解放前,扎加寺擁有索南措姆所有的牲畜、草場及屬民。屬民統稱“夏邛昂巴”,專為該寺放牧、收集畜產品、揀柴、磨糌粑、馱鹽等。後經協商,所有屬民歸邦巴本管理,邦巴本每年給扎加寺派放牧、揀柴、馱鹽等人員,扎加寺只管吃、住。
1968年,“文革”中扎加寺被破壞。1978年黨的十一屆三中全會召開以後,黨的宗教政策得到落實。1987年,邦巴區組織木匠、石匠、畫匠和民眾對該寺進行了修復,建成2座拉康及7間庫房和僧眾住宅。拉康的壁畫及裝飾均由阿里地區佛協副會長格龍歐珠完成。
扎加寺功能
扎加寺供奉的主要佛像有:第六世噶瑪巴彤瓦頓典像、
第八世噶瑪巴米舉多吉像、第十世噶瑪巴曲英多傑像、瑪米塔三師像、蓮花生大師像、釋迦牟尼像、度母、無量光佛、無量壽佛、金剛部金剛、馬頭金剛及檀香紅帽和大量唐卡。最大的法會有藏曆正月舉行的紀念迦牟尼的“毛蘭”(意為“祈願會”)、十月二十五日紀念宗喀巴的“安木喬”(宗喀巴圓寂日)。其他宗教活動有藏曆每月初三、八、十、十五、二十五、三十定期開展的佛事活動。