吳仲義[中科院基因所所長]

吳仲義[中科院基因所所長]
吳仲義[中科院基因所所長]
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吳仲義(Chung-I Wu)教授,1954年出生, 台灣省籍貫,曾任中科院基因所所長 ,中研院院士,博士生導師

基本信息

人物簡介

1976年 畢業於台灣東海大學生物系,

1982年 獲得加拿大英屬哥倫比亞大學遺傳學博士。

1986-1991年 羅徹斯特大學生物系任助理教授及副教授,

1991-1998年 任芝加哥大學生態和演化系副教授;任教授及系主任,2008年6月被聘為北京基因組研究所所長

吳仲義教授目前是中山大學長江講座教授,擔任分子系統遺傳及演化學 (USA)、遺傳學報 (USA)、美國自然學家期刊 (USA)、Genome Biology and Evolution (USA)、基因和遺傳系統 (Japan)、動物學報 (China)等期刊副主編。2004年,吳仲義教授被評為中研院院士。自80年代以來一直從事群體遺傳學的研究,在物種形成和自然選擇這兩個演化生物學領域中的基礎問題的研究上及在自私遺傳因子、分子時鐘、X染色體抑制及演化基因組學等領域的研究中做出了獨創性的貢獻。2005 年之後,吳仲義開啟新的研究領域,從microRNA著手解決物種形成的問題。在Science、Nature、PNAS等世界頂級學術期刊上發表論文論文近120篇。

從事工作

物種形成和自然選擇是吳仲義在分子演化工作中的主要研究方向。他80%的論文皆是這兩大問題的結合,主要貢獻是把物種起源研究帶到DNA水平上,進而觀測自然選擇的巨大作用;同時把自然選擇研究帶到全基因組的層次,否定了分子進化中性學說,也肯定了自然選擇的廣泛存在。2006年後吳仲義開發了microRNA的研究,由 microRNA 基因的特質探討物種起源的微進化機制。同時他在自私遺傳因子、分子時鐘、X染色體抑制、基因表達及演化基因組學等領域中也做出了獨創性的貢獻。

物種形成是演化學中最困難的問題。到1990年時?o種化的遺傳分析還十分粗糙?o分子研究更是遙不可及。吳仲義1992Nature的論文是種化遺傳分析的一個里程碑。此後他的實驗室引進大幅革新?o成為一個居於領導地位的研究群體。其主要研究成果常是《自然》/《科學》雜誌的評論主題。在1990到2000的十年中,吳研究室發表一系列30篇論文,定出了物種分化的大體遺傳結構。這些論文全在遺傳專業的頂尖期刊發表。他在2000年完成的成果,帶動了物種形成研究這10年的文藝復興,同時也為物種形成的分子層次研究奠定了基礎。

在分子演化領域中,中性學說已占主導優勢20餘年(Kimura,1983)。一直以來該學說批判自然選擇在分子水平上的重要性。吳仲義2000年Nature的論文與之前的工作闡述了性選擇的普遍性。他進而歸納了這個趨勢並以數據分析來證明自然選擇的廣泛性。此觀點與現階段分子演化研究主流學說背道而弛,復甦了因中性學說的興起而退引的新達爾文主義觀點。自然選擇作為分子演化主要驅動力量的觀點的從新提出,將激發演化學和人類遺傳學研究的新主流。吳教授正在著書,系統地探討自1983年以來遺傳學家在自然選擇方面的研究進展,並為今後的研究提出了新的方向及目標。

另外,在<<細胞>>;和<<;自然>>;雜誌上,吳仲義發表了有關衛星DNA在減數分裂驅動中作用的論文。這兩篇論文解決了減數分裂驅動的一大難題?o也是目前衛星DNA不全是廢物的最好證據。他與李文雄教授合作的工作是分子時鐘的研究的一個重要里程碑。其在<<;自然>>;雜誌上發表的另一篇論文則為進化過程中的DNA雙鏈不對稱研究提供了新的思路。近五年來其它學者的研究工作受他這篇論文的影響頗大。最近發表的一篇封面主題論文可望革新我們對於X染色體抑制演化的看法。

目前主要研究方向

目前的主要研究方向:癌症基因組學研究、miRNA的進化及其與目的基因的共進化研究

近期論文

1 Tang,H and C.-I Wu. A new method for estimating nonsynonymous substitutions and its applications to detecting positive selection. Molec. Biol. Evol. 23(2006):372-379.

2 Greenberg,A. J.,J. R. Moran,S. Fang and C.-I Wu. Adaptive loss of an old duplicate gene during incipient speciation. Mol. Biol. Evol.,23(2006):401--410.

3 Greenberg,A. J.,J. R. Moran and C.-I Wu. Proper control of genetic background with precise allele substitution: A comment on Coyne and Elwyn. Evolution 60(2006): 623-625.

4 Greenberg,A. J. and C.-I Wu. Molecular genetics of natural populations. Mol. Biol. Evol. 23(2006):883-886.

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6 Liu,X.,Y. Fu,(9 other authors),C.-I Wu,and A. Xu. An ancient balanced polymorphism in a regulatory region of human Major Histocompatibility Comlex is retained in Chinese minorities but lost worldwide. Amer. J. Hum. Genet. 78(2006): 393 - 400.

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9 Tang,T.,J. Lu,J. Huang,J. He,Y. Shen,K. Zeng,S. R. McCouch,M. D. Purugganan,S. Shi and C.-I Wu. Genomic variation in rice - Genesis of highly polymorphic linkdage blocks during domestication. PlosGenetics 2(2006):1824-1833.

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21 Yu,Y.,T. Tang,Q,Qian,Y. Wang,M. Yan,D. Zeng,B. Han,C.-I Wu,S. Shi and J. Li. Independent Losses of Function in a Polyphenol Oxidase in Rice - Differentiation in Grain Discoloration between Subspecies and the Role of Positive Selection in Domestication. Plant Cell 20(2008): 2946-2959.

22 Kohn,M. H.,J. Shapiro and C.-I Wu. Decoupled differentiation of gene expression and coding sequence among Drosophila populations. Gene and Genetic Systems 83(2008):265-273.

23 Wu,Q,Y. C. Kim,J. Lu,et al. M. Q. Zhang,C.-I Wu and S. M. Wang. Poly A- transcripts expressed in HeLa cells. PLoSOne 3⑺ (2008):e2803.

24 Wu,C.-I,Y. Shen and T. Tang. Evolution under canalization and the dual functions of microRNAsC A Hypothesis. Genome Research (2009,in press).

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