重點保護區
大興安嶺預防保護區 呼倫貝爾預防保護區 長白山預防保護區 灤河預防保護區 黑河綠洲預防保護區 塔里木河綠洲預防保護區 子午嶺預防保護區 六盤山預防保護區 三江源預防保護區 金沙江上游預防保護區 岷江上游預防保護區 漢江上游預防保護區 桐柏山大別山預防保護區 新安江預防保護區 湘資沅上游預防保護區 東江上游預防保護區
重點監督區
遼寧冶金煤礦開發監督區 晉陝蒙接壤煤炭開發監督區 陝甘寧蒙接壤石油天然氣開發監督區 豫陝晉接壤有色金屬開發監督區 東南沿海開發建設區 新疆石油天然氣開發監督區 三峽庫區監督區
重點治理區
東北黑土地治理區 西遼河大凌河中上游治理區 永定河治理區 太行山治理區 龍河區間多沙粗沙治理區 涇河北洛河上游治理區 祖厲河渭河上游治理區 湟水洮河中下游治理區 伊洛河三門峽庫區治理區 沂蒙山治理區 嘉陵江上中游治理區 丹江口水源區治理區 三峽庫區治理區 金沙江下游治理區 烏江赤水河上中游治理區 湘資沅澧中游治理區 贛江上游治理區 珠江南北盤江治理區 紅河中游治理區