1980年,張允嶺考入了北京中醫學院學習。
1985年北京中醫學院本科畢業後,一直從事中醫內科臨床、科研及教學工作,師從全國人大常委、中國工程院院士、著名中醫學家王永炎教授及著名中西醫結合腦病專家張伯禮教授,先後取得醫學碩士、博士學位。
1991年通過了WHO項目在中國的公派留學考試,赴日本留學。
1997年受世界衛生組織(WHO)之邀,以高級訪問學者赴美國國立衛生研究院(NIH)交流學習。
2000年3月在日本完成博士後研究。
2000年4月和獲醫學博士學位的妻子,回到母校北京中醫藥大學附屬東方醫院,被暫時安排到神經內科做普通醫生,期間他先後獲得了教育部、人事部、國家自然科學基金委員會、國家中醫藥管理局等提供的多項科研資助,成為東方醫院科研項目和研究成果最多的專家之一。
2003年4月17日,時任北京中醫藥大學附屬東方醫院中醫內科教研室主任、博士生導師、主任醫師的張允嶺第一個報名支援抗擊非典一線,在長辛店醫院和來自北京20多家醫院的120名醫護人員抗擊非典,並受命擔任一病區即重症區主任,直接負責重症病人的監護和搶救工作,並被選為臨時黨支部委員,連續奮鬥了28個日日夜夜,克服了常人難以想像的困難。與此同時,也探索出了一條中醫治療sars的成功之路。5月18日,張允嶺和全體醫生關於63例非典患者的《中西醫治療非典的臨床研究》也獲得了成功,在充滿危險的火線上,最終完成了63個病人每人21張表格,共1323份表格的臨床觀察,取得了中醫藥治療sars的第一手資料。因為這些寶貴的研究成果,他先後在中國科協、科技部、國家中醫藥管理局中醫藥防治非典學術會議上專題發言,在6月3日東協與中日韓(10+3)非典型肺炎國際高級學術會--ASEAN大會上做了題為《Clinical Trial on Treatment of 63 SARS Cases with Combination of Western and Chinese Medicine》發言並受邀主持會議,在世界衛生組織中醫、中西醫結合治療非典國際研討會作為主報告審定專家和第七份報告負責人專題發言。被世界衛生組織(WHO)專家組確認為同類研究中最有價值的工作之一,通過國內外多家媒體向世界展示了中醫藥的優勢和特色。為防治非典型肺炎的醫學研究做出了自己的貢獻。
2003年被中共北京市委、市政府、市委教育工委授予北京市及北京高校防治非典型肺炎優秀共產黨員稱號,獲首都精神文明建設獎章,並獲得中國科學技術協會授予的全國防治非典型肺炎優秀科技工作者、中華中醫藥學會全國抗擊非典型肺炎特別貢獻先進個人等榮譽稱號,隨後參加北京高校防治非典先進事跡宣講團和抗擊非典鬥爭英模事跡北京教育系統報告團,在高校及在京機關報告12場,受到黨和國家領導人的親切接見。
2004年,張允嶺被任命為東方醫院實驗中心主任,他的學術研究同時也進入了快速發展時期。
2006年任東方醫院副院長。
2007年,在北京市政府及相關部門的支持下,深入社區開展“老年期痴呆科普宣教、篩查防治進社區”活動。
2009年,任東方醫院院長,出版了《經方實驗錄》、《中醫腦病學》等學術著作。
2010年,主編的教材《中醫內科學》被列為北京市教委精品教材。
張允嶺的主要研究方向為中醫藥防治中風和老年期痴呆臨床及機理研究。 主持或承擔了WHO傳統醫學合作項目,國家重大基礎研究項目(973),國家自然科學基金項目,國家科技部博士新藥基金項目,國家中醫藥管理局科研基金項目,教育部科學技術重點項目、優秀青年教師基金項目、博士點基金項目,教育部、人事部優秀留學回國基金項目等。2000年以來,獲國家科技進步二等獎1項,教育部中國高校科學技術一等獎1項,國家中醫藥管理局基礎研究二等獎1項,中華中醫藥學會科學技術三等獎1項,北京市科技進步一等獎1項、二等獎1項、三等獎1項,天津市科技進步二等獎2項,獲國家專利2項,發表代表性學術論文50餘篇。