呂孔學早年家境貧寒，生活維艱，為了養家餬口，經人介紹他在當時駐邑軍中當了一名功曹（專事記錄功績的一種職務）。他為人敦厚正直，謹慎謙讓，雖然職位低微，但他的品德卻頗受人敬重。
他不但是位謙謙君子，而且還是位遠近聞名的孝子。他事母甚謹，一日三餐母未食他不食。母親有病，他更是憂心如焚，精心侍候，直到痊癒。
雖然他對母親百依百順，但對子女的要求卻非常嚴格。不論家中生活怎么困難，也要敦促他們刻苦讀書。在他的嚴厲督導和言傳身教下，三個兒子都發憤圖強，學業有成，分別考選為稟生、拔貢和進士，尤其是長子呂維祺德才超群，深得朝廷倚重，崇禎年間曾任南京兵部尚書。
俗話說：“母以子貴，父以子耀。”呂孔學的兒子們個個都頗有作為，光耀門庭，就連地方官員也對他打拱作輯、禮敬有加。但呂孔學卻更加謙和謹慎，從不仗勢欺人。以前他在孩子尚幼、家道貧困的時候，財產曾被鄉鄰賈某惡意侵占。後來呂維祺達貴，家興業旺，呂家成為新安望族。這時賈某心存愧疚，更怕報復，終日惴惴不安。誰知呂孔學非但不與其計較，反而盡釋前嫌，主動與他交好。後來賈某家中有難，呂孔學極力相助，幫其脫困。不但賈某感激萬分，就連鄉鄰也無不稱頌。
他出身貧苦，後雖榮華富貴，但始終不忘鄉鄰，經常扶危濟困，急人所難，為他們做了很多的好事善事。不論認識與否，只要有求於他，他都會積極相助。所以，他家門庭若市，其中雖然不乏達官貴人，但大多數是前來求助的百姓。邑北窮山惡水，土地脊薄，不少百姓難以維持生計，更別說讓子女進塾讀書。為此呂孔學割地300畝當做“學田”，專為那些上不起學的學子捐獻書資。
有年天災，加之青黃不接，周圍百姓生活維艱，呂孔學拿出粟千餘斛、錢220餘紋賑之。
與橫山相隔十幾里的甘泉嶺煤礦，有年夏天在特大暴雨中井口塌陷，13名礦工被困井內。礦主看到事態嚴重便溜之大吉，十幾名礦工家屬圍在井口嚎啕大哭，束手無策。呂孔學知道後，立即出資組織人員進行搶救。經過數天挖掘，堵口終於疏通，被困礦工全部生還。他的這一善舉，不但使遇難礦工及家屬感恩戴德，地方官府也給予了高度褒獎。
呂孔學一生所行善舉多不勝數，特別是他當年出資修建的牛彰廣仁橋、北關尚義橋、狂口畛河橋、鐵門薛村橋，至今還仍造福桑梓，成為他德厚流光的歷史見證。
他雖為鄉紳，但深明大義。在他年事已高的時候，位居南京兵部尚書的長子維祺曾多次上奏朝廷欲歸故里侍奉父親，但概未準許。呂孔學知道後，即在信中勸說維祺道：“爾身，國家身也，為國不復家，勿以老人為念。”
後來他突患疾病，臥床不起，呂維祺方被朝廷恩準回家省親。鄉鄰鄉親聽說呂孔學有病，無不憂心忡忡，都盼他早日康復，長命百歲。但三個月後，呂孔學與世長辭。他卒後，葬於新安縣城南邊的呂家大山下。出殯之日，為他送行的百姓長達數里。之後，呂維祺為父親修建了神道石坊，並請大書法家王鐸為石坊楹聯撰書：“前澗水，後溫泉，腳登慕容；左鐵塔，右奎樓，懷抱泰山。”橫額：“風範天涯。”
