人的返還 | 7.2% |
| 23 | 感じろデジモンの力！ 拓也渾身の作戦 | 感受數碼獸的力量吧！拓也全力的作戰 | 7.4% |
| 24 | 対決ボルケーモン! 純平、過去との激闘 | 對決火山獸！純平、與過去的激鬥 | 6.6% |
| 25 | 友樹の孤獨な戦い アシュラモンの罠 | 友樹的孤軍奮戰！阿修羅獸的陷阱 | 5.6% |
| 26 | ラーナモンの執念！ 女デジモン一騎撃ち | 娜娜獸的執著！女性數碼獸一對一的較量 | 7.9% |
| 27 | 奇蹟のダブルスピリット! ベオウルフモン誕生 | 奇蹟的雙魂進化！戰狼獸誕生 | 7.2% |
| 28 | 拓也の融進化 アルダモン技炸裂！ | 拓也的融合進化！火神獸的爆裂技 | 6.3% |
| 29 | 逃走！ 変幻自在セフィロトモン | 逃走！變化自如的魔彈獸 | 5.4% |
| 30 | 飛翔！ 闇の闘士ベルグモン | 飛翔！暗之鬥士黑鷹獸 | 4.7% |
| 31 | 闇に眠るトレイルモンの墓場 | 沉睡在黑暗中 機車獸的墳墓 | 6.8% |
| 32 | 明かされた過去！ ダスクモンの秘密 | 被揭曉的過去！昏暗獸的秘密 | 5.1% |
| 33 | 新たなる闇の闘士！ レーベモン&カイザーレオモン | 全新的暗之鬥士！黑獅獸與凱撒獅子獸 | 7.6% |
| 34 | 決戦！ バラの明星 オファニモン出作戦 | 決戰！玫瑰之明星 神聖天女獸救出作戰 | 6.9% |
| 35 | スピリットを一つに! 拓也と輝二の究極進化 | 鬥士之魂合而為一！拓也和輝二的究極進化 | 6.6% |
| 36 | 勝利への飛翔！ 対決ケルビモンの城 | 通往勝利的飛翔！對決基路比獸之城 | 6.2% |
| 37 | 決戦！ 命あるり デジタルワールドを取り戻せ | 決戰！只要還有生命 就要奪回數碼世界 | 7.4% |
| 38 | 終わらない死闘！ ルーチェモン復活の序曲 | 沒有終結的死斗！光明獸復活的序曲 | 5.0% |
| 39 | これがデジタルワールド!? 月からの脫出 | 這就是數碼世界！？從月球的脫離 | 5.4% |
| 40 | 選ばれし者！? エンジェモンを操る少年！ | 被選召的孩子？操控天使獸的少年 | 6.6% |
| 41 | スキャンさせるな! 友情の豆の木 | 別讓他掃描！友情的豆之樹 | 5.9% |
| 42 | デジタマを守れ! 消えゆく命の奇蹟 | 保護數碼蛋！消失生命的奇蹟 | 7.2% |
| 43 | 故郷（ふるさと）消滅！ 獄の使者スカルサタモン | 故鄉消失！地獄使者喪屍撒旦獸 | 7.0% |
| 44 | 共に戦え! ゴツモンと輝二の誓い | 並肩作戰！礦石獸與輝二的誓言 | 6.6% |
| 45 | データかく亂作戦！ アキバマーケットを防衛せよ | 數據攪亂作戰！防衛秋葉市場吧 | 5.7% |
| 46 | デジタルワールド消滅！? ルーチェモン暗黒支配 | 數碼世界毀滅！？光明獸支配黑暗 | 7.6% |
| 47 | ロイヤルナイツ散る そして…!! | 皇家騎士陣亡 隨後。..... | 6.3% |
| 48 | 光と闇を一つに! 輝一後の願い | 光與暗合而為一！輝一最後的心愿 | 6.0% |
| 49 | 戦えスサノオモン ルーチェモン人間界到達！! | 戰鬥吧須作之男獸！光明獸到達人類世界！！ | 5.2% |
| 50 | 時を越えて! 新たな伝說の始まり | 超越時空！新傳說的開始 | 6.6% |
分集劇情
第1集 傳說中的鬥士，炎系火神獸 （傳說中的鬥士！炎之火神獸）
神原拓也，在他弟弟的生日那天，突然接到一個神秘的信息，讓他在17點45分到自由之丘車站搭車到涉谷，在車上又收到請在涉谷站搭地下鐵的信息。在坐電梯時，拓也見到了一個十分冷酷的男孩。而這時發生了奇怪的事情，電梯竟一直下到很深的地下！電梯打開時，面前是一個車站。拓也上了車後，發現又有3個人在同一輛車上。他們分別是柴山純平、織本泉和冰見友樹。列車到站後，4人已經來到了數碼世界。突然，沙路比獸出現到處破壞。突然拓也發現了傳說中的炎系鬥士精神，並與鬥士精神合為一體，用“武裝進化”進化成傳說中的十鬥士代表炎系的火神獸，將沙路比獸打敗並將其的黑暗靈魂淨化。然而，退化回來的拓也卻不知道發生了什麼事。
第2集 光系野狼獸，地下迷宮之戰（光之野狼獸 地下迷宮之戰！）
拓也放出打敗沙路比獸的數碼密碼使消失的大地復原，而拓也見到的那個名叫源輝二的冷酷男孩也來到了數碼世界。波高獸和問答獸告訴他們數碼世界正被基路比獸破壞。純平想和友樹回現實世界，於是用朱古力作誘餌來問柏古獸回去的方法。卻被一大群柏古獸追著要朱古力而掉下一地下迷宮。此時輝二和拓也、小泉也分別進入地下迷宮。輝二見到被柏古獸們纏住的純平和友樹，就上前打敗了柏古獸，但其中一隻柏古獸卻進化成爛泥獸。拓也此時趕到，進化成火神獸與爛泥獸戰鬥，卻突然就變回來了。但這時輝二突然遇到他的代表光系鬥士精神，進化成野狼獸，將爛泥獸打敗。然後輝二就獨自離去了。
第3集 忍無可忍！冰系冰熊獸進化（不許欺負他人！冰之冰熊獸進化！）
純平和友樹決定不回數碼世界而和大家一起。拓也又接到信息要去森林終點站。他們在某個地方見到有關十鬥士的記號和光明獸的圖樣，並聽波哥獸說了有關十鬥士和光明獸的傳說。突然許多蠟燭獸出現，原來這是蠟燭獸的村莊。波哥獸告訴蠟燭獸拓也得到了十鬥士之魂，於是蠟燭獸請大家接受招待。沒想到這是陷阱，蠟燭獸立即攻擊眾人。拓也讓眾人逃走，自己進化反擊。然而蠟燭獸不怕火系攻擊，火神獸反而被困住。這時友樹奮不顧身去救火神獸，突然冰之魂飛了出來，友樹立即進化成冰熊獸。但一隻蠟燭獸進化成巫師獸，並用分身法迷惑火神獸。冰熊獸提醒火神獸看影子，終於打敗了巫師獸。眾人又繼續上路了。
第4集 不要小看我！女鬥士仙女獸（我的飛腿很痛喔！女鬥士仙女獸）
拓也他們在前進路上遇到岔路，拓也、友樹和泉、純平分別走一邊。泉、純平來到了風景蕭條的微風村，見到了輝二，但他又立即離開了。兩人遇到花拉獸，得知微風村以前是觀光勝地。於是兩人打算美化這個村以使其重新回到以前的樣子。然而蘑菇獸三兄弟突然出來搗亂，並追打純平。這時風之魂飛了出來，純平以為是他的鬥士魂而十分高興，然而這個魂卻不是他的而是泉的……泉進化成仙女獸，打敗蘑菇獸三兄弟。然而它們卻合在一起進化成朽木獸，將仙女獸打退化。這時輝二趕到，進化成狼獸終於打敗了朽木獸。他將黑暗靈魂淨化後，蘑菇獸三兄弟變回正常。輝二將數碼編碼放出，微風村變回原來那樣美麗，隨後他又離開了。拓也和友樹因為路不通而折回來，而純平為只有他不能進化而沮喪。
第5集 震撼大地的力量，電光獸（動搖打的的雷之力量 電光獸！）
眾人來到株式會社風工場，打算進去參觀一下。工場的主要員工是機甲蟲獸，而野人獸則是監督。大家參觀完後來到機甲蟲獸的生活區，得知機甲蟲獸們是被迫勞動的。於是大家決定幫機甲蟲獸們脫離這個魔窟。但是純平因為沒有魂可以進化而很傷心。夜裡，拓也等三人進化開始行動。仙女獸在門口引誘敵人，火神獸和冰熊獸以及機甲蟲獸們則去破壞中樞部。然而等待大家的是場長螳螂獸和一大堆野人獸。拓也他們被打敗。這時純平終於忍不住衝進工場中樞部。而這時純平終於發現了屬於他的雷之魂，進化成電光獸，非常酷地打敗了螳螂獸。同時中樞部被破壞，機甲蟲獸們自由了。
第6集 傳說的五鬥士對決新鬥士（傳說中的五鬥士vs新鬥士！）
眾人沒有錢但是又很餓，於是決定打工。他們見到蝸牛獸，聽說村里來了個古洛頓獸，抓走了村子裡的女孩來威脅它們說出山裡的數碼編碼。他們跟隨蝸牛獸來到它們居住的山，見到輝二，決定聯手去救那些女孩。純平說出大家是傳說中的鬥士，結果蝸牛獸臉色大變。晚上，當眾人醒來時，發現被蝸牛獸綁住，想用五人來交換人質。原來古洛頓獸也是傳說中的十鬥士之一，但是卻是屬於邪惡的十鬥士。澄清事實後，眾人進化與古洛頓獸戰鬥，終於救出人質並打敗古洛頓獸。沒想到古洛頓獸突然變成了巨岩獸，實力大增。它打敗眾人並吸收了山的數碼編碼，使整座山消失了。
第7集 空中城堡，黑積木獸的玩具王國（漂浮在空中的小鎮！玩具亞古獸的玩具之國！）
眾人分散了。拓也、輝二和友樹來到空中玩具王國，友樹對這裡的玩具很感興趣。而拓也和輝二為了對待小孩子的問題而吵起來。這時眾人見到熊仔獸，為了不被它纏住來玩而躲開。突然，邪惡熊仔獸出現抓走友樹，並用心碎攻擊使拓也和輝二覺得很傷心，接機逃走。拓也和輝二追到城堡處，但不慎掉入護城河，幸好一隻叫熊貓獸的數碼獸救了兩人，告訴大家黑積木獸被基路比獸變得邪惡。兩人進入城堡，默契地打敗了眾黑積木獸，並將它們的邪惡靈魂淨化。兩人來到城堡頂部，發現原來友樹只是跟熊仔獸玩遊戲機而已……最後黑積木獸帶三人離開玩具王國。
第8集 救出所有人，進化吧，獨角獸（救出大家！進化吧獨角獸）
眾人在草原穿行時見到仙人掌獸——數碼獸國小的教師，於是決定去數碼獸國小參觀。在國小里除了獨角獸以外的學生都排斥它。泉因為是義大利回來的所以很寂寞而很同情它。純平希望幫它交到朋友，反而受到反效果。獨角獸不小心掉到河裡，泉為了救它也掉到河裡，獨角獸進化成加布獸救了純平。兩人了解到獨角獸因為可以進化而被同學所恐懼。這時下起大雨，河水泛濫而有沖走學校的危險。兩人進化阻止流水，但是一個卡普利獸不小心被沖走，情況危急。這時純平和泉鼓勵獨角獸去救它，獨角獸終於下定決心進化救下了卡普利獸。經過這次事件，大家終於接受了獨角獸。隨後，在兩人離開草原的途中，與拓也等三人合流了。
第9集 冰熊獸是敵人嗎！？神秘的電視森林（敵人是冰熊獸！？迷之電視森林）
眾人決定在森林裡野營，大家找了些肉食蘋果來吃。在烤食物時，大家討論了有關洞穴獸使用的獸型鬥士之魂，得知每個十鬥士有兩種鬥士魂。大家在吃東西時，月亮被雲遮住時，森林暗了下來，在樹幹上突然發出光來，放出現實世界的影象，但一會兒又消失了。友樹在睡覺時做惡夢，夢到眾人欺負他，於是突然攻擊眾人，並進化成查庫獸不斷追擊眾人。拓也和輝二在逃走時發現一直躲在暗處觀察眾人的食夢獸，於是兩人進化，由輝二抵擋查庫獸，拓也攻擊食夢獸。拓也被食夢獸的技能困住而做惡夢，但立即醒悟過來並明白查庫獸也做了同樣的夢。拓也立即打敗食夢獸並淨化了它的黑暗靈魂，友樹終於恢復神智。為了道歉，食夢獸幫大家做了個愉快的夢。在大家睡覺時，輝二突然接到有關獸型鬥士魂的信息……
第10集 獸型鬥士是不能控制的嗎！？銀狼獸進化（獸型鬥士之魂無法控制！？銀狼獸進化！）
眾人醒來發現輝二、波高獸和問答獸不見了，得知他們先走了，於是眾人也上路。輝二等見到一隻礦石獸，然後發現洞穴獸在礦石獸的村莊破壞。輝二進化與巨岩獸戰鬥，卻被打敗。礦石獸救了輝二，輝二更從而得知鬥士魂就在附近。此時洞穴獸遇到拓也等人，進化成巨岩獸打敗眾人並搶走泉的魂。輝二此時趕到將洞穴獸引到鬥士魂所在處但被打退化。礦石獸保護輝二完成預言，使傳說中的光之獸型之魂出現。輝二用獸型魂進化成獸型的伽路姆獸，然而輝二卻完全控制不了獸型魂，但其野性還是使其暫時擊退巨岩獸，隨後退化了。
第11集 打倒我吧！炎系炎龍獸失控！（打倒我吧！傳說中的鬥士炎龍獸暴走）
洞穴獸為了打敗小朋友們，召喚了高樂獸……眾人因為意見有分歧，波高獸就帶大家去找薩滿獸占卜。但是在占卜的途中，洞穴獸帶著高樂獸殺到，並困住輝二不讓他進化。眾人進化迎戰，很辛苦地打敗高樂獸。但此時洞穴獸再次進化出擊，搶走了友樹的魂。就在此時，一隻神秘的數碼獸突然出現，以壓倒性強力打敗巨岩獸。原來這是薩滿獸被炎之獸型魂所困而產生的，它請求拓也幫它解脫。於是阿古尼獸打敗那隻數碼獸並且與獸型魂融合而滑行進化成維托拉獸。然而，拓也同樣反而被獸型魂控制了而發狂。輝二隻好進化成伽路姆獸與閃電戰獸迎戰，到底結果會如何呢……
第12集 發威吧！炎龍獸！打倒巨岩獸！（咆哮吧炎龍獸！打倒巨岩獸！）
維托拉獸野性爆發而不斷攻擊同伴以及到處破壞。友樹奮不顧身地上前，對拓也說出自己的心聲，終於使拓也平靜下來，並成功退化。正當大家在森林中繼續前進時，不小心中了洞穴獸的陷阱，除拓也和友樹外其他人都不能動。拓也因為恐懼維托拉獸而只進化成阿古尼獸，但被巨岩獸打敗而退化。拓也為了救出被巨岩獸抓住的友樹，戰勝恐懼進化成維托拉獸，打敗巨岩獸。此時巨岩獸現出擁有的四個魂，維托拉獸拿走土的獸型魂和凍的人型魂，正想去拿風的人型魂時，卻被洞穴獸逃走了。雖然孩子們取得了勝利，但是新的敵人也即將出現了……
第13集 醒醒吧究級天使獸！十鬥士的秘密（覺醒吧究級天使獸！十鬥士的秘密）
眾人終於來到森林終點站，在數碼掃描器的指引下一直來到了一個城堡處。眾人在城堡里遇到巫術獸，由它帶領到沉睡著的三大天使之一的塞拉菲獸的房間。此時眾人也得知一直指引大家的是另外一個屬於三個天使的奧法尼獸。集合了數碼掃描器的光，使塞拉菲獸甦醒。大家在塞拉菲獸口裡得知整個事件的原因。此時，洞穴獸帶著它的同伴，另外的四個惡之鬥士的其中三個闖入。塞拉菲獸擁有壓倒性的力量，但是惡之鬥士瞄準眾人攻擊分散塞拉菲獸的注意力，最終將塞拉菲獸打敗並吸收了它的數碼編碼，塞拉菲獸變成了數碼蛋。泉衝過去搶走數碼蛋，然後巫術獸犧牲自己保護眾小朋友們離開。懷著悲憤的心情，眾人乘火車離開了……
第14集 轟碎岩石吧，雷光獸決死的挑戰（雷啊！擊碎岩石吧！雷光獸的決死挑戰！）
波高獸決定做塞拉菲獸變成的蛋的媽媽。眾人下了火車後，來到了一個封閉的山洞。這時在山洞裡的水池裡噴出水流打傷純平和友樹，原來那是鯨獸。眾人讓其安靜下來，得知它是因為洞穴獸的破壞而掉到這狹小的水池裡所以很難受。此時洞穴獸和代表木的邪惡鬥士樹獸趕到。洞穴獸變出很多高樂獸來攻擊眾人。純平為了保護眾人以及拿回泉的魂，與友樹一起忍住重傷進化戰鬥。然而很快被打敗而退化，這時樹獸更進化成獸型花瓣龍獸，戰況十分不利。這時鯨獸出來幫忙，更帶來不小心吞進肚子的雷之獸型魂。純平立即進化成獸型的雷光獸，將洞穴獸打敗並將它的數碼編碼掃描，奪去它的人型魂和泉的魂。這時山洞崩塌，幸好鯨獸帶大家來到了外面的大海。
第15集 娜娜獸變成大烏賊了！卡馬拉獸！（異性的獸型進化！烏賊獸）
代表水的邪惡鬥士娜娜獸因為還沒有找到她的獸型魂而惱怒。眾人來到一個只有夏天的小島。而娜娜獸的影迷俱樂部的會員犀鳥獸發現眾小朋友，於是假裝開辦度假屋，想趁孩子們在海上的時候偷走他們的數碼掃描器。然後在他們偷走男孩們準備偷泉的時候，泉還沒換衣服，這時泉聽到動靜，以為有人偷看她。這時大家發現犀鳥獸全部不見了，從而發現數碼掃描器被拿走了。正在大家追趕犀鳥獸時，拉娜獸突然出現。只有泉沒有被偷走數碼掃描器而進化迎戰。在戰鬥中，娜娜獸突然有感覺，潛入海底找到了自己的獸型魂，進化成極其醜陋的烏賊獸。這進化一下使犀鳥獸們喪失對它的喜愛而決定退出俱樂部……幸虧它還未控制好獸型魂而飄走了，眾人逃過一劫。但是這時眾人才發現犀鳥獸已經跑掉了……
第16集 美麗的女鬥士 風神獸！（只靠強大是不夠的喔！美麗的鬥士風神獸）
眾人發現犀鳥獸向另一個小島前進。拓也和泉打算去追趕時卻被哥瑪獸阻止。眾人得知那個島原來是哥瑪獸所住的島，它們一次出去購物時突然出現鏇渦使它們無法回去。泉打算幫哥瑪獸回到小島，於是眾人造船打算去消除鏇渦。然而在鏇渦附近大家又碰到娜娜獸。小泉進化迎戰卻被打進鏇渦而退化。而此時泉發現海底里隱藏著她的風之獸型魂，於是泉立即進化成獸型的風神獸。然而娜娜獸進化成烏賊獸，向其他人攻擊以引開休簇獸的注意而見其抓住。眾人於是不斷說烏賊獸壞話使風神獸脫身。烏賊獸氣急敗壞地再次發動猛攻，然而又再次控制不住身體而再次飛走……因為鏇渦消失，哥瑪獸們又能團聚了。在哥瑪獸的指引下，眾人向犀鳥獸所去的秋葉市場進發。
第17集 巴撒獸 吹吧 大雪！呼嘯吧 冰河！（暴雪獸！吹襲吧雪花呼喚吧冰河）
眾人來到北方的秋葉市場，到處尋找他們的數碼掃描器。友樹來到分子獸的商店，幫它打贏遊戲得到獎品。隨後友樹發現了分子獸店裡有眾人的數碼掃描器，但分子獸不相信數碼掃描器是大家的，只讓友樹找貴重物品來交換。友樹找不到大家，反而碰到犀鳥獸。在被友樹追趕的時候，犀鳥獸掉到河裡。友樹救了犀鳥獸，它們卻忘恩負義拿走了原本用數碼掃描器換來的攝影機。這時樹獸搶走了犀鳥獸的攝影機，來到分子獸的店裡，要用攝影機交換數碼掃描器。分子獸從攝影機里看到友樹救犀鳥獸的情景，明白友樹是誠實的，就把數碼掃描器還給眾人，並把剛才打遊戲的獎品——冰之獸型魂放進掃描器里。友樹立即進化成暴雪獸，在阿古尼獸和狼獸的幫助下打敗花瓣龍獸。此時，奧法尼獸通過數碼掃描器讓眾人去薔薇的明星，眾人用泉在吃東西比賽中獲得的車票乘火車向更險惡的目標前進！
第18集 陸上電車大賽（轟隆轟隆！機車獸猛烈的競賽）
眾人來到一個鎮，那裡正舉辦一年一度的運輸獸比賽，由一隻運輸獸配一個搭檔比賽。泉聽到比賽獎品與漢堡包有關，於是決定眾人一起比賽，但是對手是強敵狼人伽魯魯獸（黑）與狗獸的組合。在比賽過程中，狼人伽魯魯獸（黑）和狗獸不斷耍奸計，使比賽不能公平舉行。眾人一一破解它們的奸計，但也一一退出。最終，拓也和它的搭檔率先衝過終點，取得勝利。正當泉高興的時候，才得知獎品是可以受到漢堡村的招待而不是漢堡包……
第19集 拯救漢堡獸！友樹真心的心（拯救漢堡獸吧！友樹純真的心）
眾人來到漢堡村，得知漢堡店店長被許多變色龍獸抓走，要他們今天晚上做好吃的漢堡包來交換，於是決定幫漢堡獸做漢堡。眾人做好後，由波高獸和提問獸來品嘗。雖然拓也和輝二說得很好聽，但兩人做的超難吃。但兩人十分不服氣，還要繼續再做……此時已是晚上，其他三人帶著友樹做的漢堡包來到外面，因為友樹做的漢堡包很好吃，三人被變色龍獸帶到一城堡處。三人見到漢堡獸店長，店長吃了友樹做的漢堡包，大加讚賞。三人進化救出被抓走的漢堡獸店長的孩子並打敗變色龍獸。此時花瓣龍獸出現，三人才得知原來主使是花瓣龍獸。漢堡獸店長把加工後的漢堡包給花瓣龍獸吃，使它吃飽而睡著了。漢堡獸一家終於團聚了。
第20集 隱藏在黑暗中的鬥士 暗黑獸！（潛藏在黑暗中的迷之鬥士！昏暗獸）
水、木、鋼之惡鬥士被凱路比獸召見。凱路比獸道出鋼之惡鬥士水銀獸隱瞞了塞拉菲獸的資料而使其很惱怒。眾人來到黑暗大陸，不安的預感籠罩整塊大陸……眾人遇到性行溫和的蝙蝠獸，但是樹獸卻立即出現吸收了蝙蝠獸的數據並進化成花瓣龍獸襲擊眾人。眾人進化成獸型迎戰，但是花瓣龍獸吃掉森林道理的樹木而變得巨大，實力大增，還能自我恢復，五獸對它毫無辦法。但眾獸團結起來，封鎖花瓣龍獸的攻擊並用合技將其打倒，最終將搶去木之獸型魂。此時最後一個惡鬥士——代表暗的黃昏獸出現了，出乎眾人的意料，它竟然一劍將樹獸殺死然後面對眾獸，一場惡戰即將開始！
第21集 全軍覆沒！？可怕的黑暗力量（五鬥士全軍覆沒！？恐怖的黑暗力量！）
黃昏獸擁有不可思議的戰鬥力，眾人根本沒有辦法傷到它，只好逃走。拓也認為大家一定能打敗黃昏獸，但輝二認為這根本不可能，而應該先逃到安全的地方。拓也想出一起攻擊的戰略，但被輝二所斥責。輝二和拓也兩人來到一個地方單獨談，輝二告訴拓也黃昏獸的實力根本還沒發揮出來，但拓也堅信大家一定能打贏。這時黃昏獸殺到，眾人只能用拓也的戰略迎戰。但是無論如何攻擊，即使是四隻獸型同時攻擊，也傷不了黃昏獸，反而被它吸收了攻擊力。此時黃昏獸向阿古尼獸攻擊，伽路姆獸奮力抵擋下這招而退化。拓也痛苦地叫出輝二的名字，這時黃昏獸突然舉動異常，發出黑暗力量……拓也醒來時，面前是暗之車站。已完全絕望的他坐上了通往現實世界的暗之運輸獸……
第22集 回家！拓也獨自一人回到現實世界（回到我家！拓也獨自一人的返還）
暗之運輸獸到站時，已經是拓也剛開始搭車到數碼世界的車站。就在這時，拓也眼前出現黃昏獸的幻象……等拓也乘電梯上到2樓的電車站時，被眾人用奇怪的目光看著，才發現自己變成人不像人獸不像獸的樣子。拓也來到家外，發現他又回到自己出發去數碼世界的一天。這時，他看到屋裡的自己收到信息趕去車站。他的意識希望不要發生之前的事而打算阻止他自己。在電車上，他發現一個和輝二很像但不是輝二的少年。到站後，那個少年沒能趕上輝二和拓也的電梯而打算下樓梯，卻失足摔下樓梯，躺在地下卻仍叫著“輝……輝二”。到了車站處了，拓也打算用最後一次機會阻止自己，但此時他卻看到了一直和他一起戰鬥的同伴們都上了電車，掛念同伴的心終於使他改變決定，鼓勵他自己上了電車。隨後，黃昏獸的幻象再次出現，拓也此時終於找回信心，一拳將幻影打散……接著，暗之運輸獸再次出現，拓也毫不猶豫地決定坐上運輸獸！——信心十足的阿古尼獸走出運輸獸，他回到了數碼世界了！
第23集 感受數碼寶貝的力量！拓也使出渾身解數（感受數碼獸的力量吧！拓也全力的作戰）
泉、純平和友樹被拉娜獸和水銀獸抓起，數碼掃描器也被奪去。此時身受重傷的輝二發現眾人但不敢輕易出戰。阿古尼獸從塞皮庫獸處得知拉娜獸和水銀獸的去處，立即趕去。拉娜獸準備殺死純平，迫使輝二出戰。但是水銀獸和烏賊獸的實力很強，野狼獸被打倒。此時火神獸趕到，並且感受到了大自然的力量。在大自然的力量的幫助下，火神獸救出眾人，並一起以比以前強大幾倍的力量打退卡馬拉獸和銀鏡獸。然而，正當大家為重聚而歡喜的時候，銀鏡獸又有了更可怕的計畫……
第24集 對決火山獸！純平與過去的決鬥（對決火山獸！純平與過去的激鬥）
眾人繼續向玫瑰明星前進。然而，突然一陣風吹過，眾人被吸到一個古怪的東西里。眾人正在觀察時純平突然被從牆山伸出的一隻手推到一個類似眼睛的東西處，來到了另外一個空間。突然火山獸出現攻擊純平，而且不斷地對純平說其他人的壞話，想離間他和其他人的感情。純平奮力打倒火山獸，但是心仍不能平靜。此時突然出現了閃電戰獸的影子，說出純平以前是靠東西來交換朋友的，並弄出其他四人的假象不斷說純平的壞話。純平不敵閃電戰獸的影子，被打退化。關鍵時刻，真正的四人闖了進來，給了純平莫大的信心，他進化成雷光獸，終於打敗了自己的影子，通過了這一空間。然而此時大家又被出現的手分別推到了另外五個空間裡。
第25集 友樹孤軍奮戰！阿修羅獸的陷阱（友樹的孤軍奮戰！阿修羅獸的陷阱）
原來把眾人困住的是鋼鬥士的獸型魔彈獸。友樹突然遭到神秘數碼獸的攻擊，但突然又有一神秘的全身被包住的叫做阿修羅獸的數碼獸出現，救下友樹，並稱是他的朋友。與此同時，輝二遭到可以解讀思想的天狗獸攻擊，並說出他很害怕擁有朋友的事。但輝二還是以速度制勝將其打倒。另一方面，友樹被阿修羅獸所逼迫時，想起哥哥斥責他的話，明白阿修羅獸幫助他其實是為了自己。這時阿修羅獸現出原形，原來它正是一開始攻擊他的數碼獸。友樹終於明白哥哥以前總說他很任性，會交不到朋友的話是關心他而不是氣他。友樹進化打倒阿修羅獸，帶著對哥哥的重新認識，從塞菲羅托獸的身體裡出來了。
第26集 娜娜獸的執著！女性數碼寶貝之戰！（娜娜獸的執著！女性數碼獸一對一較量）
魔彈獸共有十個空間，分別代表十種屬性。泉在所在的空間裡被娜娜獸影迷俱樂部的蜜蜂獸們盯住，打算抓住她。誰知道每一次的陷阱都反而把自己困住而要仙女獸來救。另一方面，拓也打敗鸚鵡獸通過了一個空間，而且純平也打敗了樹靈獸而逃出了魔彈獸。娜娜獸命令蜜蜂獸給泉吃，泉吃下後眼前出現幻影，看見醜陋的自己，想起以前一次郊遊中，認識了一個朋友，本來約好晚上一起吃飯，卻因為那個學生的同學排斥她而使那個學生無奈地失約，泉為此十分地恨那個學生。娜娜獸說泉的壞話，但泉反而被激起渴望變強的意志，進化與娜娜獸決鬥。本來蜜蜂獸為卡馬拉獸加油，但是風神獸在占下風時仍堅持不懈的意志感動了蜜蜂獸使它們決定轉為泉的影迷。泉於是努力將卡馬拉獸打倒並將它的兩個魂都拿走，然後也離開了魔彈獸的身體。現在只剩下四個空間和輝二、拓也兩人了……
第27集 奇蹟的雙重鬥士精神 戰狼獸的誕生！（奇蹟的雙魂進化！戰狼獸誕生）
純平、泉和友樹想再進入塞菲羅托獸幫助輝二和拓也，卻無法突破保護罩。而此時黃昏獸突然出現，突破防護罩進入輝二所在的區域。泉立即聯絡拓也，告訴他有關塞菲羅托獸以及黃昏獸的事。黃昏獸抓住輝二讀他的記憶，得知輝二的生母已死，他爸爸再娶一妻。但輝二仍想念生母而不願叫繼母媽媽。輝二來數碼世界那天是爸爸和繼母結婚三周年紀念日，輝二於是去買花送給繼母並打算叫她媽媽。黃昏獸得知這些後突然覺得很痛苦，輝二立即進化與它戰鬥。然而由於實力相差太遠，輝二很快就倒在黃昏獸的劍下。拓也通過了冰區域的試煉，本可以離開塞菲羅托獸，卻因為擔心輝二而放棄離開。就在黃昏獸準備殺死輝二時，塞拉菲獸的蛋突然發出光芒籠罩住輝二。輝二感受到人型魂和獸型魂的力量合而為一，雙魂進化成貝歐渥魯夫獸，與黃昏獸展開激烈的戰鬥。然而在戰鬥中，輝二見到了黃昏獸的姿態里出現了一個跟自己長得很像的男孩的影子。這時由於勢均力敵，就在阿古尼獸趕到的瞬間，貝歐渥魯夫獸和黃昏獸同時離開了塞菲羅托獸的身體。
第28集 拓也的融合進化，火龍獸！（拓也的融合進化！對偶神獸的爆裂技）
阿古尼獸來到第九個區域，驚異地發現水銀獸竟然可以和塞菲羅托獸同時存在。水銀獸利用能自由進出立在區域裡的無數鏡子以及反射招式的能力，使阿古尼獸雖然竭盡全力卻無法傷它。水銀獸想將這次戰鬥當成它事先所構想的戲劇，於是進入另一個區域，並釋放了先前被它吸收的塞拉菲獸的資料，與之融合成與塞拉菲獸模樣相似的墮落天使。即使是維托拉獸也被輕易地打敗。純平等三人看不下去而拚命想衝破防護罩，但墮落天使的魔爪已經抓住了拓也的頭……此時塞拉菲獸的蛋再次發出金光，使拓也雙魂進化成阿路達獸，終於將塞拉菲獸的數據掃描回來了。而數據突然從終端器里放出到蛋里。阿路達獸追到鋼之區域，放出大火球融化所有金屬，並一拳粉碎了水銀獸的身軀將其掃描，隨後也離開了塞菲羅托獸的身體。而此時塞拉菲獸的蛋也終於生出了巴達獸！
第29集 逃走！變幻自在的魔彈獸（逃走！變化自如的十數獸）
正當拓也等人準備出發找輝二時，塞菲羅托獸突然動了起來。原來鋼鬥士將眾人吸進身體裡的真正目的是為了通過戰鬥讀取眾獸的招式的資料。現在，塞菲羅托獸不但可以任意使用十鬥士的招式，當受到他們的招式攻擊時，還能使其無效並加倍反彈。大家在毫無勝算的情況下，只好逃走，卻逃到一個黑暗的封閉的洞穴。在塞菲羅托獸的言語挑撥下，開始自亂陣腳，並內訌起來。危急時刻，阿路達獸大聲告訴大家他們擁有數碼獸的能力，而且擁有團結的力量。大家找回信心，將必殺技合併起來成為新的招式，終於打破塞菲羅托獸完美的防禦。阿路達獸擊中塞菲羅托獸的心臟部位並將其掃描。現在惡之五鬥士只剩下黃昏獸一個。
第30集 飛翔！黑暗鬥士黑鷹獸（飛翔！暗之鬥士黑鷹獸）
貝歐渥魯夫獸不斷追趕黃昏獸，並與之展開激烈的戰鬥。此時拓也等人在巴達獸的指引下去尋找輝二，卻被前方飛來的類似鋼條的東西困住，即使進化一起攻擊居然都無法使其粉碎。而此時，一個黑影正在注視著光與暗的決鬥。突然，黃昏獸占了上風，正當它準備殺掉貝歐渥魯夫獸時，突然猶豫了一下，反而被制住。此時黑影突然出手攻擊貝歐渥魯夫獸，原來它就是凱魯比獸！它讓黃昏獸回想剛來數碼世界時的情景，使其內心再次充滿黑暗，進化成貝魯格獸。此時拓也等在巴達獸的提示下挖地道逃出了困獄，感受到了貝魯格獸的鳴叫聲的恐怖。貝魯格獸的實力更加厲害，恐怖的招式差點使輝二喪命。正當它準備殺掉輝二時，輝二的終端器里突然射出光，奧法尼獸的聲音讓貝魯格獸想想它生活在人類世界的事。這使它再次變得痛苦並離開了。“難道它是人類？”輝二的疑惑即將解開了！
第31集 沉睡黑暗之中 機車獸墳場！（沉睡在黑暗中 機車獸的墳墓）
眾人找到輝二，正準備前去薔薇明星，輝二卻因為要解開心中的疑惑而又離開了。拓也只好去追他，讓其他三人留在這裡。純平非常不滿這種做法，於是和泉與友樹一起去蒐集情報。三人來到一個很恐怖的地方，看到一輛破爛不堪倒在地上的運輸獸，得知這裡是運輸獸的墓地。為了從它口裡得到有關薔薇明星的情報，三人儘量滿足它的無理要求。當三人終於受不了而決定不管時，運輸獸說出非常感激對它這么好的三人，使三人非常感動。最後，運輸獸全身都開始松落，正當大家為它的死而感到難過時，卻驚異地發現它只是蛻掉了外殼，等於得到了新生……為了報答三人，運輸獸決定幫助他們去薔薇明星，並告訴他們惡之鬥士曾經讓它幫忙將奧法尼獸運送到薔薇明星外的城堡里去……
第32集 事情的真相 暗黑獸的秘密！（被揭曉的過去！昏暗獸的秘密）
黃昏獸想起輝二就是自己的弟弟，於是質問凱路比獸。凱路比獸讓他去憎恨輝二，再次使其心裡充滿黑暗力量。在巴達獸指引下，波高獸和提問獸與拓也會合併跟著巴達獸去找輝二。此時輝二遭到貝魯格獸的突襲。貝魯格獸又變回黃昏獸，告訴輝二他就是輝二的雙胞胎哥哥木村輝一，而後更將貝歐渥魯夫獸打退化並再次進化成貝魯格獸打算致輝二於死地。拓也及時趕到救下輝二並聽到這個驚異的真相。他鼓勵輝二去拯救輝一，但輝二無法與輝一戰鬥。拓也只好一人與貝魯格獸戰鬥，但處於下風。看到努力的阿路達獸，輝二終於下定決心進化成貝歐渥魯夫獸，與阿路達獸同心協心打敗貝魯格獸並將兩個暗之魂掃描。這時拓也發現，輝一就是他在回到現實世界時看到的那個人……
第33集 全新的黑暗鬥士！黑獅獸與凱撒獅子獸（全新的暗之鬥士！黑獅獸與凱撒獅子獸）
輝二從輝一的口中知道了他是在臨死的奶奶口中得知輝二，還知道了生母的工作很辛苦。還有就是輝一是從樓梯上摔下後醒來就到了數碼世界，而不是坐地下的運輸獸來的。眾人會合後坐運輸獸前往薔薇明星外的城堡。但因為事情的真相很令人驚訝，氣氛很沉悶。於是拓也等人就向輝二說出自己對於兄弟姐妹的感受，而巴達獸也去安慰輝一。此時，凱路比獸突然出現攻擊眾人。即使阿路達獸與貝歐渥魯夫獸的必殺技也對它不起任何作用！凱路比獸然後使出“天堂裁決”將全部人打退化。它告訴輝一他心裡的黑暗面很強，希望他能再次回到它手下，但輝一堅決地拒絕了它。危急時刻，輝一的數碼終端器出現，暗之魂的形態更變化了。輝一進化成雷貝獸，以極有力的招式攻擊凱路比獸。沒有等凱路比獸有喘氣的機會，獸進化成凱撒獅子獸，以凌厲的連續攻擊打敗了凱路比獸。然而數碼編碼並沒有出現，原來那只是凱路比獸的分身而已。為了解救奧法尼獸，眾人繼續向薔薇明星外的城堡進發。
第34集 拯救神聖天女獸（決戰！玫瑰之明星 神聖天女獸大作戰）
眾人來到城堡入口處，遭到幻影獸的攻擊。除了雷貝獸外的其他獸被斗篷收入了水晶球。危急關頭，雷貝獸靠敏銳的覺察力打破了水晶球並掃描了幻影獸。眾人繼續前進，來到了一個有著許多漂浮資料的房間。突然那些資料里出現黑影並向眾人伸出黑爪。突然出現了鈴鐺的聲音，黑爪就不動了。山羊獸出現並帶眾人來到囚禁奧法尼獸的地方。奧法尼獸向大家詳細地說明了造成數碼世界的危機的經過。此時凱路比獸出現並說出它的真正目的：奪取十鬥士之魂並與它收集的大量資料融合來支配數碼世界！
第35集 兩魂合一！拓也與輝二的究極進化
凱路比獸打算回收所有的十鬥士之魂，阿路達獸與貝歐渥魯夫獸將其帶到城外戰鬥，讓其他獸想辦法救出奧法尼獸。城外，阿路達獸與貝歐渥魯夫獸的實力遠低於凱路比獸，被打退化並奪去了數碼終端器。而純平想出打碎反射光的牆壁的辦法來消除光之牢籠。就在他們快要救出奧法尼獸時，凱路比獸返回並將純平、友樹和輝一的數碼終端器奪走。正當它準備奪走泉的終端器時，奧法尼獸衝出來擋住了攻擊。奧法尼獸嘗試淨化凱路比獸但失敗了，只好利用凱路比獸對她的愛拿回數碼終端器，交給孩子們。然後，奧法尼獸用最後的力量，犧牲自己使拓也和輝二的數碼終端器產生變化，並提示他們要將十鬥士之魂融合起來。眾人在十鬥士之魂的幫助下，終於成功使拓也和輝二超越魂進化成凱撒暴龍獸和馬格納伽魯魯獸！
第36集 往勝利的飛翔！對決基路比獸之城
凱撒暴龍獸和馬格納伽魯魯獸經過奮戰打退了凱路比獸，但同時城堡也塌了。輝一不小心從城堡上掉下去，幸好馬格納伽魯魯獸及時救了他。在退化後，泉等人的魂又回到了各自的數碼終端器里。在泉的鼓勵下，輝一打算向輝二道謝。但此時突然從地下冒出冰柱攻擊眾人。原來是從地下監獄逃脫的冰惡魔獸，是個比凱路比獸更難對付的恐怖數碼獸。它封住了拓也和輝二的數碼終端器，使他們不能進化。而仙女獸等的實力與其相差甚遠。冰惡魔獸更不斷地折磨眾人，最終惹惱了凱撒獅子獸。在他的奮力攻擊下，拓也和輝二脫困，暴雪獸救出了休簇獸和雷光獸，集合四獸的力量終於打敗了冰惡魔獸。此時，在上空出現了凱路比獸真正的所在之處。
第37集 決戰！生命極限，取回數碼世界！
拓也和輝二來到上空與凱路比獸決戰。打鬥十分激烈，但由於拓也和輝二的配合非常默契，凱路比獸正中威力無比的炎龍擊。正當兩人以為打敗了凱路比獸時，卻驚異地見到凱路比獸擁有自我復原能力。而凱路比獸更使用蒐集來的數碼世界的資料使實力大增，凱撒暴龍獸和馬格納伽魯魯獸被打得無還手之力。後來，馬格納伽魯魯獸發現了凱路比獸藏在額頭裡的資料是打敗它的關鍵，於是利用自己的身作盾牌擋住凱路比獸的攻擊，讓凱撒暴龍獸去接近凱路比獸……馬格納伽魯魯獸倒下了：“去吧，拓也！”憤怒的拓也將鬥志燃燒成火焰，一擊命中凱路比獸的額頭，並將其掃描了。然而正當大家歡慶勝利時，真正的陰謀才開始露角……
第38集 沒完沒了的戰鬥！六翅獸復活的序曲
大家正在高興時輝二察覺到消失的大地並沒有因為凱路比獸被打倒而復原，此時遠處的山更被掃描了！大家趕過去後，發現一隻叫巴羅獸的數碼獸。大家進化後他得知眾人是繼承十鬥士魂的孩子們，於是帶大家參觀數碼世界的歷史。眾人進一步了解到古代十鬥士將光明獸封印的歷史，並得知了從頭到尾都是光明獸在搗鬼，使凱路比獸變邪惡到處吸取資料，並奪走了凱路比獸被擊敗後放出的資料以求解開封印而復活。此時該地區的資料也受到了威脅。原來光明獸派出了手下的皇家騎士——丟納斯獸和領主騎士獸到處吸收資料。為了保護數碼世界，眾人進化與皇家騎士戰鬥。沒想到皇家騎士的實力超乎想像，連凱撒暴龍獸與馬格納伽魯魯獸也被輕易打敗。巴羅獸為保護眾人而犧牲，而皇家騎士並不罷手，丟納斯獸用極恐怖的一招將眾人打上了天空……
第39集 這裡是數碼寶貝世界嗎！？遠離月球！
輝一醒來後發現大家來到了一個神秘的地方，並為自己沒有任何傷而疑惑。眾人見到了一些數碼獸，得知受到皇家騎士的攻擊，大家被空間扭曲帶到了數碼世界的三個月亮的其中一個。在月亮見到數碼世界的資料不斷減少，大家都很著急。大家想了許多方法回去，卻被圍繞“地球”的一條電磁場阻止。後來，聽漢堡獸說以前他們的同類移居到“地球”時是在另外兩個月亮重疊後的瞬間順著電磁場做到的。於是大家找到一個火箭，製作了一個巨大彈弓，在準確的時刻彈向地球。沒想到在通過電磁場後，卻撞上了小行星群，失去動力而漂浮在太空中。幸好這時火箭落到一條鐵軌上，在運輸獸的幫助下回到了“地球”。
第40集 被選中的人！？操縱天使獸的少年！
大家來到了鋼之區域，卻突遭人馬獸的攻擊。此時眾人眼前突然出現另外四個孩子。那四個孩子指揮天使獸打跑了人馬獸。戰後，友樹發現其中兩個孩子就是常欺負他的鐵平和勝春。大家跟他們交談後，得知當時有許多孩子來到數碼世界，但只有拓也等6人繼承了十鬥士之魂，奧法尼獸就讓其他人在森林車站回數碼世界。但這4個孩子不想回去，奧法尼獸只好讓天使獸保護他們的安全。四人不但不聽拓也等人讓他們回去的勸告，還勸拓也等人回去。此時人馬獸帶了大批半人馬獸來復仇，天使獸以一敵眾，沒有占優勢。而此時另外一些半人馬獸則攻擊鐵平等人，友樹奮力救下鐵平，並與拓也等人一起進化打敗敵人。鐵平和勝春明白到只有友樹等人才能可以守護數碼世界，便決定回現實世界。然而此時皇家騎士突然出現，殺死天使獸並抓走了勝春等4人以及友樹……
第41集 不準掃瞄！友情的豆豆樹
皇家騎士將5人帶到豆樹村，想逼他們說出“鑰匙”的位置。眾人見到被關起來的豆獸和豆獸長老。友樹得知聖春等人曾經來過這裡，豆獸們用僅存的豆來招待他們。為了報答，四人就在離開前在村里種下了種子，沒想到今天長出了高聳入雲的豆樹，並鎖住了這塊土地的數據。所以皇家騎士要找到鑰匙來奪取資料。領主騎士獸用掃描勝春的資料來威脅豆獸們，而拓也等人及時坐運輸獸趕到，並進化與皇家騎士戰鬥。經過激烈的戰鬥，拓也和輝二再次敗在皇家騎士手下，豆獸長老只好說出鑰匙的位置。這塊土地也被皇家騎士吸收了。勝春等四人離開了數碼世界。
第42集 保護數碼蛋！失去生命的奇蹟
眾人來到創始村，見到了許多數碼蛋以及守護數碼蛋的天鵝獸，並幫助天鵝獸照顧嬰兒。眾人得知原來負責運送嬰兒的運輸獸們都躲起來了，就去勸說他們再次幫忙。勸說失敗後大家返回創始村，卻發現皇家騎士已經來到村里，並打傷了天鵝獸。為保護數碼蛋，拓也和輝二進化拖延時間讓大家運走數碼蛋。然而皇家騎士十分強大，過了一會兒兩人就倒下了。皇家騎士把拓也和輝二帶走了。把他們綁在牆上，使勁鞭打他們，使他們退化了。這時，友樹他們趕到了，趕走了皇家騎士，救了他們，為他們治傷。
第43集 故鄉被滅！地獄使者喪屍撒旦獸
眾人趕到火焰村，目睹旁邊的森林被掃描而憤怒不已。在聽了數碼獸們的指責後，拓也等人決心一定要守護這個村。不久，兩隻喪屍撒旦獸來到這裡打算掃描火焰村，拓也和輝二進化打敗它們。但沒想到又出現了一隻喪屍撒旦獸，敵人靠三打二占據了優勢並得知了資料的位置。該村的居民數碼獸終於忍不住而團結起來攻擊喪屍撒旦獸，保護了資料，拓也和輝二趁機奮力全殲喪屍撒旦獸。正當大家高興時，領主騎士獸突然出現並輕鬆地奪走了火焰村的資料，離開了……
第44集 共同戰鬥！礦石獸和輝二的誓盟
眾人及時趕到救下被皇家騎士的手下騎士獸攻擊的礦石獸，但該地區的資料還是被領主騎士獸吸收。聽皇家騎士說還有三個區域——森林之國、冰雪之國和光明之國，眾人於是立即趕往森林之國。礦石獸非要跟著去，要幫助大家。輝二了解它的性格，於是答應帶他們去。在森林之國，皇家騎士帶著大批騎士獸進攻塞拉菲獸的宮殿，但是卻突破不了防護罩，於是皇家騎士去找其他突破口，留下騎士獸看守宮殿入口。眾人也兵分兩路，由輝二和礦石獸對付騎士獸，拓也等人去追皇家騎士。拓也等人突然聽到召喚，進入了宮殿，發現了該區域的資料。此時防護罩被突破，而拓也等人則發現是已死的巫術獸召喚他們並保護他們。另一方面，騎士獸可以使自己破碎的身體重新組合，使馬格納伽魯魯獸和礦石獸陷入苦戰，而領主騎士獸更返回並打敗馬格納伽魯魯獸。礦石獸為自己無法幫忙而自責，進化成完全體隕石獸來幫忙，但還是被領主騎士獸打退化。另一方面，凱撒暴龍獸與丟納斯獸戰鬥，卻不慎被其奪走數據，於是皇家騎士撤退。礦石獸為了不成為累贅，決定離開眾人的隊伍。
第45集 擾亂資料戰術！守衛秋葉市場
眾人先行到達包括秋葉市場的冰雪之國作戰鬥準備並送走這裡的數碼獸。但塞皮庫獸從它的回力鏢發現有許多數碼獸在皇家騎士前來的路上阻擋它們。於是拓也和輝二立即進化衝去戰場，而其他人則在做好的雪球發射器準備好援護拓也和輝二。實力相當強勁的數碼獸們都完全不是皇家騎士的對手，紛紛被打敗。拓也和輝二在眾人的援護下跟皇家騎士展開激戰。戰鬥中眾人不慎遭到攻擊，輝一再次為只有自己沒受傷而疑惑，領主騎士獸就說他只有靈魂沒有肉體。此時，凱撒暴龍獸在與丟納斯獸的戰鬥中占上風，領主騎士獸只好前去幫忙。就在拓也和輝二就快打敗皇家騎士時，丟納斯獸把打散的資料重組好，吸收了數據並與領主騎士獸撤退。
第46集 數碼世界被滅！？光明獸暗黑支配
眾人來到最後的區域——奧法尼獸的宮殿，並見到守護該宮殿的尼菲迪獸。宮殿里有無數的藏書，為了在皇家騎士之前找到鑰匙，大家分頭去翻書，度過了最後一個安寧的晚上，而輝二發現輝一總是精神恍惚的樣子……到了第二天，眾人仍一無所獲，而皇家騎士也在此時趕到，並說出尼菲迪獸就是鑰匙。拓也和輝二進化與皇家騎士死斗，不分勝負。正在打得最激烈時，光明獸突然發出光芒使拓也和輝二倒下，而皇家騎士也成功吸收了最後一塊區域的資料。光明獸復活，數碼世界消滅！？當光明獸出現在大家面前時，大家都很吃驚。光明獸竟然是一個天使型的可愛小孩。光明獸要對眾人趕盡殺絕，幸好運輸獸及時出現將眾人送到了月亮。
第47集 打敗皇家騎士之後
大家來到了金黃色的月亮上，為數碼世界的完全消滅而沮喪。這時，大家發現原來運輸獸們把數碼蛋運到了月球上，並且另外兩個三大天使也重生了。於是大家再次振作起來決心打敗光明獸奪回數碼世界。這時，光明獸以殺死孩子們作為賜給通往人類世界的鑰匙的最後條件，讓皇家騎士到月球上去。凱撒暴龍獸與馬格納伽魯魯獸與皇家騎士進行決戰，終於打敗了皇家騎士。正當兩獸準備掃描皇家騎士時，光明獸出現並掃描了皇家騎士，並且進化成為墮落形態。在墮落形態極為恐怖的攻擊下，拓也和輝二被輕易打敗，而金黃色的月亮也隨之毀滅。
第48集 光暗一體！輝一最後的願望
眾人在三大天使的成長期的幫助下又集結起來，並商量“光和暗合而為一”的事。此時，他們發現從已毀滅的數碼世界處鋪出一條通路，而通路的盡頭處就是現實世界！為了阻止光明獸到現實世界，大家決定做最後的死斗！但是，光明獸墮落形態的實力驚人的強大，沒多久除了輝一外其他人都被打退化了。正當光明獸準備對眾人痛下殺手時輝一奮力救出眾人，自己卻陷入光明獸恐怖的攻擊中。輝一指出能使光和暗合而為一的不是光明獸後被攻擊打得只剩下靈魂了……他將暗之魂交給輝二對眾人表示了感謝，最後，說出自己其實已經死了……光明獸吸收了輝一的資料，憤怒的拓也和輝二將所有的魂都集合起來，“古代魂進化”成為兩人合為一體，集合十鬥士的魂的力量的須佐之男獸！
第49集 戰鬥吧金剛武神獸，六翅獸到達人類世界！
須佐之男獸向光明獸墮落形態發起挑戰，但對手真的很強，須佐之男獸處於下風。不過後來拓也和輝二發揮了十鬥士之魂的真正力量，破解了光明獸的招式，以天羽斬將光明獸打敗，並掃描了它的資料。奇怪的是，居然出現了兩個數碼蛋，白的那顆漂走後，黑的那顆突然巨大化並變成了一條可怕的黑龍，原來那是光明獸撒旦形態！光明獸撒旦形態立即進入通往現實世界的道路，並且不斷向現實世界發出恐嚇的信息。眾人進化尾隨，發現他們到了涉谷的地下運輸獸車站。眾人為了保護自己的世界和數碼世界，用盡全力攻擊，卻一點效果也沒有，反而被光明獸撒旦形態一回頭噴出火焰而打中……
第50集 超越時空！新傳說開始
眾人被打回地下車站並退化。拓也打算再進化，被輝二阻止。拓也為自己的力量微弱而難過，此時奇蹟出現了，火神獸的魂出現在拓也身後，並幫其將眼前的電梯推倒，然後告訴拓也這就是“我們的力量”。此時，全部的十鬥士也出現在大家眼前，三大天使也現身請眾人打倒光明獸。於是所有人和十鬥士一起古代魂進化成須佐之男獸，將剛沖入現實世界的光明獸拉了回去。此時，須佐之男獸發現了魔龍手裡拿著的漆黑一片的大型球狀體，於是上前攻擊，發現裡面有個蟲型的生物。這時，魔龍對須佐之男獸展開最強勁的攻擊。須佐之男獸拚命衝進球狀體裡，一拳擊中蟲型生物，使球狀體粉碎，魔龍暴走，而大家也回到了數碼世界。須佐之男獸用八雷神和天羽斬終於幹掉了魔龍。而此時蟲型生物——光明獸的邪惡意志沖向須佐之男獸，被十鬥士打死。眾人的數碼終端器里放出資料，使數碼世界完全復原了。此時通道即將關閉，所以大家只好告別十鬥士和數碼世界了。回到現實世界，眾人想起輝一，立即趕往醫院。在輝二的呼喊和他擁有奧法尼獸愛之力量的眼淚下，輝一奇蹟般地甦醒了過來。拓也過了個開心的生日會，友樹、純平和泉交到了朋友，輝二叫了後媽“媽媽，還和輝一去見了生母。經過了這次冒險，大家都懂得了許多東西。
相關音樂
片頭曲
『FIRE!!』（火）
作詞：山田ひろし/作曲：太田美知彥/編曲：太田美知彥/歌：和田光司
★香港版本★
曲名：《FIRE!!》作曲：太田美知彥/作詞：甄健強/主唱：麥浚龍
片尾曲
ED1『イノセント～無邪気なままで～』（不變的天真）
作詞：松木悠/作曲：千綿偉功/編曲：渡部チェル/歌：和田光司
ED2『AnEndlessTale』（永無止盡的傳說）
作詞：山田ひろし/作曲：太田美知彥/編曲：太田美知彥/歌：和田光司&AiM
插入曲
魂進化曲『WithTheWill』（充滿意志）
作詞：大森祥子/作曲：渡部チェル/編曲：渡部チェル/歌：和田光司
古代魂進化曲『TheLastElement』（最後的元素）
作詞：山田ひろし/作曲：渡部チェル/編曲：渡部チェル/歌：宮崎歩
最終話插曲『遙かな贈りもの』（遙遠的禮物）
作詞：大森祥子/作曲：千綿偉功/編曲：渡部チェル/歌：和田光司&AiM
角色歌
神原拓也：『サラマンダ』（火蛇）
作詞:山田ひろし作曲:太田美知彥編曲：太田美知彥演唱:神原拓也（CV：竹內順子）
源輝二：『intheblue』（在藍色中）
作詞：Halta作曲：Halta編曲：田光マコト演唱：源輝二（CV：神谷浩史）
冰見友樹：『Sayyes』（說是）
作詞：大森祥子作曲：高橋ひろ編曲：高橋ひろ演唱：冰見友樹（CV:渡邊久美子）
織本泉：『風のしずく（風之水滴）
作詞：泉川そら作曲：泉川そら編曲：渡部チェル演唱：織本泉（CV：石毛佐和）
柴山純平：『スバク』（火花）
作詞：松井京子作曲：江川裕史編曲：太田美知彥演唱：柴山純平（CV：天田真人）
木村輝一：『折れた翼で-WithBrokenWings』（折斷的翅膀）
作詞：halta作曲：halta編曲：田光マコト演唱：木村輝一（CV:鈴村健一）
暗黑獸：『Blader』
作詞：山田ひろし作曲：太田美知彥演唱：暗黑獸（CV：鈴村健一）
波高獸&問答獸『スピリット大作戦』
演唱：波高獸（cv:杉山佳壽子）&問答獸（cv:菊池正美）
聖誕節
『MoreMoreHappyChristmas』（更多更多快樂的聖誕節）
作詞：大森祥子作曲：渡部チェル編曲：渡部チェル
演唱：神源拓也（竹內順子）、柴山純平（天田真人）、源輝二（神谷浩史）、冰見友樹（渡邊久美子）、織本泉（石毛佐和）、
木村輝一（鈴村健一）
『ChristmasNight』（聖誕夜）
演唱：和田光司
主角合唱
『FIRE!!』（火）
FIRE（這是主角聲優合唱的版本，而非和田光司的片頭曲版本）
作詞：山田ひろし作曲：太田美知彥編曲：太田美知彥
演唱：神源拓也（竹內順子）、源輝二（神谷浩史）、柴山純平（天田真人）、織本泉（石毛佐和）、
冰見友樹（渡邊久美子）、木村輝一（鈴村健一）
合唱
『Getthebiggestfire』（得到最大的火焰）
作詞：山田ひろし作曲：太田美知彥編曲：太田美知彥演奏：デジモンアレンジャーズ
歌：神原拓也&源輝二（聲優：竹內順子&神谷浩史）
廣播劇
『デジモンフロンティアオリジナルストーリー伝えたいこと』（EN：OriginalStoryTsutaetaikoto（Drama））
part1:主角的開篇介紹兼感想
拓也：嗨，我是神原拓也，雖然數碼最前線已經完結了，不過數碼世界今後還會不斷持續下去的，下次就說不定輪到你上場了喔！
泉：我是織本泉，任何時候我都一定會成為一個好大姐，希望還能和大家再見面，再見吧！
純平：我是柴山純平，非常感謝大家對數碼最前線以支持。哎？減肥該怎么辦？哈哈哈！因為我還要繼續戰鬥呢！那么，再見了！
友樹：我是冰見友樹，只要做到擁有勇氣，相信自己，你也一定可以成為英雄的！相信我們還會在某個時刻某一地點相再見的！
輝二：我是源輝二，非常感謝大家一直跟隨著我們目前為止的冒險，讓光祝福大家吧！
輝一：我是木村輝一，能和你們相遇真是太好了！因為和你們在一起，我才會更加努力，感謝你們！
part2:《拓也の家族への手紙》（一封信給拓也的家人）廣播劇內容詳見神原拓也百科
part3:《泉のloveletter》（小泉的情信）廣播劇內容詳見織本泉百科
part4:《泉を狙え!究極の作戦!!》（瞄住泉！究極的作戰！！）廣播劇內容詳見柴山純平百科
patt5:《兄ちゃんへ》（給哥哥的）廣播劇內容詳見冰見友樹百科
part6:《輝二から輝一へ》（輝二給輝一的話）廣播劇內容詳見源輝二百科
part7:《輝一から輝二へ》（輝一給輝二的話）廣播劇內容詳見木村輝一百科
part8:片尾曲
數碼寶貝分類
| 年份 | 名稱 | 主要人物 | 搭檔數碼獸 | 人物圖片 | 數碼獸圖片 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1999年3月7日－2000年3月26日 | 數碼寶貝第一部 | 八神太一 | 亞古獸 |  |  |
| 2000年4月2日-2001年3月25日 | 數碼寶貝第二部 | 本宮大輔 | V仔獸 |  |  |
| 2001年4月1日～2002年3月31日 | 數碼寶貝第三部 | 松田啟人 | 基爾獸 |  |  |
| 2002年4月7日～2003年3月30日 | 數碼寶貝第四部 | 神原拓也 | 火神獸 |  |  |
| 2006年4月2日- 2007年3月25日 | 數碼寶貝第五部 | 大門大 | 亞古獸 |  |  |
| 2010年7月6日－2012年3月2日 | 數碼寶貝第六部 | 工藤大器 | 高吼獸 |  |  |
| 明石激 | 蛟龍獸 |  |  |
