外周耐受（peripheral tolerance）是指成熟的T、B 細胞，遇內源性或外源性抗原，不產生正免疫應答，而顯示免疫耐受。
外周耐受形成機制
1、克隆清除和免疫忽視。
對外周組織特異性自身抗原應答的T或B細胞克隆，不能均在胸腺/骨髓中被消除，它們離開胸腺後，存在於外周淋巴器官和組織中，有機會接觸自身抗原，如T細胞克隆的TCR對組織特異自身抗原具有高親和力，且這種組織特異自身抗原濃度高者，可經抗原提呈細胞（APC）提呈，但此類未經活化的APC表達的輔助刺激分子很少，不能提供第二信號，致此類被自身抗原活化的T細胞發生凋亡，克隆清除。
如T細胞克隆的TCR對組織特異自身抗原的親和力低，或者這類抗原自身濃度很低，雖由活化的APC提呈，因缺乏第二信號，不足以活化相應的初始T細胞，這種自身應答的T細胞克隆與相應組織特異抗原並存，在正常情況下，不引起自身免疫疾病的發生，稱為免疫忽視（immunological ignorance）。若將免疫忽視細胞以適宜量的自身抗原刺激，仍可致免疫正常應答。
2、克隆無能及不活化。
在外周免疫耐受中，自身應答細胞通常以克隆無能或不活化狀態存在。克隆無能和不活化由多原因所致，最常見者是不成熟樹突狀細胞（iDC）提呈的自身抗原，雖經過TCR-CD3活化，產生第一信號，但iDC不充分表達B7和MHCⅡ類分子，且不能產生IL-12，不能產生第二信號。
部分無能細胞易發生凋亡，而被克隆清除；部分克隆無能淋巴細胞仍能長期存活，在IL-2提供下，可進行克隆增殖，進行免疫應答，導致自身疾病。
自身應答B細胞也以類似原因，呈免疫耐受狀態。無能B細胞壽命較短，易由FasL+ Th細胞誘導表達Fas，而導致細胞凋亡，克隆清除。故B細胞耐受持續較短。
3、免疫調節細胞作用。
主要為CD4+CD25+Foxp3+的Treg細胞，其具有負調節作用。經細胞間的直接接觸，抑制CD4+和CD8+T細胞的免疫應答。
4、細胞因子作用。
