基本簡介
是1978年3月20日省計委以（78）魯計勞字第84號文批准，在原濟寧地區水稻研究所的基礎上改建而成的，全額事業撥款單位，隸屬山東省農業科學院，原駐地濟寧市市中區。2009年6月3日在省事業單位登記管理局完成了住所變更，駐地由濟寧市車站南路26號變更為濟南市工業北路202號。
機構設定
管理機構有行政辦公室、科研辦公室、濟寧試驗站、試驗農場；研究機構有育種室、植保室、栽培室、分子設計育種室、水生植物研究室、科技諮詢室。是國家水稻產業技術體系綜合試驗站依託單位。目前，我所在濟寧市南郊設有試驗基地264畝，濟南市濟陽試驗地30畝，海南崖城南濱農場試驗地50畝。
科研團隊
現有在職職工40人。在職職工中，有科研人員30人，其中，研究員5人、副研究員8人、助理研究員12人，初級職稱5人；具有博士學位5人、碩士學位12人。
科研任務
研究所以套用研究為主，兼顧基礎研究。現在主要從事水稻常規育種、水生植物研究、分子設計育種、抗病育種、優質超高產育種、水稻栽培新技術、水稻病蟲草害綜合防治、成果示範推廣等方面的研究工作，具體包括以下幾個方面：
1、圍繞選育高產、優質、多抗作物新品種的需要，重點研究水稻品質、產量、抗性、營養高效等相關性狀遺傳規律，發掘具有重大套用價值的新基因，完善育種理論和技術方法體系；創造具有重大套用前景的優異育種新材料，培育優質超高產新品種；為黃淮和山東稻區不斷選育出新品種(組合)用於生產。
2、開展水稻功能基因組學、蛋白質組學和生物信息學研究，基因定位、數量性狀遺傳作圖、分子標記輔助育種、功能等位基因發掘和複雜農藝性狀的功能基因組等方面的研究。
3、工作所()、水稻高產、優質、高效、生態栽培技術，水稻輕型種植技術，病蟲草害綜合防治，稻米精深加工技術等方面的研究。
4、水稻種質資源的收集、保存、評價和種質創新與利用研究。
5、“十二五”期間擬拓展的研究領域：一是高效食用、藥用、飼用類水生經濟植物的資源收集和育種及高附加值產品加工技術的研發；二是開展濕地植被植物研究與開發。特別是湖窪湖區、煤礦采空塌陷區、沿黃流域的濕地植被保護與利用研究，水生有害植物（藻類）的防除等研究；三是水生植物淨化水體富營養化研究，城市污水緩衝區水質淨化，水體生態系統恢復等研究。
科研成就
近年來，我所主持承擔了農業部跨越計畫，國家支撐計畫，973項目，國家轉基因重大專項、國家自然科學基金等國家級項目16項；山東省國外引種示範、科技成果轉化資金、省三O工程、省開發辦、育種攻關等項目40餘項。取得國家和省部級科研成果12項，獲得新品種保護權5個，獲得授權專利2個，先後育成並通過國家和省級審定品種14個，已成為山東水稻生產和相近生態區的主栽品種。
