孫超岷

孫超岷

孫超岷,博士,研究員。2014年1月作為中國科學院“百人計畫”引進到中國科學院海洋研究所,研究方向為海洋微生物活性物質的發掘和利用。

基本信息

人物簡介

孫超岷,博士,研究員。2014年1月作為中國科學院“百人計畫”引進到中國科學院海洋研究所,研究方向為海洋微生物活性物質的發掘和利用。

2002年9月至2006年6月在中國科學院微生物研究所攻讀博士學位,研究方向為海洋極端嗜鹽古菌遺傳作業系統的構建及蛋白類抗生素的產生及調控機理。

博士期間發現並系統研究了古菌域第一個Theta複製型質粒pSCM201的複製機理,研究結果發表在微生物學領域權威雜誌Journal of Bacteriology。

同時,系統闡述了極端嗜鹽古菌蛋白類抗生素C8的產生及調控機制,發現了一個基因同時編碼抗生素及其免疫基因的特殊生命現象,這在三域生命中為首次報導,研究結果發表在微生物學領域頂尖雜誌Molecular Microbiology上面。

2006年12月至2013年12月在美國著名大學University of California at Berkeley分子細胞生物學系進行博士後研究,研究方向為防治C肝病毒複製的蛋白類小分子藥物的篩選及其分子機制的研究。

期間,系統闡述了與C肝病毒複製緊密相關的人體蛋白DDX3及eIF3調控C肝病毒複製的分子機理,探討了上述兩個因子用於發展小分子蛋白類藥物防治C肝病毒複製的可能途徑。

尤其是關於蛋白翻譯起始因子eIF3的系列研究結果分別發表在國際著名刊物PNAS(美國科學院院報), Nucleic Acids Research,Structure上面,並申請國際發明專利1項。目前已經發表SCI論文12篇,其中第一作者6篇。目前為國際多種SCI雜誌如Virology Journal,Current Microbiology等的國際期刊的特邀審稿人。

目前,本課題組以中科院海洋所已有的海洋微生物資源為基礎,結合目前國內已有的海洋微生物活性物質庫,針對當前人類重要疾病(如腫瘤,C肝病毒等),臨床常見耐藥細菌(銅綠假單胞),海水養殖常見細菌病害(如鰻弧菌等)及重要農作物病害(如菸草黑脛病等),海洋生物污損(如硫酸還原細菌等)建立一系列活性篩選模型,尋找能夠抑制上述有害微生物的海洋微生物活性物質。

採用現代基因組學、分子生物學、生物化學、細胞生物學、結構生物學等技術手段,選取有顯著生物活性的重要活性物質為研究目標,深入了解其產生調控,抑制靶位點的分子機制,為新藥或新型材料的研究與開發提供理論基礎及先導藥物 。

承擔項目情況

1. 自然科學基金面上項目(Y52405101B),抑制C肝病毒複製的海洋微生物活性物質的篩選及分子機理研究

2. 海洋生物(百人計畫)(Y42416101Q)海洋微生物活性物質的發掘和利用

3. 農科院開放課題 (Y42422101E),抑制菸草重要病害的海洋微生物活性物質的篩選

研究論文

1) Sun C., Querol-Audi J., Mortimer S., Arias-Palomo E., Doudna J., Nogales E., Cate J. Two RNA-binding motifs in eIF3 direct HCV IRES-dependent translation. Nucleic Acids Research

2) Querol-Audi J#, Sun C#, Vogan J, Smith D, Gu Y, Cate J, Nogales E. Architecture of human translation initiation factor. Structure.

3) Sun C#, Todorovic A#, Querol-Audí J, Bai Y, Villa N, Snyder M, Ashchyan J, Lewis CS, Hartland A, Gradia S, Fraser CS, Doudna JA, Nogales E, Cate JH. Functional reconstitution of human translation initiation factor eIF3. PNAS

4) Sun C, Pager CT, Luo G, Sarnow P, Cate JH. Hepatitis C virus core-derived peptides inhibit genotype 1b viral genome replication via interaction with DDX3X. PLOS One.

5) Sun C, Zhou M, Li Y, Xiang H. Unidirectional theta replication of pSCM201, a novel structurally stable plasmid from extremely halophilic archaea. J Bacteriol

6) Sun C#, Li Y#, Mei S, Lu Q, Zhou L, Xiang H. A single gene directs both production and immunity of halocin C8 in a haloarchaeal strain AS7092. Molecular Microbiology

7) Miao D, Sun C and Xiang H. Construction and application of a novel shuttle expression vector based on haloarchaeal plasmid pSCM201. Acta of Microbiology

8) Mei S, Sun C, Liu X, Lu Q, Cai L, Li Y, Xiang H.. The Helix-Loop-Helix Motif at the N-terminal of HalI Is Essential for Its Immunity Function against Halocin C8. J Bacteriol.

9) Zhou L, Zhou M, Sun C, Han J, Lu Q, Zhou J, Xiang H. Precise Determination, Cross-Recognition and Functional Analysis of the Double-Strand Origins of the Rolling Circle Replication Plasmids in Haloarchaea. J Bacteriol.

10) Zhou L, Zhou M, Sun C, Xiang H, Tan H. Genetic analysis of a novel plasmid pZMX101 from Halorubrum saccharovorum: determination of the minimal replicon and comparison with the related haloarchaeal plasmid pSCM201. FEMS Microbiol Lett

11) Pei H, Liu J, Cheng Y, Sun C, Wang C, Lu Y, Ding J, Zhou J, Xiang H . Expression of SARS-coronavirus nucleocapsid protein in Escherichia coli and Lactococcus lactis for serodiagnosis and mucosal vaccination. Appl Microbiol Biotechnol,

12) Zhou M, Xiang H, Sun C, Li Y, Liu J, Tan H. Complete sequence and molecular characterization of pNB101, a rolling-circle replicating plasmid from the haloalkaliphilic archaeon Natronobacterium sp. strain AS7091. Extremophiles

13) Zhou M, Xiang H, Sun C, Tan H. Construction of a novel shuttle vector based on an RCR-plasmid from a haloalkaliphilic archaeon and transformation into other haloarchaea. Biotechnol Lett

14) Wang G, Li T, Sun C et al. Study on the fertilizer efficiency of tobacco fungicide T. virid and its colonization on tobacco leaf and root. Acta Tabacaria Sinica

專利

1. 向華,孫超岷.《一種極端嗜鹽古菌質粒及其衍生質粒載體》。公開日:2005.12.28, 中國

2. 向華,厲雲,孫超岷. 公開日:2006.9.27, 《一種嗜鹽菌素及其免疫蛋白和它們的編碼基因與套用》,中國

3.向華,周利剛,周梅先, 周堅,孫超岷. 公開日:2006.3.15, 《表達極端嗜鹽古菌紫膜蛋白突變體的載體及工程菌》, 中國

4. Chaomin Sun, Jamie Cate. Methods and compositions for inhibiting Hepatitis C Virus replication. International patent application.

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