嚴緊反應

嚴緊反應

當細菌在缺乏合成蛋白質所必須的胺基酸時,停止合成核糖體RNA的反應。

簡介

當細菌發現它們自己生長在飢餓的條件下,缺乏維持蛋白質合成的胺基酸時,它們將大部分活性區域都關閉掉。此就稱為嚴緊反應(stringent response),這是它們抵禦不良條件,保存自己的一種機制。細菌通過僅僅維持最低量的活性來節約其資源,直到條件改善時,它們又恢復活動,所有代謝區域也都活躍起來。

導致後果

嚴緊反應導致rRNA和tRNA合成大量減少(10-20倍),使RNA的總量下降到正常水平的5-10%,部分種類的mRNA的減少,導致mRNA總合成量減少約3倍。而蛋白質除解的速度增加,很多代謝進行調整,顯然核苷酸,碳水化合物,肽類等的合成都隨之減少。

嚴緊反應導致兩種特殊核苷酸積聚:(1)ppGpp—四磷酸鳥苷(在G的5'和3'位點各附著兩個磷酸);(2) pppGpp—五磷酸鳥苷(鳥苷5'一三磷酸-3'二磷酸)。

人們最初發現細菌在胺基酸飢餓時,出現兩種特殊的核苷酸,其電泳的遷移率和一般的核酸不同,感到很奇怪,就稱之為“魔斑Ⅰ”和“魔斑Ⅱ”,後來發現魔斑Ⅰ便是ppGpp,魔斑Ⅱ是pppGpp。

這些鳥苷是典型的小分子效應物,預期它們的功能是和靶蛋白結合改變它們的活性,有時它們被稱為(p)ppGpp。(p)ppGpp的功能是調節細胞活性大分子的協調性。它們的產物是由兩種途徑來控制的。在嚴峻的條件下嚴緊反應可以觸發(p)ppGpp的增加。一些未知因素的調節也會出現(p)ppGpp水平與細菌生長速度之間的反向協調。

任何一種胺基酸的缺乏或使任何氨基醯-tRNA合成酶的失活突變都足以起始嚴緊反應,此表明嚴緊反應的觸發器是位於核糖體A位點中的空載tRNA。當然在正常條件下僅有胺基酸-tRNA在EE-Tu的作用下位於A位點。但當胺基酸-tRNA對一個特殊的密碼子不能作出有效反應時,空載tRNA便能得以進入,當然這就阻斷了核糖體的進程,而觸發了一個空轉反應(idiling reaction)。

通過空轉反應產生(p)ppGpp的有關成分已通過鬆弛型突變(relaxed(rel)mutants)被鑑別出來。rel突變能去除嚴緊反應。這樣胺基酸的飢餓便不會導致合成任何穩定的RNA或者通常見到的各種其它的反應。

鬆弛突變大部分基因位點位於relA基因中,此基因編碼一種蛋白,稱為嚴緊因子(stringent factor)。此因子和核糖體結合,雖然它的總量較低-每200核糖體低於1分子的嚴緊因子。因此似乎只有在核糖體少量存在時才能產生嚴緊反應。

從嚴緊反應中分離的核糖體在體外能合成ppGpp和pppGpp。A位點是通過一個空載tRNA對密碼子的特異反應所提供的。從鬆弛突變體中提取的核糖體不能執行嚴緊反應,但若有嚴緊因子存在它們是能合成(p)ppGpp的。

(p)ppGpp的合成途徑,嚴緊因子(RelA)是一種(p)ppGpp的合成酶,它可以催化ATP將焦磷酸加到另一個GTP或GDP的3'位點。

當條件恢復到正常時,ppGpp怎樣被去除的呢?有一個基因叫做spoT,它編碼一種酶,主要的作用是催化ppGpp的降解。這種酶的活性導致ppGpp迅速降解其半衰期為20秒左右,因此(p)ppGpp合成結束時,嚴緊反應很快就消除。spoT突變會提高ppGpp的水平,並會慢慢增加。

RelA酶用GTP作為底物的頻率是較高的,所以pppGpp的產生是占優勢的。但pppGpp可以通過各種酶轉化為ppGpp,其中翻譯因子EF-Tu和EF-G是可以去磷酸化的。通過pppGpp產生ppGpp是最通用的路線,而ppGpp通常就是嚴緊反應的效應物。

核糖體對空載tRNA進入的反應與正常蛋白質合成的比較。當ET-Tu將胺基酸tRNA放在A位點時肽鏈隨著核糖的移動而合成;但是當空載tRNA在A位點與密碼子配對時,核糖體仍保持不動,並進行了空轉反應。

提純的RelA酶它本身實際是沒有活性的。而在核糖體存在時它才有活性。它的活性是由核糖體在合成蛋白中的狀態所控制的。此控制的特點是通過另一個位點的鬆弛突變而顯示,此突變原來稱為relC,現在弄清楚它就是編碼50S亞基L11蛋白的rp1K基因。

此蛋白位於A位點和P位點的附近,它在此位置對合適的配對作出反應,空載tRNA是在A位。L11蛋白或某些其它成分構象的改變可能激活RelA酶,這樣空轉反應就代替了肽醯-tRNA的轉位。

(p)ppGpp合成的每條途徑都觸發空載tRNA從A位點釋放出來,因此(p)ppGpp的合成是一種對空載tRNA水平的持續反應。在飢餓條件下,當氨基醯-tRNA不能對A位點的密碼子作出有效反應時,核糖體便停滯不前。空載tRNA的進入,觸發了(p)ppGpp分子的合成。並將空載tRNA排出,使A位重新空出來。核糖體是恢復多肽的合成,還是進行另一輪的空轉反應,關鍵是取決於氨基醯-tRNA是否有效。

ppGpp有什麼作用呢?它是一系列反應的效應物,包括抑制轉錄。許多反應已被報導,其中2個較為突出:(1)rRNA操縱子的啟動子其轉錄起始被嚴緊反應特異抑制了。嚴緊調節的啟動子發生突變能消除嚴緊控制,表明此效應需要和特異啟動子順序相互作用;(2)很多或大部分模板的轉錄延伸階段被ppGpp縮短了,此是RNA聚合酶停頓的增加而引起的。此效應反應了在細胞內加入ppGpp時轉錄效率普遍下降。現在尚不清楚這種抑制的特異性,若不同的操縱子之間這種抑制的變化很大,某些操縱子抑制作用更為顯著的活,也是不足為奇的。

異常核苷酸在兩種控制系統中都能發揮作用是很有趣的現象。這兩種途徑的抑制對細菌來說是特異的。在營養缺乏時烏苷觸發了嚴緊反應。而在缺乏葡萄糖時,cAMP觸發碳源利用的轉換。

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