生涯
天文十年三月，武田兵部大輔光廣公遭武將陶晴賢和毛利元就進攻，在金山城自盡而亡。惠瓊乃光廣公之遺孤。於3歲的時候，因為大內氏的入侵，最後使安藝武田氏滅亡，後來被送到安藝國的安國寺。之後到京都的東福寺修行，因為是師傅竺雲惠心親近毛利氏的關係，後來成為了毛利氏的外交僧。
不久，他立即發揮外交手腕，與大友家達成了和睦協定。1582年，在織田家大將羽柴秀吉徵討軍籠城水淹備中高松城的時候。秀吉率先得知主公織田信長在本能寺之變中因被明智光秀叛軍圍困難逃，自焚而死。為了爭奪為主公復仇進而掌握天下大權，所以在勝局已定與交戰方毛利軍達成和平撤軍共識。通過與毛利家軍師惠瓊交涉，最終惠瓊提議，讓城主清水宗治切腹
之後，他判斷了情況，開始親近秀吉，保住了毛利家的地位，由於其出色的外交手腕，最後被分封於伊予國六萬石。
安國寺惠瓊曾在1587年（弘治元年）時，奉豐臣秀吉之命，在嚴島神社境內修築經堂以祭奉在征戰九州時陣亡的兵將，也就是今日的千疊閣。千疊閣在秀吉死時尚未完工，並且一直保持此未完工的狀態直至今日。
死因
安國寺惠瓊墓所在豐臣秀吉死後的關原之戰當中，請求毛利輝元加入西軍，其後在南宮山布陣，得知小早川秀秋叛變反後，立即撤退。惠瓊扮成小沙門跟在毛利秀元散部之後溜走，到近江時，從那須一個村落逃向了朽木谷。他知毛利秀元私通東軍，那樣做乃是為了躲避危險。之後他越過山城坂，穿過八瀨和小原，潛入鞍馬山的月照院。可那裡也不能令人安心，於是，他又悄悄逃離鞍馬山，打算藏身於六條一帶，卻被與他素有私怨的樂鎮發現。由於樂鎮告密，惠瓊最終落於身在京城的家康女婿所司代奧平信昌手中。在京都東福寺被捕。與石田三成和小西行長共同斬首示眾。
惠瓊曾有過“信長は高ころびにあおのけにころろぶが、藤吉郎はさりとてはの者だ。”信長之死，秀吉之起果然實現，然而在關原合戰時卻未曾算到主家的騎牆與倒戈，毅然加入西軍，最後做了替死鬼，可謂是糊塗一時啊。1600年被斬首，享年61歲。
