規劃
廈漳海底隧道根據初步規劃，廈漳海底隧道起於廈門火車站附近，連線成功大道，南止於漳州開發區南炮台。廈漳大橋則起自海滄馬青路院前，止於漳州龍海後宅。從地圖上看，二者的出口都在漳州開發區。
廈漳海底隧道是繼廈漳跨海大橋之後，聯絡廈門和漳州之間的第二條海上通道。根據規劃，廈漳海底隧道兩端分別連線漳州開發區與廈門本島，並與規劃中的廈漳城際軌道R3線共線，意義重大。
2015年10月13日，國家發改委網站發布關於《福建省海峽西岸城際鐵路建設規劃（2015—2020年）》的正式批覆。據悉，到2020年，我省將陸續開工建設6條城際鐵路，其中包括2條廈漳泉大都市區城際鐵路：泉州—廈門—漳州城際鐵路、漳州—港尾—廈門城際鐵路（部分利用港尾鐵路改建），線路總長263公里。
R3線將連線漳州中心城區，經過九龍江南岸，連線漳州開發區、南太武新區，主要依託在建港尾鐵路改造，通過廈漳海底隧道延伸進廈門火車站，按時速120公里設計，共76公里。
廈漳城際鐵路R3線建設工期為48個月。如果在今年年底開工，將於2020年建成通車。屆時，兩地市區直接互通，漳州到廈門島內，50分鐘內可到達。
R1線將晚於R3線動工，這條鐵路長達187公里，是此次批覆的6條城際鐵路中最長的，將從泉州市泉港區肖厝站，經泉州、廈門至漳州。沿途經過廈漳泉三地二十幾個站點，在漳州將串聯漳州中心城區、串聯角美和漳州台商投資區。鐵路設計時速160公里，屆時廈漳泉城際往來可以縮短半個小時時間。
合併圖冊“在廈漳泉大都市區，市民出行的需求非常大。”鐵路部門相關負責人告訴 記者，線上路設計上，2條鐵路將重點考慮，讓更多市民在家門口就能坐上動車。
漳州市發改委相關負責人稱，城際鐵路通車後，將進一步推動廈漳泉同城化發展。漳州將受到廈門、泉州等經濟較發達地區的輻射，進一步推動第二三產業發展，三地間的人流、物流、信息等也將進一步融合。沿線地區經濟發展也將被帶動。
作用
根據規劃，漳州—港尾—廈門城際鐵路(R3線)從漳州站出發，經漳州城區引入港尾鐵路支線，至島內廈門站，這條線路走向需要經過海底隧道。
廈漳海底隧道是廈漳城際鐵的總要組成部分，是廈漳泉同城化同城化總要部分。構建廈漳泉大都市區，是省委、省政府著眼於推動我省科學發展、跨越發展而作出的重大戰略部署，對於三市共同拓展發展空間、擴大發展機遇，在更大平台上集聚競爭優勢、打造引領跨越發展的強大區域增長極，具有重要意義。
2015年11月18日，福建省“十三五”規劃建議(以下簡稱《規劃》)全文發布，作為全省未來五年建設的綱領性檔案，“十三五”規劃特別提出要最佳化全省的發展空間格局，加快廈漳泉的同城化步伐。並於2016年2月22日漳州開發區2016年工作會中，漳州市副市長王毅群做出發言“備受關注的R3線廈漳城際軌道項目已經於2015年9月得到國家發改委的立項批覆，項目一期工程（從漳州北站到漳州開發區雙魚島站），全長69.9公里，將於今年6月開工建設”
