著作
1.《仰韶文化研究》文物出版社1989；
嚴文明2.《中國通史（二）：遠古時代》上海人民出版社1994；3.《略論中國文明的起源》《文物》
4、《環境考古研究的展望》 《走向 21 世紀的考古學》三秦出版社
5、《史前考古論集》，科學出版社，1998年。
主要觀點
六十年代，在河南偃師附近的二里屯又發現了一個宮殿區，這個地方有一個墓葬，裡面有很多的青銅器，考古學家把他稱做二里頭文化。它的年代比鄭州商城還要早，但早在什麼時候，學術界一直有爭議，有的認為是商朝，有的認為是夏朝，有的認為是一個發展過程，前段時間是夏朝，後來發展到了商朝。在九十年代，在二里頭的旁邊又發現了一個偃師商城，年代和鄭州商城差不多，在兩個挨近的地方不可能有兩個商的都城，因此有的學者推斷是商滅夏以後，在夏原有的都城附近建了一個都城。又經過夏商周斷代工程，以及炭十二的檢測，基本確定了二里頭為夏文化。因此人類文明又推進到了夏朝，但是人類文明不可能一個早晨就形成了，夏文化的形成也一定是有個形成過程的，不管怎樣講，文明應是野蠻人創造的，因此學者都很一致的認為應在新石器時代去尋找人類文明的起源。
關於中華民族起源、中華文明如何發展演化的問題，一直夾雜在歷史和考古的雙重辨證發展中。嚴文明指出歷史的論證不同於考古發現。考古是科學，講究的是實證。因而在考古中，黃帝、炎帝究竟是否存在，它們是否具有不同文明體系，這些問題都是被忽略的。考古是拿具體的發掘實物——比如說石器物、骨器來說話。
嚴文明教授在北大考古文博學院的同事趙輝教授對此也表示認同。趙輝指出，由於缺乏文字的記載，對於黃帝、炎帝是否有其人，是否同為一人，都無法得到確切的結論。因而，在考古學上只是承認有黃帝、炎帝時代的存在，但具體的歷史細節卻無法得知。“雕龍碑遺址發掘情況表明了當時的一些基本情況，比如說房屋建築、新的發明，這些都是實在的，考古研究人員所做的恰恰只是這些，卻不能將其發現成果與神話傳說一一划上等號。
嚴文明表示，對於中華民族的起源，考古學上已可以追溯到一二百萬年之前，那些都是有科學依據的，但黃帝、炎帝的傳說卻不能作為考古推論的依據。儘管上世紀90年代便提出了牛河梁“女神廟”是否為炎帝族文化，但那一推論學界沒有得到共識。考古界一般將中華民族文明起源的問題劃歸到仰韶文化、紅山文化、龍山文化等概念範疇內。
考古研究
考古現場20世紀殷墟的發現，在中國乃至世界考古學界有著極高的地位。這座位於河南安陽、距今約3300年的商代遺址，是中國歷史上有文獻可考、並為甲骨文和考古發掘所證實的最早的古代都城遺址，20世紀考古發掘至今，一直受到海內外的極大關注。21世紀初良渚古城的發現，一向嚴謹的考古學界再度不吝言語，給予了高度評價。如張忠培教授和嚴文明教授都是中國考古學界的“泰斗級”人物，在記者以往的採訪中，二人都出言謹慎，不輕下判斷。而在實地考察良渚古城後，張忠培教授明確指出，良渚古城可稱為“中華第一城”，其意義不亞於殷墟的發現；嚴文明教授則專程從京來杭參加11月29日的新聞發布會，向媒體記者闡述此次發現的重大意義。
嚴文明表示，良渚古城的考古意義，不僅在於“以城論城”，還要結合良渚文化以及良渚遺址的重要性來認識。
良渚文化是分布於環太湖地區的史前考古學文化，位於浙江省杭州市餘杭區的良渚、瓶窯兩鎮的良渚遺址是其中心遺址和文化命名地。國家文物局曾明確提出，在目前發現的代表中國早期文明的大遺址中，良渚遺址的規模最大，水平最高，是實證中華5000年文明史的最具規模和水平的地區之一，是中國和人類的罕見的珍貴歷史遺產，具有十分突出的重要性。目前已被列入世界文化遺產的預備名單。
自1936年發現至今，40多平方公里的良渚遺址內已相繼發現墓地、祭壇、制玉作坊、建築基址、防護工程、聚落遺蹟等各類遺蹟135處。尤其到20世紀80年代後，考古人員對於其中反山、瑤山、匯觀山、莫角山等遺址的發掘，每每引起國內外學術界的轟動，並多次被評為“全國十大考古新發現”。但在考古學家看來，良渚遺址分布密集規模宏大、類型齊備、級差明顯，顯示出一個龐大而完整的帶有史前都城性質的空間形態和聚落布局，卻始終缺少一個十分明確的"中心"。如今良渚古城的發現，將莫角山大型土台、反山貴族墓地和莫角山周邊眾多遺址點組合為一個整體，為研究良渚遺址的整體布局和空間關係提供了新的資料。
“良渚古城可看作是良渚文明的'都城'。”嚴文明說，“這座令考古界期待已久的古城，對整個良渚遺址起到畫龍點睛的作用，點了睛後龍就活了。”
嚴文明說，把眼光放大一點，在中國文明的第一個高峰時期--夏商周，可以看到良渚文化時期特有的許多文化符號。如鼎、玉璧被當作重要的禮器。再如良渚文化玉器和一些陶器上的雲雷紋、獸面紋，也成了商周時期青銅器上的主體花紋。“後世中國的主體文化繼承了良渚文化很多因素。良渚文化對整箇中國文明的起源和發展起了非常巨大的作用。而現在我們發現了作為良渚文化'首都'的古城。只有放在這么大的背景下，你才能想到這個城的發現有多重要。”
古城評價
浙江省考古所發布重大考古成果——歷經18個月，在良渚遺址區內發現一座面積290萬平方米的古城(面積和北京頤和園差不多)。
專程趕來的著名考古學家、北京大學教授嚴文明這樣評價古城：
這是目前中國所發現同時代古城中最大的一座，稱得上是“中華第一城”；
它改變了原本以為良渚文化只是一抹文明曙光的認識，標誌著良渚文化其實已經進入了成熟的史前文明發展階段；
是繼上世紀河南安陽殷墟發現之後，中國考古界的又一重大發現，將極大推動中國文明史研究進程和考古學發展。
4000年前的城牆
比西安古城牆寬兩到四倍
這座古城，大致以良渚遺址區內的莫角山遺址(上世紀90年代初發現)為中心，東西長約1500-1700米，南北長約1800-1900米，略呈圓角長方形，正南北方向。
城牆部分地段殘高4米多，做法考究——底部先墊石塊，寬度達40-60米(中國現存最完整的古代城垣——明朝洪武年間建造的西安古城牆，底寬18米，頂寬15米)，上面堆築純淨的黃土，夯實。
根據城牆中出土的陶瓷碎片，這座古城的年代不晚於良渚文化晚期，也就是說，距今4000年以前。
良渚古城遺址稻田下的溝渠原來是護城河2007年6月，餘杭瓶窯鎮的葡萄畈村要建農民安置房，由於是遺址所轄範圍，考古人員先進場考古。
“先是在一片稻田下發現一條南北向溝渠，寬40多米，溝里有不少碎陶片，是良渚晚期的東西。”浙江省考古所良渚工作站站長劉斌說。
考古人員在溝渠東側挖了個坑，結果發現整塊土地其實都是人工夯築而成——土質為黃土，不同於良渚一帶灰黑色淤泥，明顯是人工從外面搬運而來。在黃土下面，鋪著一層石塊，石塊比較圓滑，應該是從周邊現成撿來的。
考古人員第一想法是，可能是河堤之類的水利工程；但也有人說，可能是城牆，因為在東側200米處，就是良渚文化中心的莫角山遺址——之後的挖掘證明了這個猜想，這大堆的黃土就是良渚古城的西城牆，稻田下的那條溝渠是護城河。
西城牆全長約1000米，寬約40-60米，南連鳳山，北接東苕溪；接下來，南城牆、北城牆和東城牆依次被發現，同樣是底部鋪墊石頭、大量黃土夯築；城牆環繞著中間的莫角山遺址。
與西城牆相比，其他三面城牆相對更考究：鋪墊的石頭尖銳很多，明顯是人工開鑿；城牆外側石頭相對大點，越往裡越小；堆築的黃土層中，有時會摻一層黑色的黏土層，增加了城牆防水能力。
考古人員推測，這些痕跡說明古人最先造的是西城牆，等到建其他三面城牆，經驗更豐富了。
曾經影響了半箇中國
城牆，是氏族社會和文明社會區別的一個重要標誌。
嚴文明教授說，說明良渚古城的意義，得站在“良渚文化對中國的影響”這個高度著手。嚴教授是這樣說的：
1986年，良渚反山遺址先被發現；這是個人工堆築的土丘，發掘出11座大型墓葬，有陶器、石器、象牙及嵌玉漆器1200多件。
瑤山遺址在反山東北約5公里，1987年發掘出12座墓葬，還有一座祭壇。
匯觀山東距反山約3公里，發現一座完整的祭壇和四座大墓。大墓中發現大量玉器，有意思的是，一般有玉鉞隨葬的，通常也有玉琮隨葬。
玉琮內圓外方，琮上一般雕刻著“神人獸面紋”的神秘圖案，只有掌握宗教權力的巫師才能持有；鉞是古代一種兵器，是軍事力量的象徵，持鉞者應是軍事首領；琮、鉞合葬，說明墓主既是軍事首領——王，又是宗教首領——巫。
很多人問，葬在反山、瑤山、匯觀山的這些權貴人物，生前生活在哪裡呢？不久，在良渚遺址群的中心地帶，發現了莫角山遺址，解決了這個疑問。
這是一個面積達30萬平方米的人工營造土高台，發現大片夯土層和夯窩等建築遺蹟，以及成排的柱洞，說明上面曾經有大型建築，另外還有6個供祭祀時用的大土坑。
這處罕見的良渚文化建築群遺址，從位置、布局和構造來看，有“中心祭壇”和“中心神廟”的性質，不少人認為良渚時期的中心就在這裡，上有宮殿，生活著王和貴族。
既然有王，有統治者，那是否當時已形成一個國家？“國”字外圍有個框，說明能稱為“國”的，外圍都有城牆。城牆，是氏族社會和文明社會區別的一個重要標誌。所以，現在終於找到了圍繞著莫角山的城牆，也可以說是期盼已久的事。
良渚文化距今5300-4000年，這個時代，目前中國大地上發現的古城約有60多座，小的只有10多平方米，大的為280萬平方米，面積達290萬平方米的良渚古城，是最大的。
良渚文化的分布主要在太湖流域，包括餘杭良渚這裡，還有嘉興南、上海東、蘇州、常州、南京一帶；再往外，還有擴張區，西到安徽、江西，往北一直到江蘇北部，接近山東，良渚人為了占領這裡，還曾經打了一仗；再往外，還有影響區，一直到山西南部地帶。
良渚古城的發現，有人認為中國的朝代的斷代應從此改寫——由現在認為的最早朝代為夏、商、周，改成良渚。
嚴文明教授說，需要留待考古進一步證明。但他也認為，良渚文化沒有消亡，而是在歷史的過程中，逐漸發展繼承下來了，並且明顯影響著以後的夏、商、周時代，像商周的青銅器上有一些良渚玉器上的花紋。
