哺乳動物
澳洲界的哺乳動物只有少數幾個目有代表，最有代表性的哺乳動物是單孔目（原獸亞綱）和有袋目（後獸亞綱）。單孔目是澳大利亞和紐幾內亞的特產，共有三種，其中鴨嘴獸是澳大利亞特產，針鼴為兩地共有，原鼴原來也產與澳大利亞，但現在只見於紐幾內亞。有袋目並非起源於澳洲界，而可能是在岡瓦那大陸尚未分離的時候從南美經南極到達澳洲的，但是因為在澳洲缺少有胎盤類的競爭，有袋目在澳洲界得到最大的繁盛。有袋目包括一些人們最熟悉的澳洲動物，考拉、大袋鼠等幾乎成了澳洲的象徵。有袋目在史前時期的南美洲占據了食肉性動物和食蟲性動物的生態地位，而在澳洲則幾乎占據了哺乳動物的各個生態位，成為澳洲的主宰，並且進化出了與其它大陸的不同真獸類相對應的不同類型，從小型的食蟲類型直到大型的草食類型，現在也有人將有袋目進一步劃分成幾個不同的目。澳洲界的哺乳動物缺少體形巨大的成員，現存體形最大的肉食有袋類是袋獾，而最大的草食有袋類也是澳洲最大的陸生動物是大袋鼠。但是在史前時期動物的體型要大很多，肉食的袋獅體型和大型貓科動物相仿，而草食的雙門齒獸則大如犀牛。澳洲界原產的有胎盤類只有一些蝙蝠和嚙齒類，它們顯示出與東洋界的一些聯繫。蝙蝠中大蝙蝠亞目和小蝙蝠亞目的成員均有分布，這些蝙蝠和東洋界的比較接近。嚙齒類中僅有鼠科，但種類比較多，是鼠科的分布中心之一，並且有獨特的水鼠亞科。紐西蘭和太平洋島嶼的哺乳動物尤其貧乏，僅有蝙蝠和嚙齒類，有些小島則甚至沒有哺乳動物。其中髭蝠科是紐西蘭的特產，原本有兩種，現僅存一種。髭蝠是最適應地面行走的蝙蝠，在地面非常敏捷。
鳥類
澳洲界的鳥類很有特色，多是些獨特的類群，有些東洋界有一定聯繫，另外一些古北界的候鳥在澳洲界越冬。澳洲大陸澳洲界的鳴禽中按照西伯利的分類體系明顯以鴉小目的種類占絕對優勢，澳洲界絕大多數鳴禽都屬此類，而這裡也是鴉小目的起源和分布中心。鴉小目鳥類中最著名的是澳大利亞特有的琴鳥和主要分布於紐幾內亞的各種極樂鳥，琴鳥和極樂鳥也分別是澳大利亞和巴布亞新幾內的國鳥，這兩類鳥均以華麗的羽飾而著名，琴鳥還擅長模仿，而極樂鳥則有優美的炫耀舞姿。澳洲界比較常見的鴉小目鳥類還包括各種吸蜜鳥、園丁鳥、刺嘴鶯、細尾鷯鶯、鴝鶲、王鶲和鍾鵲等，這些鳥類為澳洲界最繁盛的類型，其中有些為澳洲界所特有，也不少也可見於鄰近的東洋界。澳洲界的攀禽以各種鸚鵡最為名，和新熱帶界同為鸚鵡的兩個分布中心，但新熱帶界只是種類多，而澳洲界遠更具多樣性。澳洲的鸚鵡中最有特色的是頭上有冠的各種葵花鸚鵡和色彩豐富的各種吸蜜鸚鵡，而虎皮鸚鵡則可能是世界上數量最多的鸚鵡。澳洲界另一類有特色的攀禽類翠鳥類，其中紐幾內亞島是翡翠的大本營，其中最有特色的是幾種美麗的極樂翡翠，而澳洲和紐幾內亞的幾種笑翠鳥則更加有名。澳洲界的鳩鴿類種類繁多，並盛產大型和美麗的種類，其中紐幾內亞的幾種美麗的鳳冠鳩是最大型的鳩鴿類，而一些小型的果鳩則甚至更加華麗。澳洲界的猛禽種類不是很多，其中晝行性猛禽中沒有舊大陸其它地區可見的兀鷲類，夜行性猛禽中只有鷹鴞和草鴞兩大類，這裡也是鷹鴞的分布中心。澳洲界的夜鷹類比較多樣，其中耳夜鷹、蟆口鴟和裸鼻鴟可以算是澳洲界的特色類型，而其中一些在臨近的東洋界也能見到。冢雉科是澳洲界代表性的雉雞類，以獨特的繁殖習性而著稱，並不靠體溫來孵化而是用類似爬行動物那樣將卵埋在地下。澳洲界是不會飛的鳥類的大本營。走禽類是岡瓦納的特色鳥類，在澳洲界非常繁盛，分布於澳大利亞的鴯鶓和分布於紐幾內亞以及澳洲北部的鶴鴕是僅次於鴕鳥的大型鳥類，鴯鶓也是出現於澳大利亞國徽上的澳洲象徵性動物之一。紐西蘭特產的幾維是紐西蘭的國鳥，也是紐西蘭的象徵。紐西蘭已經滅絕的恐鳥比鴕鳥更加巨大，其滅絕相信和人類的捕捉有關。在紐西蘭和太平沿島嶼由於與世隔絕，還有一些非走禽類也失去了飛行能力，包括一些秧雞和其他鳥類。紐西蘭和太平洋群島的鳥類種類雖少，但是有一些特有的類群，其中最著名的是特產於紐西蘭的刺鷯、垂耳鴉；特產於新喀里多尼亞島的瀕於滅絕的鷺鶴和特產於夏威夷的各種管舌鳥。這些與世隔絕的的鳥類適應能力比較差，目前有很多受到外來物種的侵擾而瀕於滅絕或者已經滅絕，如一些管舌鳥、吸蜜鳥、刺鷯和垂耳鴉。
爬行動物
澳大利亞和紐幾內亞的爬行動物種類繁多，除特有類型外，多與東洋界有一定的聯繫，而少數則和新熱帶界相關。其中最著名的是蛇類。澳大利亞是唯一毒蛇種類超過無毒蛇的地方，不少毒蛇毒性劇烈，其中內陸太攀蛇是世界上最毒的陸生蛇類，但是這些巨毒蛇全部屬於眼鏡蛇類，而沒有蝮蛇和蝰蛇類的成員，澳洲的那些樣子象蝰蛇的成員其實也是屬於眼鏡蛇類。其它各大陸均占優勢的無毒或微毒的游蛇類成員這裡卻非常少。澳洲的蟒蛇類種類比較多，是澳洲比較常見的無毒蛇。而紐西蘭和多數較遠的太平洋島嶼則沒有原產蛇類分布，在斐濟等大陸性島嶼上則有少量蛇類出現，另外一些島嶼有隨著人類擴散的鉤盲蛇。澳洲界是巨蜥的分布中心，巨蜥也是澳洲最強大的食肉動物之一，在史前還有一些體型非常巨大的成員，是大陸上的頂極食肉動物，而在華萊士區內的科莫多龍是現存體形最大的蜥蜴，也是最著名的巨蜥。澳洲界的蜥蜴中以石龍子類、鬣蜥類和壁虎類種類最多，另有一個和壁虎有一定親緣關係的特有的鱗腳蜥類。石龍子是爬行動物的最大一科，澳洲界和東洋界是其分布中心，在澳洲界有些體型最大的石龍子，其中最大的是索羅門群島的猴尾石龍子，第二大的是澳洲和紐幾內亞島的幾種藍舌石龍子。鬣蜥科也是以東洋界和澳洲界為分布中心，在澳洲界有一些最獨特的類型，如頭上有皮褶的傘蜥和身上有棘刺的魔蜥。斐濟等島嶼上的低冠蜥屬於在新熱帶界占優勢的鬣鱗蜥科的成員而不屬於澳洲界占優勢的鬣蜥科，對於研究動物的分布有一定價值。澳洲界的壁虎中也有一些大型成員，以新喀里多尼亞島的多趾虎體型最大，澳洲的一些壁虎有時被單列為澳虎科。鱗腳蜥科是澳洲界特有的類型，四肢退化而僅為鱗片狀，外形似蛇，多體型較小。澳洲的鱷魚種類不多，只有鱷亞科的成員，但名氣很大，其中灣鱷是現存最大的爬行動物，分布於東洋界和澳洲界，也是澳洲界最大的食肉動物。澳洲界的龜鱉類以蛇頸龜最有特色，顯示出和新熱帶界的一定聯繫。兩爪鱉則是形狀最奇特的龜鱉類，特產於紐幾內亞和澳洲北部。紐西蘭和太平洋島嶼上爬行動物種類較少，其中紐西蘭的楔齒蜥是現存最原始的爬行動物，其祖先可以追溯到恐龍誕生之時。
魚類
澳大利亞的淡水魚類特別稀少，在各界中是種類最少的，這一方面和澳洲界長期與世隔離有關，另一方面和澳洲大陸屬於世界上最乾旱的大陸，河網不發達有關。澳洲界真正的淡水魚多是非常原始的種類，如澳洲肺魚和一些鞏魚。澳洲肺魚Neoceratodus forsteri和恐龍時代的角齒魚非常相似，屬於同一類群，比非洲和美洲的肺魚更加原始，相差也比較大。鞏魚屬Scleropages於原始的骨舌魚類，為澳洲界和東洋界所共有，產於東洋界的俗稱“金龍魚”，而澳洲的稱為“噴點金龍”。澳洲界的淡水魚中還有不少為原本居住于海里後來移居到河流中的。
