總體規劃
廈漳泉城際軌道根據《廈漳泉城際軌道交通線網規劃》，廈漳泉城際軌道交通線網由9條線路構成（含2條遠景控制線），總規模487.75公里，設車站250座，含換乘站90座。全網共設2處綜合維修基地，10處停車場，8處車輛段。根據城際總體規劃，廈漳泉城際軌道交通線網規劃（2030年）由3條線路組成，線路全長231.32公里，設車站126座，其中換乘站17座。
線路規劃與功能定位
1號線起於龍廈鐵路的靖城火車站，經過漳州金峰組團，經過漳州中心城區，經過漳州江東，串聯角美火車站和台商投資區，經過海滄到廈門島，經過規劃的翔安機場，經過泉州的晉江、中心城區、泉州台商投資區、惠安、泉港區，最終在北部的仙遊火車站接上福廈鐵路。
2號線作為南北向的輔助交通走廊，南部起於漳州龍海，經過廈門海滄，在廈門島外串聯廈門四大新城，向北經過翔安，經晉江和石獅之間規劃的預留交通走廊，向北接到城際軌道1號線。
3號線連線漳州中心城區，經過九龍江南岸，連線漳州開發區、南太武新區等具有發展潛力的城市組團，未來與城際軌道1號線，將形成一個Y字形的城鎮發展走廊，在九龍江沿岸，真正實現沿江面海的大漳州發展戰略。
4號線起於石獅永寧，經晉江城區，向西與南安、安溪串聯，構建一個城鎮交通發展走廊。
5號線位於漳州境內，起於漳浦，經南靖、平和，串聯山區三大縣城。
6號線銜接金門和規劃的翔安機場，未來還可考慮進一步延伸至台灣。
7號線連線泉州環灣核心區，經過泉州台商投資區，經泉州北部新火車站，未來終點將考慮延伸到永春。
8號線起於1號線的仙遊站，經過仙遊縣城，經南安，未來形成一個環狀的鐵路網。
9號線廈門火車站向南跨過廈門灣後，經過港尾與3號線銜接，未來可以在廈門北站開出從廈門北經過廈門島，到漳州的南太武新區，連線東山島。
| 線路 | 起訖點 | 線路長度 （km） | 車站 | 平均站間距 （Km） | |||
| 一般站 | 換乘站 | 總計 | |||||
| 廈漳泉城際軌道1號線 | 靖城火車站 | 仙遊火車站 | |||||
| 廈漳泉城際軌道2號線 | |||||||
| 廈漳泉城際軌道2號線延伸線 | |||||||
| 廈漳泉城際軌道3號線 | 漳州北站 | 廈門火車站 | 68.8km | ||||
| 廈漳泉城際軌道3號線延伸線 | |||||||
| 廈漳泉城際軌道4號線 | |||||||
| 廈漳泉城際軌道5號線 | |||||||
| 廈漳泉城際軌道6號線 | |||||||
| 廈漳泉城際軌道7號線 | |||||||
| 廈漳泉城際軌道8號線 | |||||||
| 廈漳泉城際軌道9號線 | 廈門火車站 | ||||||
| 總計 | |||||||
上表數據來源：《廈漳泉城際軌道交通線網規劃》。具體線路情況以實際建設運營為準
線網分期實施方案
三市軌道交通要銜接城際軌道
昨日會上，省發改委、省鐵道辦領導，與廈漳泉三市相關領導，在漳州舉行廈泉漳城際軌道的規劃會議，聽取了設計單位關於城際軌道線的規劃工作匯報。
省發改委、省鐵道辦的領導在會上說，希望廈漳泉三市的相關領導，儘快完成前期準備工作，進行可研方案的競標，將可研方案明確下來，力爭啟動城際線主線建設。關於廈漳泉城際線的線路走向、標準等內容，三地市要儘快提交明確的意見，包括規劃意見及環境評估等。另外，前期開工項目的線路走向是否符合本市的要求，要儘快落實清楚，在月底前上報給省鐵道辦；本市的城市軌道交通規劃，要與城際軌道交通配套銜接。
預留延伸部分向東至台灣
根據設計單位的規劃，廈漳泉城際軌道全長214.9公里，設定29個站。平均站間距7.68公里，最大站間距為14.8公里，最小站間距是4公里，運輸組織模式擬推薦採取兩種方式:一種是開行大站停，另一種是站站停。
據介紹，主線全長168公里，北起泉州市泉港區，南至漳州市區天寶鎮，途經惠安、泉州市區、晉江、石井、廈門、角美、漳州市區。
設計單位還在會上介紹了城市軌道交通遠期遠景規劃9條線。遠景考慮整個大都市區在未來將會建設成國際大都市區，因此在北部預留連線福州，向南可延伸至漳州東山、詔安縣，向西至龍巖、三明，向東也預留了未來可能延伸至台灣的部分。
將直通規劃中的翔安機場
根據會上的初步探討，廈泉漳城際線將經泉州中心區、廈門本島和漳州主城區，以滿足客運需求，與當地的軌道交通換乘樞紐銜接。根據會上初步意見，城際線將選擇進入廈門島內方案，在廈門島內設站，與廈門的軌道交通實現無縫銜接，滿足客運需求，實現同站換乘。
同時，城際線將與晉江機場、高崎機場、泉州高鐵站、漳州站銜接，擴大輻射範圍，方便市民民眾換乘，帶動當地發展。根據規劃，城際軌道線將直通規劃中的翔安機場航站樓。屆時，翔安機場將成為輻射廈門、漳州、泉州、龍巖的區域性機場。
近期建設
廈漳泉城際軌道包括漳州-集美-廈門城際的R2線、漳州-港尾-廈門城際的R3線、泉州-廈門城際的R1線、廈門-雲霄城際的R6線。其中R1線最長，達150公里
何謂“一環”“兩網”
“一環”指的是近期福州-莆田-泉州-廈門-漳州-龍巖-三明-南平-福州利用既有的福廈鐵路、龍廈鐵路、規劃的南三龍鐵路及在建的合福鐵路，遠期利用寧德-南平鐵路
“兩網”指的是福莆寧大都市區城際線網新建10條放射狀城際線;廈漳泉大都市區城際線網新建6條放射狀城際線
“一環、兩網”是我省未來城際軌道交通的主體架構。記者昨日從省發改委獲悉，海西城際軌道交通線網規劃日前開始環評公示，該規劃公開我省軌道交通至 2030年的建設項目，其中廈漳泉大都市區將新建6條城際軌道線，建設里程達509公里。
“一環、兩網”將在2020年形成
廈漳泉城際軌道根據環評報告書，海西城際軌道交通線網規劃範圍包含全省9個設區市及平潭綜合實驗區，涉及全省土地面積12.4萬平方公里。
除了廈漳泉區域的6條新建線路外，整個福建的城際軌道交通網將在2020年基本形成，即“一環、兩網”。屆時，城際軌道交通網將把全省各地串聯起來，實現軌道交通直達省內任一設區市。
規劃設計方對“一環、兩網”這種環線與網路的架構模式作出了分析，稱整個城際軌道交通網在解決中心城市之間快速到達的同時，也能有效促進《福建省城鎮體系規劃》的城鎮空間總體結構的實現。
6條城際軌道線，4條與廈門相連
廈漳泉大都市區城際軌道交通線網分近期規劃和遠期規劃兩部分，近期截至2020年，遠期截至2030年。按照規劃，未來將新建的6條城際軌道線中有4條從廈門出發，凸顯了廈門在該都市區中的核心交通樞紐地位。
這4條線是:漳州-集美-廈門城際的R2線、漳州-港尾-廈門城際的R3線，這兩條線路有望在2020年前建成，部分線路利用現有的鷹廈鐵路和港尾鐵路改建，廈門的起點站都是現有的廈門站;泉州-廈門城際的R1線、廈門-雲霄城際的R6線，這兩條線路為遠期，計畫在2030年前建成。其中R1線的里程最長，達到150公里，中途將設29個站點。
線路情況
總概況
根據《廈漳泉城際軌道交通線網規劃》，廈漳泉城際軌道交通線網由9條線路構成（含2條遠景控制線），總規模487.75公里，設車站250座，含換乘站90座。
| 線路 | 沿線站點 | 途徑區域 | 狀態 |
| R1 | 泉州市、廈門市 | 待建中 | |
| R2 | 漳州市、廈門市 | 待建中 | |
| R3 | 漳州市、廈門市 | 待建中 | |
| R4 | 泉州市 | 待建中 | |
| R5 | 漳州市 | 規劃中 | |
| R6 | 廈門市、漳州市 | 前期準備 |
上表數據來源：《廈漳泉城際軌道交通線網規劃》。具體線路情況以實際建設運營為準。
1號線
1號線起於龍廈鐵路的靖城火車站，經過漳州金峰組團，經過漳州中心城區，經過漳州江東，串聯角美火車站和台商投資區，經過海滄到廈門島，經過規劃的翔安機場，經過泉州的 晉江、中心城區、泉州台商投資區、惠安、泉港區，最終在北部的仙遊火車站接上福廈鐵路。
2號線
2號線作為南北向的輔助交通走廊，南部起於漳州龍海，經過廈門海滄，在廈門島外串聯廈門四大新城，向北經過翔安，經晉江和石獅之間規劃的預留交通走廊，向北接到城際軌道1號線。
3號線
3號線連線漳州中心城區，經過九龍江南岸，連線漳州開發區、南太武新區等具有發展潛力的城市組團，未來與城際軌道1號線，將形成一個Y字形的城鎮發展走廊，在九龍江沿岸，真正實現沿江面海的大漳州發展戰略。
4號線
4號線起於石獅永寧，經晉江城區，向西與南安、安溪串聯，構建一個城鎮交通發展走廊。
展望 向東延伸到台灣
在2030年基礎上，規劃又構建了一個遠景線網，增加了5條線，在北部預留向北連線福州大都市區的條件，向南預留延伸至東山、詔安的條件，向西預留連線龍巖、三明的接口，向東預留未來延伸至台灣的條件。
5號線
5號線位於漳州境內，起於漳浦，經南靖、平和，串聯山區三大縣城。
6號線
6號線銜接金門和規劃的翔安機場，未來還可考慮進一步延伸至台灣。
7號線
7號線連線泉州環灣核心區，經過泉州台商投資區，經泉州北部新火車站，未來終點將考慮延伸到永春。
8號線
8號線起於1號線的仙遊站，經過仙遊縣城，經南安，未來形成一個環狀的鐵路網。
9號線
9號線廈門火車站向南跨過廈門灣後，經過港尾與3號線銜接，未來可以在廈門北站開出從廈門北經過廈門島，到漳州的南太武新區，連線東山島。
