基本組成
1 五樞穴配合陰陽五行
2 天干地支：1天干配合六十環周 2乾支分陰陽 3天干合化五行
3 天干配臟腑
4 地支配臟腑
臨床運用
子午流注納子法
按照針灸治療時間選取相應的五腧穴和原穴進行針灸治療的方法。常用的有“納子法”、“納甲法”，此外，還有養子時刻法，則以24分鐘為取穴的時間單位，每天輪流六十六穴，又稱一日取六十六穴法
子午流注納子法是按時辰的地支屬性來選取十二經脈五腧穴和原穴，每天輪遍十二經脈，是一種按時取穴法。又稱子午流注納支法。其具體方法是：①在該經脈經氣流注時辰，取該經適當的穴位進行針灸治療。②子母補瀉取穴法，實證時，在氣血流注至病經的時辰，取病經的子穴進行針灸（瀉法）；虛證時，在氣血流過病經的時辰，取病經母穴進行針灸（補法）；虛實不著的病證或補瀉時辰已過，取病經的本穴或原穴進行針灸。
子午流注納甲法
子午流注納甲法是根據針灸治療的目時辰與經脈對應關係圖棗寅肺、卯大腸的，時天干屬性，來選取十二經脈五腧穴和原穴，且以一個時辰為取穴時間單位，10天輪遍六十六穴的按時取穴法，又稱子午流注納乾法。具體方法是：①取穴原則。陽日（日天干屬陽），陽時（日天干屬陽）取陽經穴；陰日（日天干屬陰），陰時（日天干屬陰）取陰經穴。②合日互用。甲與己、乙與庚、丙與辛、丁與壬、戊與癸互為合日，在合日間可以互相套用相應時辰的開穴。
歷史記載
①按時配穴法。系以日時乾支推算人體氣血流注盛衰的時間，據此選配各經五輸穴進行針刺治療。見《子午流注針經》。子午，表示晝夜時間的變化；流注，表示氣血的運行。氣血循經運行隨著時間變化而有盛有衰，氣血盛時穴“開”；氣血衰時穴“闔”。《針灸大全》載《子午流注逐日按時定穴歌》，對開穴有具體記載。總的原則：陽日、陽時取陽經五輸穴；陰日、陰時取陰經五輸穴。日時乾支逢單為陽，逢雙為陰。十天干配合臟腑和經脈，即甲膽、B肝、丙小腸、丁心、戊胃、己脾、庚大腸、辛肺、壬膀胱，癸腎，三焦、心包絡併入壬、癸。例如甲日甲戌時開取膽經井穴足竅陰；丙子時開小腸經滎穴前谷；戊寅時開胃經輸穴陷谷，同時取膽經原穴丘墟，稱為返本還原；庚辰時開大腸經經穴陽溪；壬午時開膀胱經合穴委中，甲申時則開三焦經滎穴液門，稱為氣綱三焦。又如乙日乙酉時開取肝經井穴大敦；丁亥時開心經滎穴少府；己丑時開脾經輸穴太白，同時取肝經原穴太沖；辛卯時開肺經經穴經渠；癸巳時開腎經合穴陰谷；乙未時則開心包經滎穴勞宮，稱為血歸包絡。陽日陰時或陰日陽時無開穴（閉、闔），則可取其相合日乾的開穴，如甲日與己日通用，乙與庚、丙與辛、丁與壬、戊與癸等，稱做夫妻互用。若相合時均無開穴，可取十二經的子母補瀉穴，稱為子母互用。本法以日期的天干為主，因稱納甲（乾）法；以時辰地支為主的子母補瀉配穴則稱納子（支）法。
②針法著作。承淡安等編。書中闡解子午流注學說在針法上的套用。1957年由江蘇人民出版社出版。
