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原核生物系統學涉及對原核生物的分離、描述、鑑定、分類、命名和菌種的保藏等內容，可以看作現代原核生物分類學，是原核生物學的重要基礎學科。
鑒於現有的原核生物系統學著作篇幅大，且多為英文作品，如 “Bergy's Manual of Systematic Bacteriology” （伯傑氏系統細菌學手冊），筆者在廣泛聽取業內專家意見的基礎上，結合國內的實際需要，邀請國內原核生物各領域科研一線的專家撰寫了這本概括性較強的作品。
作為原核生物學的一本重要的工具書，本書可供微生物學、遺傳學、分子生物學以及其他生命科學領域的師生參考和查閱；也可供從事原核生物研究、教學和產業等人員閱讀參考。
內容提要
本書全面介紹原核生物的系統學，全書共分15章，包括概論、命名法規、生物信息學、菌種保藏和原核生物系統學研究方法等基礎部分。對原核生物的各個類群如古菌、細菌、放線菌等的論述則與《伯傑系統細菌學手冊》英文新版分類大綱相對應。本書的體系獨具特色，結構緊湊，前後連貫，反映了本學科的全貌和發展水平，正文之後的附錄兼有工具書的功能。
目錄
第1章原核生物系統學概論
1.1原核生物資源的多樣性及重要性
1.1.1代謝類型的多樣性
1.1.2生境的廣泛性
1.1.3生活方式的多樣性
1.1.4遺傳多樣性
1.2原核生物分類學和系統學的概念以及原核生物種的定義
1.2.1原核牛物分類學和系統學
1.2.2原核生物“種”的概念
1.3原核牛物分類簡史
1.4原核生物系統學研究進展與成就
1.4.1Woese的成就、古菌的發現及其分類學意義
1.4.2“複製基岡樹”和“蛋白質系統學”
1.4.3“基因組系統學”(Phylogenomics)
1.4.4以全基因組為基礎的胺基酸組分矢量法在原核生物系統學中的套用
1.5原核生物系統學與其他學科的關係
1.6《伯傑氏系統細菌學手冊》第2版簡介
參考文獻
第2章細菌命名法規及其在原核生物分類中的套用
2.1國際細菌命名法規
2.1.1俗名和學名
2.1.2早期生物命名簡況
2.1.3命名法規的性質和意義
2.1.4細菌命名法規的緣起
2.1.5國際細菌命名法規的內容簡介
2.1.6名稱的優先權和發表
2.1.7名稱的引用
2.1.8異物同名和同物異名
2.1.9細菌名稱及其有關信息的查詢
2.1.10漢譯細菌名稱
2.1.11公認名稱與非公認名稱的使用
2.2與細菌分類和命名有關的悶際學術機構及其相關刊物
2.3《細菌名稱的確認名錄》
2.4細菌名稱的合格化及其於續
2.4.1新名稱和(或)新組合被國際學術界所承認的一般要求
2.4.2有效發表的合格化
2.5細菌名稱的套用
2.6對不合法規的細菌命名的更名
2.6.1細菌命名的原則
2.6.2對細菌命名違規的處理示例
2.7原核生物分類中暫定名稱的分類地位
2.7.1原核生物暫定名稱的概念
2.7.2確立暫定名稱的原核生物應注意的要點
2.7.3暫定名稱原核生物系統學示例
2.8國際生物命名法規的協調與統一
2.8.1生物命名法規協調與統一的背景
2.8.2生物命名統一法規(BioCode)的構想和活動
2.8.3生物命名法規統一對細菌命名的影響
參考文獻
第3章生物信息學在原核生物分類中的作用
第4章菌種保藏在原核生物分類學研究中的作用
第5章原核生物多相分類技術與套用
第6章原核生物的分子生態學研究
第7章古菌域
第8章細菌域第Ⅰ至第Ⅸ門
第9章細菌域第Ⅹ門——藍細菌門
第10章細菌域第Ⅺ門
第11章細菌域變形桿菌門
第12章低GC含量革蘭陽性細菌
第13章放線菌
第14章細菌域第ⅩⅤ門至ⅩⅦ門
第15章細菌域ⅩⅧ門至ⅩⅢ門
附錄
