歷史沿革
1992年，中國人民解放軍獸醫大學改建為中國人民解放軍農牧大學以後，設立了農藝專業。
1999年4月，農牧大學更名為“中國人民解放軍軍需大學”，由農藝專業發展為農副業生產系。
2004年8月，原軍需大學移交教育部管理，與吉林大學合併，成立植物科學學院。
2014年，學院的植物保護專業成為首批教育部卓越農林人才計畫培養模式改革試點項目。
2018年，學院與加拿大阿爾伯塔大學開展“2+2”本科聯合培養項目。
學院風貌辦學條件
專業設定
據2018年11月學院官網顯示，學院有農學、植物保護、園藝、農業資源與環境、生物技術（植物）5個本科專業。
學科建設
工作檢查據2018年11月學院官網顯示，學院參與生物學博士後流動站的招生與建設，有學術學位二級學科博士點、學術學位一級學科碩士點2個、學術學位二級學科碩士點1個、農業碩士專業學位授權領域2個、吉林省重點建設學科1個；農業科學、植物與動物科學2個學科領域進入全球ESI排名前1%。
學術學位二級學科博士點：植物學
學術學位一級學科碩士點：作物學、植物保護
學術學位二級學科碩士點：植物學
農業碩士專業學位授權領域：農藝與種業、資源利用與植物保護
吉林省重點建設學科：作物學
師資力量
美國德州農工大學朱克岩教授到訪植物科學學院據2018年11月學院官網顯示，學院有專任教師和實驗技術教師78人，其中，教授19人、副教授23人、高級實驗師5人；擁有博士研究生導師9人，專兼職碩士研究生導師47人；擁有唐敖慶講座教授3人，國務院政府特殊津貼獲得者1人，教育部植物教學指導委員會委員1名，吉林省教學名師1人，吉林省拔尖創新人才4人，吉林省有突出貢獻的中青年專家2人，吉林省優秀教學團隊2個。
吉林省教學名師：潘洪玉
吉林省拔尖創新人才：潘洪玉、原亞萍等
吉林省有突出貢獻的中青年專家：潘洪玉等
吉林省優秀教學團隊：植物保護教學團隊、植物病理教學團隊
教學建設
•質量工程
據2018年11月學院官網顯示，學院有國家級“十二五”本科特色專業1個、教育部卓越農林人才計畫培養模式改革試點項目1個、吉林省高等學校“十二五”本科特色專業1個、吉林省普通高校“十三五”高水平專業（群）A類建設項目1個、吉林省高等學校本科品牌專業建設點1個、吉林省實驗示範教學中心1個、吉林省精品課程1個。
國家級“十二五”本科特色專業：植物保護
教育部卓越農林人才計畫培養模式改革試點項目：植物保護
吉林省高等學校“十二五”本科特色專業：植物保護
吉林省普通高校“十三五”高水平專業（群）A類建設項目：植物保護
吉林省高等學校本科品牌專業建設點：植物保護
吉林省實驗示範教學中心：植物科學實驗實踐教學中心
吉林省精品課程：普通昆蟲學
•學生成績
據2018年11月學院官網顯示，近年來，學院學生累計申請136項大學生創新創業訓練項目，其中國家級28項；在生物實驗技能大賽中獲省級一等獎2項、二等獎3項、三等獎1項；獲得“網際網路”創新創業大賽省級銀獎3項、創新科技競賽省級一等獎1項；在全國大學生基因套用創意大賽中獲全國冠軍。
學術研究
科研平台
科技服務地方大會據2018年11月學院官網顯示，學院參與國家玉米工程實驗室建設；擁有吉林省工程研究中心1個、吉林省工程實驗室1個、吉林省高校重點實驗室1個；建有吉林省現代農業推廣國際科技合作基地，被學校列為吉林大學國際現代農業示範推廣引智基地；設有7個校級實驗室。
吉林省工程研究中心：吉林省資源微生物工程研究中心
吉林省工程實驗室：吉林省植物遺傳改良工程實驗室
吉林省高校重點實驗室：作物基因工程吉林省高校重點實驗室
校級實驗室：植物種質資源與利用研究室、植物分子生物學研究室、玉米國家工程實驗室、有害生物綜合防治實驗室、寄主——病原分子互作實驗室、分子植物病理學實驗室、病原物抗藥性及殺菌劑毒理學實驗室
研究成果
據2018年11月學院官網顯示，學院主持和參加國家“十二五”和“十三五”國家重點研發計畫、科技部轉基因重大專項、科技部“雙減”項目、科技部“七大農作物育種”項目、國家自然科學基金和省科技廳等科研課題200餘項，契約經費累計8000餘萬元。先後獲得省部級科研成果20項，其中吉林省科技進步一等獎1項，省級科技進步二等獎4項。培育出13個作物新品種，獲植物新品種保護權5項。幾年來，公開發表論文近650餘篇，其中在《Science》、《PNAS》和《Plant Cell》等SCI期刊發表論文150餘篇，申請授權發明專利60餘項。
| 成果名稱 | 獲獎名稱 | 獎勵級別 | 獲獎時間 |
| 優質高產抗逆玉米新品種軍單8號的選育及推廣 | 吉林省科技進步獎 | 二等獎 | 2009年12月 |
| 高產、多抗、優質、廣適水稻新品種吉大3、吉大6選育與推廣 | 吉林省科技進步獎 | 二等獎 | 2011年12月 |
| 吉林省西部半乾旱區玉米豐產高效栽培技術研究與示範 | 吉林省科學技術獎 | 二等獎 | 2012年11月 |
| 葫蘆巴薯蕷皂苷等次生代謝產物生物合成基因的克隆和功能驗證 | 吉林省自然科學學術成果獎 | 二等獎 | 2013年9月 |
| 核盤菌子實體形成機制及大豆菌核病綜合防控技術的研究與套用 | 科技進步獎 | 一等獎 | 2013年12月 |
| 松嫩平原瘠薄農田水土調控關鍵技術研究與示範 | 科技進步獎 | 二等獎 | 2013年12月 |
| 大豆種子特異性soyAP1基因啟動子的分離及活性分析 | 吉林省自然科學學術成果獎 | 一等獎 | 2014年9月 |
| 大豆優異種質資源創製理論、技術與新品種選育及套用 | 吉林省科技進步獎 | 二等獎 | 2014年11月 |
| 吉林省半乾旱區玉米補水高產栽培技術研究與示範 | 吉林省科技進步獎 | 二等獎 | 2015年10月 |
| 植物及其內生真菌活性次生代謝產物的發現及生物合成等研究 | 吉林省自然科學學術成果獎 | 三等獎 | 2016年11月 |
| 玉米新品種吉大101選育推廣及其雜種優勢機理研究 | 吉林省科技進步獎 | 二等獎 | 2016年11月 |
| 高產、優質、多抗、耐冷廣適水稻新品種吉大718、吉大7選育與推廣 | 吉林省科技進步獎 | 二等獎 | 2016年11月 |
合作交流
據2018年11月學院官網顯示，學院與中國國內外十幾所高校與科研院所建立了科研合作關係，吸引一批人才來院工作；先後與美國、加拿大、日本、英國、德國、瑞典等10多個國家的大學、研究室開展學術交流與合作，為師生提供出國進修學習、攻讀學位、學術考察和合作研究等機會。
在中日韓三國教育部共同確定的“亞洲校園”項目資助下，學院與日本岡山大學每年互派學生交流學習。
文化傳統
形象標識
•院徽
吉林大學植物科學學院圖案：外環為"吉林大學植物科學學院"字樣，上為英文，下為中文。環內以“CPS”變形字母為主體，“綠色地球”為背景組成。“CPS”是“COLLEGE OF PLANT SCIERCE”的縮寫，組合形成一個抽象的“人”和人字，該人正張開雙臂用力向前奔騰跨躍。
顏色：圖案主色調為綠色，象徵植物。輔助色為白色，象徵和平與純潔。
含義：整個圖案莊重、大方，充滿激情，象徵著植物科學學院在吉林大學的平台上，以開放的姿態、以人為本、以人為中心、勇挑重擔、面向世界、跨躍式地攀登植物科學的高峰。
精神文化
•院訓：固本、開源、參天、盡物
固本：“固”為鞏固，“本”為人本、根本、基本。即學院辦學要以人為本，鞏固學生、教師在辦學中的主體地位。百年大計，教育為本；千秋大業，農業為基。
開源：“開”為開拓、解放，“源”為資源、源泉。即拓寬渠道，廣開辦學資源；解放思想，誠攬天下英才。
參天：“參”為探索、參悟，“天”為自然規律。即崇尚科學，探索規律；追求卓越，行健不息。
盡物：“盡”為完美、成就，“物”為教育事業。即錘鍊品格，完美人生；終身學習，成就偉業。
從字面上講，院訓中隱含“木”、“本”、“水”、“天”、“物”之意，體現了植物科學學院的特徵。
現任領導
| 職務 | 姓名 |
| 院長 | 都興林 |
| 黨委書記 | 張曉樓 |
| 黨委副書記兼副院長、紀委書記 | 李超 |
| 業務副院長 | 席景會、曹寧、韓俊友 |
| 行政副院長 | 馬利凱 |
