總統職權
根據巴拿馬憲法規定，總統擁有任命政府各部部長、維護公共秩序、制定外交政策，並可以否定立法機構提出的法案。
現任總統
現任總統：胡安·卡洛斯·巴雷拉胡安·卡洛斯·巴雷拉（Juan Carlos Varela）。1963年12月12日生於巴拿馬城。美國喬治亞州立理工學院畢業，工程師。系巴知名企業家，擁有家族制酒企業“巴雷拉兄弟”和數家無線電台等產業。在1994年和1999年兩次大選中擔任巴拿馬主義黨競選活動負責人。2009年作為該黨候選人同馬丁內利組成聯盟搭檔競選，勝出後任副總統兼外長。2014年5月作為巴拿馬主義黨候選人參加大選獲勝，7月1日就職。
歷任總統
1、曼努埃爾·阿馬多爾·格雷羅（Manuel Amador Guerrero）1904年2月20日—1908年10月1日 巴拿馬保守黨
2、何塞·多明戈·德·奧瓦爾迪亞（José Domingo de Obaldía）1908年10月1日—1910年3月1日 巴拿馬民族自由黨
代總統 卡洛斯·安東尼奧·蒙多薩（Carlos Antonio Mendoza）1910年3月1日—1910年10月1日 巴拿馬民族自由黨
臨時總統 費德里科·波伊德（Federico Boyd）1910年10月1日—1910年10月5日 巴拿馬民族自由黨
3、帕布洛·阿羅塞梅納（Pablo Arosemena）1910年10月5日—1912年10月1日 巴拿馬民族自由黨
4、貝利薩里奧·波拉斯·巴拉霍納（Belisario Porras Barahona）1912年10月1日—1916年10月1日 巴拿馬民族自由黨
5、拉蒙·馬克西米連諾·巴爾德斯（Ramón Maximiliano Valdés）1916年10月1日—1918年6月3日 巴拿馬民族自由黨
代總統 西羅·路易斯·烏里奧拉（Ciro Luis Urriola）1918年6月3日—1918年10月1日 巴拿馬民族自由黨
臨時總統 佩德羅·安東尼奧·迪亞斯（Pedro Antonio Díaz）1918年10月1日—1918年10月12日 巴拿馬民族自由黨
6、貝利薩里奧·波拉斯·巴拉霍納（Belisario Porras Barahona）1918年10月12日—1920年1月30日 巴拿馬民族自由黨
代總統 埃內斯托·蒂斯德爾·勒費夫雷（Ernesto Tisdel Lefevre）1920年1月30日—1920年10月1日 巴拿馬民族自由黨
7、貝利薩里奧·波拉斯·巴拉霍納（Belisario Porras Barahona）1920年10月1日—1924年10月1日 巴拿馬民族自由黨
8、羅多爾弗·希亞里·羅伯勒斯（Rodolfo Chiari）1924年10月1日—1928年10月1日 巴拿馬民族自由黨
9、弗朗西斯科·哈莫迪奧·阿羅塞梅納（Florencio Harmodio Arosemena）1928年10月1日—1931年1月3日 巴拿馬民族自由黨
臨時總統 哈莫迪奧·阿里亞斯·馬德里德（Harmodio Arias Madrid）1931年1月3日—1931年1月16日 無黨派
10、里卡多·華金·阿爾法羅·霍瓦內（Ricardo Joaquín Alfaro Jované）1931年1月16日—1932年6月5日 巴拿馬民族自由黨
11、哈莫迪奧·阿里亞斯·馬德里德（Harmodio Arias Madrid）1932年6月5日—1936年10月1日 巴拿馬民族革命黨
12、胡安·德莫斯特內斯·阿羅塞梅納（Juan Demóstenes Arosemena）1936年10月1日—1939年12月16日 巴拿馬民族自由黨
臨時總統 埃塞基埃爾·費爾南德斯·胡安（Ezequiel Fernández）1939年12月16日—1939年12月18日 巴拿馬民族革命黨
代總統 奧古斯都·薩姆埃爾·博伊德·巴里切諾（Augusto Samuel Boyd）1939年12月18日—1940年10月1日 巴拿馬民族革命黨
12、阿努爾福·阿里亞斯·馬德里（Arnulfo Arias）1940年10月1日—1941年10月9日 巴拿馬民族革命黨
13、里卡多·阿道爾弗·德拉瓜迪亞·阿朗戈（Ricardo Adolfo de la Guardia Arango）1941年10月9日—1945年6月15日 無黨派巴拿馬民族革命黨
14、恩里克·阿道爾弗·希門尼斯（Enrique Adolfo Jiménez）1945年6月15日—1948年8月7日 巴拿馬民族自由黨
15、多明戈·迪亞斯·阿羅塞梅納（Domingo Díaz Arosemena）1948年8月7日—1949年7月28日 巴拿馬民族自由黨
16、丹尼爾·查尼斯·平松（Daniel Chanis Pinzón）1949年7月28日—1949年11月20日 巴拿馬民族自由黨
臨時總統羅貝托·弗蘭西斯科·奇亞里·雷蒙（Roberto Francisco Chiari Remón）1949年11月20日—1949年11月24日 巴拿馬民族自由黨
17、阿努爾福·阿里亞斯·馬德里（Arnulfo Arias）1949年11月24日—1951年5月9日 巴拿馬主義黨
18、阿爾西維亞德斯·阿羅塞梅納（Alcibíades Arosemena）1951年5月9日—1952年10月1日 巴拿馬真正革命黨
19、何塞·安東尼奧·雷蒙·坎特羅（José Antonio Remón Cantera）1952年10月1日—1955年1月2日 巴拿馬全國愛國聯盟
代總統何塞·拉蒙·基薩多（José Ramón Guizado）1955年1月2日—1955年3月29日 巴拿馬全國愛國聯盟
20、里卡多·阿里亞斯·埃斯皮諾薩（Ricardo Arias）1955年3月29日—1956年10月1日 巴拿馬全國愛國聯盟
21、埃內斯托·德拉瓜迪亞·納瓦羅（Ernesto de la Guardia）1956年10月1日—1960年10月1日 巴拿馬全國愛國聯盟
22、羅貝托·弗蘭西斯科·奇亞里·雷蒙（Roberto Francisco Chiari Remón）1960年10月1日—1964年10月1日 巴拿馬民族自由黨
23、馬科·奧雷略·羅夫萊斯·門德斯（Marco Aurelio Robles）1964年10月1日—1968年10月1日 巴拿馬民族自由黨
24、阿努爾福·阿里亞斯·馬德里（Arnulfo Arias）1968年10月1日—1968年10月11日 巴拿馬主義黨
臨時總統何塞·馬里亞·皮尼利亞·法夫雷加（José María Pinilla Fábrega）/波爾·烏魯蒂亞·帕里利亞（Bolívar Urrutia Parrilla）1968年10月12日—1969年12月18日 軍人
25、德梅特里奧·巴西略·拉卡斯·巴哈斯（Demetrio B. Lakas）1969年12月19日—1978年10月11日 無黨派
26、阿里斯蒂德·羅約·桑切斯（Aristides Royo）1978年10月11日—1982年7月31日 巴拿馬民主革命黨
27、里卡多·德·拉·埃斯普列利亞·托拉爾（Ricardo de la Espriella）1982年7月31日—1984年2月13日 巴拿馬民主革命黨
28、豪爾赫·伊留埃卡（Jorge Illueca）1984年2月13日—1984年10月11日 無黨派
29、尼古拉斯·阿爾迪托·巴爾萊塔（Nicolás Ardito Barletta Vallarino）1984年10月11日—1985年9月28日 巴拿馬民主革命黨
30、埃里克·阿圖羅·德爾瓦列（Eric Arturo Delvalle）1985年9月28日—1988年2月26日 巴拿馬共和國黨
31、曼努埃爾·索利斯·帕爾馬（Manuel Solís Palma）1988年2月26日—1989年9月1日 巴拿馬民主革命黨
32、弗蘭西斯科·安東尼奧·羅德里格斯·波卡達（Francisco Rodríguez）1989年9月1日—1989年12月20日 巴拿馬民主革命黨
33、吉列爾莫·恩達拉·加利馬尼（Guillermo Endara）1989年12月20日—1994年9月1日 巴拿馬主義黨
34、埃斯內托·佩雷斯·巴利亞達雷斯（Ernesto Pérez Balladares）1994年9月1日—1999年9月1日 巴拿馬民主革命黨
35、米雷婭·莫斯科索·德格魯韋爾（Mireya Moscoso）1999年9月1日—2004年9月1日 巴拿馬主義黨
36、馬丁·托里霍斯（Martín Torrijos）2004年9月1日—2009年7月1日 巴拿馬民主革命黨
37、里卡多·馬蒂內利（Ricardo Martinelli）2009年7月1日—2014年7月1日 巴拿馬民族變革
38、胡安·卡洛斯·巴雷拉（Juan Carlos Varela）2014年7月1日—今 巴拿馬主義黨
軍事領導人
1968年到1989年實際領導人：
奧馬爾·埃弗拉·托里霍斯·埃雷拉（Brigadier General Omar Torrijos）1968年10月11日－1981年7月31日
弗洛倫西奧·弗洛雷斯·阿吉拉爾（Florencio Flores Aguilar）1981年7月31日－1982年3月3日
魯本·達里奧·帕雷德斯·德爾里奧（Rubén Darío Paredes）1982年3月3日－1983年8月12日
曼努埃爾·安東尼奧·諾列加（Manuel Antonio Noriega Moreno）1983年8月12日－1989年12月20日
離任總統現狀
巴拿馬總統旗6月9日電 據外媒報導，巴拿馬最高法院於當地時間8日同意以竊聽罪將前總統里卡‧馬丁內利送交審判，而這位多案纏身的超市大亨則重申他是政治迫害的受害者。
據英國《衛報》和美國哥倫比亞廣播公司報導，4月26日下午5點46分，美國將巴拿馬政府前總統、國防軍前總司令諾列加從美監獄引渡到法國。今年76歲的諾列加由美國一手栽培，在1983～1989年期間任巴拿馬總統，曾做過美國中情局的“線人”，後因反抗美國霸占巴拿馬運河被視為英雄，也因此被美國抓捕。1989年12月20日，美國出動2．5萬名海軍陸戰隊員入侵巴拿馬——為逮捕一個人而不惜發動一場戰爭，這在現代國際社會實屬罕見。如今，這位傳奇人物的命運再次引起世界矚目。
