機構沿革
創辦初期
宣統二年（1910年），徐州農事實驗場創辦，隸屬於銅山縣農務會。
中華民國六年（1917年），徐州農事實驗場購地72畝，改建江蘇省立第二農事試驗場，隸屬於江蘇省實業廳。
中華民國十三年——二十七年（1924年～1938年），試驗場育成6個麥、棉品種。
中華民國十八年（1929），江蘇省第二農事實驗場改稱江蘇省立麥作試驗場，隸屬於江蘇省實業廳。至抗戰前夕，有職員14人，土地550畝。
中華民國二十一年（1932年），江蘇省立麥作實驗場增轄淮陰雜谷實驗場，隸屬於江蘇省實業廳。
中華民國二十七年五月（1938年5月），日軍占領徐州，麥作場撤至敵後維持良種繁育。日偽政權以原麥作場和省林業試驗分場為基礎,組建三改其名的偽淮海省農林試驗場。
中華民國三十四年九月（1945年9月），抗戰勝利後國民黨政府接管敵偽農場，恢復麥作試驗場，隸屬於江蘇省建設廳，定編職員10名，工人11名，場地大部分被國民黨軍隊占據，實用土地206.4畝。
中華民國三十六年三月（1947年3月），江蘇省麥作實驗場增掛徐州植棉指導區牌子，隸屬於農林部棉改處。
中華民國三十七年十二月（1948年12月），江蘇省麥作實驗場更名為山東省徐州市建設局農業實驗場，隸屬於徐州市建設局。
建國初期
1950年2月，山東省徐州市建設局農業實驗場擴為山東省立徐州農業實驗場，隸屬於山東省農林廳。
1951年2月，山東省立徐州農業實驗場更名為山東省徐州市農場，隸屬於徐州市建設局。
1953年4月，回歸江蘇，山東省徐州市農場更名為江蘇省雜谷實驗場，隸屬於江蘇省農林廳。
徐州市農業科學院1955年5月，江蘇省雜谷實驗場更名為江蘇省徐州農業實驗站。
1955年，淮陰雜谷實驗場劃出。
1957年，為徐州旱作改水稻建成稻麥兩熟旱改水生產示範樣板。
1958年12月，被評為“農業社會主義建設先進單位”，受到國務院獎勵。
1958年冬季，改為徐州專區農科所，負責徐州8縣1市農科所業務，建制從省屬轉為徐州專署的省、地雙重領導。
1959年1月，徐州專區農科所更名為徐州專區農業科學研究所（二級局）。
1959年，徐州專區農業科學研究所增轄賀村農場。
1961年，研究所代管銅山花緘土實驗站。
1962，精兵簡政，縮短戰線，科技人員素質提高，研究內容突出高產要求，實行內外結合，參加高產樣板和治鹼改土樣板的建設，指導當地民眾開展農村科學實驗運動。同年，中國農業科學院薯類研究所併入，賀村農場劃出。
文革時期
“文化大革命”中，全省農科體系解體，研究所科研長期半停頓，科技人員簡化維持農作物育種。
1969年2月，研究所更名為徐州地區農業科學研究所（革委會）。
1973年，研究所科研工作開始復甦，科技人員重返科研崗位，恢復科研工作。
1977年，研究所全面恢復科學研究和科技推廣服務工作。
改革開放
1978年起，研究所落實知識分子政策，徹底平反冤假錯案，任用科技人員擔任黨、政領導職務，成立所務委員會、學術委員會，建立新的管理系統和組織結構，建立成果評獎和職稱評定製度。
“徐麥31”高產示範田1979年5月，徐州地區農業科學研究所升格為一級局，為徐州地區行署。
1983年3月，徐州地區農業科學研究所更名為徐州市農業科學研究所（地，市合併），屬於徐州市政府；5月，更名為江蘇徐淮地區農業科學研究所，隸屬於江蘇省農科院；11月，更名為江蘇徐淮地區徐州農業科學研究所。
1984年3月，研究所增掛江蘇徐州甘薯研究室牌子。
1981年～2009年，研究所共接待30多個國家或地區以及國際科研開發機構116批301人次來訪，出訪65批93人次，與國際馬鈴薯中心、亞洲蔬菜發展與研究中心和其他境外相關機構建立多項合作，聘請7名境外專家任特約研究員。
1989年8月，江蘇徐州甘薯研究室改稱江蘇徐州甘薯研究中心。
1991年1月，增掛徐州市農業科學研究所牌子。
1999年11月，農業部在研究所設立國家甘薯研究中心；12，徐州市農業科學研究所改稱徐州市農業科學院。
2002年11月，徐州市農業科學院增掛中國農業科學院甘薯研究所。
2013年，銅山試驗站“人、財、物”由省農科院全部移交給江蘇徐淮地區徐州農科所管。
科研條件
研究部門
據2017年12月科學院官網顯示，科學院擁有1個國家級改良中心、1個國家級技術研發中心、1個農業部重點實驗室、1箇中國農業科學院重點開放實驗室；擁有國家現代農業產業技術體系小麥、棉花、水稻、大豆、花生等5個徐州（淮）試驗站；設有7個研究部門、1個現代農業科技試驗示範基地，院屬1個江蘇徐農種業科技有限公司。
科技園區國家級改良中心：國家甘薯改良中心
國家級技術研發中心：國家甘薯產業技術研發中心
農業部重點實驗室：農業部甘薯生物學與遺傳育種重點實驗室
中國農業科學院重點開放實驗室：中國農業科學院甘薯遺傳改良重點開放實驗室
院研究部門：小麥研究室、水稻研究室、棉花研究室、油料研究室、園藝研究室、植保研究室、銅山試驗站
人員編制
據2017年12月科學院官網顯示，科學院共有在職職工158人，科技人員102人，其中研究員17人，副研究員37人。享受國務院特殊津貼專家27人，省級突出貢獻專家12人，江蘇省“333”工程培養對象29人，先後有4名專家當選全國人大代表，1名當選中共十二大代表，1名省人大常委，2名全國勞模，1名省勞模、“五一”勞動獎章獲得者。
享受國務院特殊津貼專家：李國柱、顏振德、朱崇文、夏善寶、李嘯洪、朱國清、陳學禮、蔣復、羅玉榮、郭吉彬、吳霖、華希新、彭金城、馬代夫、陳榮振、劉超、陳萍、李秀英、劉世來、王健康、謝逸萍
省級突出貢獻專家：夏善寶、邢繼英、馬代夫、馮國華、郭吉彬、劉世來、李秀英、李強、顏振德、陳榮振、王奎榮、劉超
設備資源
據2017年12月科學院官網顯示，科學院擁有高標準農業科研實驗田1700餘畝，各類實驗室9個，先進科研儀器設備300餘台套，固定資產總值近億元。
科研成就
項目承擔
部分甘薯育種成果及甘薯產品展示據2017年12月科學院官網顯示，“十五”以來，科學院承擔國家和部、省下達的甘薯科研項目、國際合作和國家、省自然科學基金課題50餘項。先後育成甘薯新品種30多個，育成品種推廣種植面積約占全國甘薯良種種植面積的50%左右；獲各級科技成果獎31項，其中國家級5項；收集和保存甘薯各類品種資源1400餘份，選育優良品種25個；1978～1983年，獲國家、部、省、市各級科技成果獎55項。
1962-2006年，科學院發表論文1142篇，其中學報級論文數124篇，出版論著69項。
科技成果
1955年育成棉花新品種“徐州209”，成為中國內地第一個大面積產量超美棉的自育棉花品種，1965年獲國家發明獎。
“徐薯18”甘薯、“徐州68—4”花生分獲國家發明一等獎和三等獎。
甘薯骨幹親本的研究和利用，獲國家科技進步三等獎。
甘薯脫毒技術的研發和推廣套用，獲江蘇省科技進步二等獎。
高澱粉多抗廣適甘薯新品種徐薯22的選育和利用獲2013年中華農業科技進步一等獎。
徐紫薯6號在2016年第六屆“禾下土杯”全國甘薯高產高效競賽中獲二等獎。
文化傳統
形象標識
logo科學院標誌為橢圓形，綠色的底，寓意農業。中間為兩個A交叉在一起，同時融入了字母X，中間橫著的為字母S，巧妙的利用了科學院英文簡稱XZAAS。1910為創建年份。
文化活動
據2017年12月科學院官網顯示，科學院先後組織了掛縣強農富民工程綜合技術培訓、農業科技培訓班、學習沂蒙精神、到台兒莊大戰紀念館和鳳陽縣小崗村等地參觀學習。
現任領導
| 職務 | 姓名 |
| 院長 | 劉明鍾 |
| 副院長、黨委委員 | 李再祥 |
| 副院長 | 李強 |
| 副院長、黨委委員 | 楊峰 |
