軍隊編制
印尼海軍艦隊印度尼西亞海軍（簡稱印尼海軍）由海軍總部機關、勤務機構以及海軍部隊三部分組成。印尼海軍的任務為在國防安全部長兼武裝部隊司令的指揮下，負責海上防禦。與大多數國家不同的是，印尼海軍還明確承擔著維護海上治安的任務，這也是在印尼海域經常發生印尼海軍艦艇向外國漁船開火事件的主要原因。印尼海軍部隊按性質分為機動部隊和區域部隊，機動部隊即作戰部隊，主要由東、西部兩大艦隊和海軍陸戰隊組成；區域部隊主要指勤務支援部隊，包括海運部隊和岸勤部隊，勤務機構主要包括訓練中心、海軍基地、海軍站以及海軍哨所等單位。
特殊的群島地理環境，使印尼的東西總長達到了5000餘公里，南北寬約2000公里，海岸線的長度達到3.5萬公里，為了適應狹長的島嶼分布情況，印尼海軍分別設立了東部和西部兩大艦隊。東、西部艦隊司令部是印尼海上作戰兵力的指揮機關，主要負責各級艦艇部隊的基礎訓練、作戰指揮、行政管理等等。
從2004年開始，印尼海軍在東、西部兩大艦隊之外，專門設立了一支“印度尼西亞海軍作戰機動待命部隊”，兵力由東、西部艦隊集中抽調，目前該部隊主要兵力包括：護衛艦9艘、坦克登入艦7艘、油船兩艘、貝爾-412型直升機兩架以及陸戰隊1個連和1個蛙人小隊。該機動作戰部隊的主要任務為實施海上戰略機動打擊以及奪控敏感海區和有爭議的島嶼。
經過近幾年的編制調整與裝備換代，目前印尼海軍總兵力5萬餘人，共擁有各型艦船145艘，其中飛彈護衛艦17艘、護衛艦16艘、潛艇4艘、飛彈艇4艘、掃雷艇12艘、巡邏艇28艘、坦克登入艦28艘、登入艇3艘、兩棲運輸艦5艘、其他輔助艦隻28艘；海軍航空兵裝備各型飛機79架，其中輕型運輸機14架、偵察巡邏機36架、反潛與運輸直升機24架以及教練機5架，在東南亞各國海軍中，印尼海軍的總體規模與質量處於前列。
另外，印尼海軍在2003年還制定了一項頗具雄心的裝備發展計畫，準備在未來數年內購買24艘新式護衛艦、16艘大型巡邏艇，並自行建造20多艘快速攻擊艇，並加速提高海軍艦艇的現代化改造步伐。
訓練體制
巡航艦出航印尼海軍在近幾年的高速建設和發展過程中，十分重視軍事訓練工作，並形成了具有印尼特色的海軍訓練體制。一方面，印尼海軍重視發揮院校和教育、訓練中心的作用，根據海軍力量和管轄區域分布較為分散的特點，印尼依託大量的海軍基地，形成了以重點院校為中心、以8大主要海軍基地為骨幹、以數十個地方基地為覆蓋的教育訓練機制。印尼海軍認為，嚴格的規範化的訓練，是使部隊掌握現代科學技術、提高戰術技術水平和部隊戰鬥力的根本保證，是加速海軍現代化建設的重要途徑。至2005年，印尼海軍已開辦各種院校16所，教育、訓練中心20餘個。如海軍學院、參謀與指揮學校、航空學校、火箭與飛彈學校、炮兵學校、潛水員學校、水兵教育中心、技術教育中心、海上作戰訓練中心、登入部隊訓練中等。印尼海軍要求，不論是軍官還是士兵，都必須經過院校或教育、訓練中心的嚴格培養，考試合格後，才能分配到部隊去。為了按發展規劃培養海軍各類專業人才，印尼海軍各院校和教育、訓練中心根據其使命任務，學員必須經過理論知識和實際操作技術的考試，合格後方可畢業。為檢驗院校的教學質量和學員的學習成績，提高學員協同意識，加強理論與實踐的套用，印尼海軍每年還會組織院校舉行1－2次軍事演習。
另一方面，印尼海軍注重通過大強度的軍事演練提高部隊素質。強調部隊訓練必須同其擔負的使命任務和實戰密切結合，認為只有在近似實戰條件下多演練、嚴演練，才能練出能應付未來海戰的精兵。2000年以來，印尼海軍每年單獨舉行或與陸空軍聯合舉行以及與盟國等聯合舉行的各類演習，最多達40餘次。印尼海軍的演習大致可分為以下幾類：一是印尼海軍單獨或與陸空軍聯合舉行的演習；二是印尼海軍與新加坡、馬來西亞、菲律賓等東協國海軍舉行的聯合演習；三是印尼海軍與美國、英國、澳大利亞等國海軍聯合舉行的“航行通過”演習。
另外，印尼力求海軍訓練方式的多樣化，並將訓練與日常戰備巡邏緊密結合。為提高部隊的訓練質量，印尼海軍把院校訓練與部隊訓練，分散訓練與集中演練有機結合起來，根據訓練的時間、內容、標準和要求，採取了多種訓練方式。印尼海軍每年組織1－2次較大規模的海上集中演練活動，參訓的兵種有水面艦艇、海軍航空兵和後勤部隊。演練的科目有海上對抗、艦機協同、防空、反潛、戰術機動、通信、後勤補給和電子對抗等。印尼海軍稱“通過組織部隊舉行一定規模的演練，大大提高了印尼海軍的整體作戰能力”。由於南海南部、馬六甲海峽等海域海盜猖獗，非法活動頻繁，印尼海軍把訓練與打擊海盜，驅趕、抓扣進入印尼海軍控制海區“非法活動”的船隻結合起來，在保護海區安全、維護海上權益的同時，進行對海上目標搜尋與跟蹤、海上攔截、航渡等科目的演練，增強了訓練的實用性。
近年來，印尼當局除了陸續制定領海管制措施和外國漁船進入印尼領海的規定外，還要求海軍加強巡邏緝捕。印尼海軍司令曾警告說：“為了捍衛國家領海主權和經濟利益，印尼海軍將擊沉在印尼海域非法捕撈的外國漁船。”2003年1月27日，印尼海軍擊沉了“侵入”印尼領海的4艘菲律賓漁船，並拘捕了49名船員；2月5日，印尼海軍在東印尼俄侖打洛省海域拘捕了23艘中國漁船。此外，遭到盤查、扣留或槍擊的還有美國、越南、日本及台灣等國家和地區的漁船。戰訓結合的方式，也使得印尼成為東南亞地區海軍實戰開火最為頻繁的國家。
兩棲作戰力量
島嶼位置分散、國土東西跨度較大的客觀現實，使得印尼海軍一直十分重視其兩棲力量的建設。在印尼海軍的艦艇編制中，用於兩棲作戰的登入艦艇和運輸艦艇就達到了36艘，占其艦艇總數的24.8%。為了實現對所屬數千島嶼的有效控制，印尼通過設立大量海軍前進基地的方式，構建出以爪哇、蘇門答臘、加里曼丹、伊里安查雅等大島為核心、以群島為基地，內外兼顧、獨立防守與機動作戰相結合的防禦體系，在這一防禦體系中，海軍陸戰隊起著至關重要的作用。
印尼海軍陸戰隊共下轄兩個陸戰步兵旅、15個陸戰營，總兵力約15000人。陸戰隊司令部與海軍訓練司令部、東部艦隊司令部、西部艦隊司令部以及軍事海運司令部平級，成為印尼海軍五大司令部之一。在編制體制上，印尼海軍陸戰隊也有其獨特的一面，陸戰隊除了在爪哇、蘇門答臘、加里曼丹等各主要島嶼部署了分別歸屬第一、第二陸戰旅的10個陸戰營外，還設立了直屬東、西部艦隊的5個陸戰營。東部艦隊陸戰隊下轄快速打擊部隊特遣隊、沙塔爾特遣隊、駐芝拉扎特遣隊、布尤特遣隊、忠誠活動部隊等共約3個營的兵力。西部艦隊陸戰隊下轄駐納土特遣隊、雅亞特遣與防暴分遣隊、忠誠活動部隊、亞齊刀特遣隊等共約兩個營的兵力。另外，由於海軍陸戰隊司令部與印尼海軍總部、海軍訓練司令部、西部艦隊司令部同在雅加達，因此海軍陸戰隊也擔負著雅加達印尼海軍總部機關駐地的保衛與警戒任務。
火箭發射器在武器裝備方面，印尼海軍陸戰隊一直處於整個軍隊裝備配置的優先地位。東南亞金融危機後，在軍費嚴重不足的情況下，海軍陸戰隊仍然購置了一批兩棲偵察設備，並進行了大強度的拉練演習。目前，印尼海軍陸戰隊共擁有兩棲坦克80餘輛、裝甲偵察車20輛、步兵戰車10餘輛以及105毫米以下口徑火炮數十門。陸戰隊在平時訓練中也十分注重與登入艦艇的作戰配合，印尼海軍所屬大型登入艦通常擁有較強的火力配置，如“朗沙港”級坦克登入艦(滿載排水量4080噸)裝備有17門37－40毫米口徑的速射火炮。2003年，印尼海軍陸戰隊就進行了6次大型兩棲登入演習，占整個印尼海軍年度演習的55%。
在編制體制方面，儘管根據2003年版印尼《國防白皮書》的要求，印尼軍隊進行了大幅度的整編和部分縮減，但是印尼海軍陸戰隊的規模卻在不斷上升。2003年12月初，為了提高海軍的快速反應能力，印尼成立了第七海軍陸戰營，隸屬於駐雅加達的第2陸戰旅。2004年2月17日和8月21日，印尼海軍又先後在雅加達和皮亞崩成立了第八和第九陸戰營，將其分別編入第1和第2陸戰旅。根據印尼陸戰隊司令部制定的中期規劃，印尼將在2010年前把印尼陸戰隊的規模擴充至兩萬人，使其成為東南亞地區最具攻擊力的兩棲突擊力量。
潛艇部隊
印尼海軍在東南亞各國海軍中，印尼是最早擁有潛艇部隊的國家。建國初期，印尼就從蘇聯進口了12艘W級潛艇，建立了一支規模可觀的水下艦隊。但是從上世紀中期以來，印尼海軍裝備的潛艇逐漸老化、退役，潛艇的數量迅速下降。在此期間，印尼曾多次試圖外購高性能潛艇，以維持潛艇部隊規模和作戰能力。在20世紀90年代，印尼海軍制定了兩次採購計畫，準備從德國引進兩艘209型潛艇以及5艘小一些的206型潛艇，但都由於各種各樣的原因未能如願。於是印尼改變了一次性大量購進潛艇的計畫，採取了少量購買的方針。目前，印尼共擁有4艘德制潛艇(舷號401-404)。
儘管在潛艇的數量上不能與建國初期同日而語，但印尼海軍卻實現了原蘇制潛艇向德制潛艇的轉變，在潛艇先進水平上提高了一大步。另外印尼海軍也十分重視潛艇人才的儲備工作，如在接收206型潛艇時，印尼方面派出了60餘名預備潛員前往德國受訓，當時的東部艦隊司令部新聞局發言人海軍中校達斯•艾迪•伊拉指出：“赴德國學習的目的，是使所有參加培訓的潛艇人員能掌握潛艇的性能、平時及戰時的技術操作，以及指揮職能和作戰職能的要領，以便為印尼海軍潛艇部隊的繼續壯大儲備急需的專業人才。”2004年1月，印尼海軍提出了在東、西部兩大艦隊各配置10艘先進潛艇的宏偉計畫。鑒於印尼擁有過指揮較大規模潛艇部隊的經驗，可以預見，印尼海軍可能在不遠的將來就會恢復昔日東南亞第一水下艦隊的輝煌。
水面艦艇
印尼海軍的主要力量，是水面艦艇部隊，其規模在東南亞海軍中都較為可觀。目印尼水面艦艇以護衛艦和輕型護衛艦為主。護衛艦大多為二手艦隻，主要是6艘亞尼級護衛艦。該級艦原為荷蘭皇家海軍上世紀60年代中期服役的范·斯佩克級護衛艦，總服役年限已近半個世紀。經過多次改裝後，該級艦於1986年加入印尼海軍。其滿載排水量為2835噸，裝8枚魚叉飛彈，2座西北風防空飛彈發射架，1座奧托·梅萊拉76毫米炮。2座3聯裝324毫米MK32魚雷發射管，可搭載一架NBO-105C直升機。還有1艘2000噸級的沙馬迪坤級護衛艦，原為美制克勞德·瓊斯級護衛艦，只裝備火炮和魚雷，於1959年服役。
鑒於護衛艦的現狀，印尼十分重視輕型護衛艦的發展，目前共有23艘，性能也較為先進，最精銳的是4艘西格瑪級護衛艦。該級艦是2003年底通過國際招標選中的。西格瑪級以荷蘭海軍德·澤芬省級飛彈護衛艦為母型，採用模組化設計建造，其艦型簡潔、武備精良，且有較高的穩定性、良好的隱身性及較強的生命力。2004年10月，首批2艘艦在荷蘭正式開工建造，第二批艦原計畫以技術引進的方式在印尼境內建造，但最後仍有斯格爾德船廠承建，並於2009年全部服役。該級艦滿載排水量1700噸，最大航速28節，18節時續航力為4000海里。其採用當今世界上最先進的MACS3000綜合平台管理系統，以及荷蘭泰利斯公司提供TAC-TICOS作戰管理系統。MACS3000綜合平台，將艦上的推進、電站、損管、監視、操控和輔助決策等自動化設備和系統，連線成可進行集中管理的網路系統，使艦上人員在單一綜合監控操縱平台前就能監視並操控整艘艦，從而提高船艦的智慧型化水平。TAC-TICOS作戰管理系統，是艦上分散式感測器、武器和指揮控制的中樞，通過4個MK-3多功能操作控制台，實施反艦、防空、反潛戰，可對海上機動、電子戰、戰術圖像編輯等進行目標管理，並通過LINK-Y數據鏈與其他平台進行戰術數據交換。該級艦裝備4座法制MM40“飛魚”反艦飛彈發射架、2座4聯裝“特拉爾”艦空飛彈發射架（發射“西北風”輕型超近程對空飛彈）、2座三聯裝324毫米魚雷管（可發射MU90輕型反潛魚雷）、1座“奧托·梅萊拉”76毫米速射炮和2座“吉亞特”20毫米近防炮。其艦艉有寬大的直升機平台，可搭載大中型直升機。艦上還留有不少空間，可根據要求隨時安裝新的任務模組。
上世紀90年代初，印尼海軍還接收了大量原東德海軍的艦艇，大多為輕型艦隻，其中16艘帕契姆I型輕型護衛艦構成其海軍的主力。該型艦被稱為卡皮坦·帕提莫拉級護衛艦，1993年加入印尼海軍。其排水量769噸，裝備1座雙聯裝57毫米炮、1座雙管30毫米近防炮，4具400毫米魚雷管，2座RBU6000反潛火箭發射裝置，還裝有SA-N-5或“西北風”對空飛彈。此外，印尼還有3艘1979年服役的法塔希拉級輕型護衛艦，滿載排水量1450噸，裝備有4枚MM38“飛魚”反艦飛彈，1座“博福斯”120毫米炮、1或2座“博福斯”40毫米艦炮、2座20毫米高射炮，2座三聯裝324毫米MK32魚雷發射管（可搭載12枚MK46或A244S魚雷），具備一定作戰能力。不僅如此，印尼海軍的快艇部隊也有較強實力，擁有4艘飛彈艇、20餘艘大型巡邏艇以及11艘水雷艇。
軍事訓練
印尼海軍十分重視軍事訓練，並逐步形成了具有特色的海軍訓練體系。首先，印尼海軍重視發揮院校和教育、訓練中心的作用。根據海軍力量及轄區分布較為分散的特點，印尼依託大量的海軍基地，形成了以重點院校為中心，以8大主要海軍基地為骨幹、以數十個地方基地為覆蓋的教育訓練機制。至2005年，印尼海軍已開辦各種院校16所，教育、訓練中心20餘個。海軍要求，無論軍官還是士兵，都必須經過院校或教育、訓練中心的嚴格培養，開始合格後，才能分配到部隊去。為檢驗院校教學質量和學員的學習成績，提高學員協同意識，加強理論與實踐的套用，海軍每年還會組織院校舉行1~2次軍事演習。
其次，印尼力求海軍訓練方式多樣化，並將訓練與日常戰備巡邏緊密結合。海軍把院校訓練與部隊訓練、分散訓練和集中訓練有機結合起來，其每年組織1~2次較大規模的海上集中演練活動，參訓的兵種有水面艦艇、海軍航空兵和後勤部隊。由於部分海域海盜猖獗、非法活動頻繁，印尼海軍把訓練與打擊海盜、非法活動結合起來，在保護海區安全、維護海上權益的同時，進行對海上目標搜尋與跟蹤、海上攔截、航渡等課目的演練，增強了訓練的實用性。這種戰訓結合的方式，使得印尼成為東南岩地區海軍實戰開火最為頻繁的國家。
此外，印尼海軍還注重通過大強度的軍事演練提高部隊素質。2000年以來，印尼海軍每年單獨舉行或與陸空軍聯合舉行以及與盟國等聯合舉行的各類演習，最多達40餘次。2011年以來，印尼海軍更加活躍，大小演習、交流不斷。5月27日至29日，印尼與美國在印尼巽他海峽舉行陸戰隊聯合演練。其中，印尼派出1137人、4艘戰艦、3架直升機和5艘登入艇參加演習；美國海軍陸戰隊則派出1600人、3艘登入艦、“霍華德”號飛彈驅逐艦和快艇、海軍陸戰隊兩棲登入部隊、P-3C獵戶座反潛巡邏機和SH-60救援直升機參加演習。
這種積極主動的動作，使印尼的“綠水”海軍規劃相得益彰。據《簡氏防務周刊》報導，在印尼發展計畫中，艦隊將由2個增至3個，而其艦艇數量將達到274艘，海軍航空兵飛機數量也要達到137架，4艘先進的西格瑪級護衛艦正是計畫的一部分。印尼海軍僅擁有2個大基地和23個小基地，其計畫在2024年前擁有59個基地，新的基地將包括11個主要基地、24個海軍基地、21個海軍站。儘管由於政治、經濟的干擾，建設計畫並未順利實現，但其長遠目標並未改變。內修“真氣”，外連盟友，印尼海軍的“綠水”計畫，正在有條不紊地展開，其動向值得關注。
發展事件
採購戰車
2007年12月印度尼西亞國防部表示，印度尼西亞海軍陸戰隊即將採購20輛新型步兵戰車，以增強其作戰能力。日前海軍陸戰隊已經將這份申請正式提交了印度尼西亞國防部，並得到了國防部的支持。
印度尼西亞國防部同時表示，此次印度尼西亞海軍陸戰隊將採購20輛俄羅斯產BMP-3F新型步兵戰車。同時向俄羅斯採購的項目還包括17架米-17多用途直升機，5架米-35P型武裝攻擊直升機和2艘“基洛”級或“拉達”級核潛艇。據報導，採購總價值將達到1億美元。[2]
購買艦艇
印度尼西亞海軍計畫從2010年開始更新裝備，努力實現保有最低限度有效武力的目標。《雅加達郵報》2009年1月30日引用印尼海軍參謀長阿古斯·蘇哈托諾的話說，2010年印尼海軍將購買巡洋艦、坦克登入艇、飛彈快艇和訓練艦等艦艇。
他還透露，印尼海軍已經簽訂了購買3架CN－235海上巡邏機的契約，計畫購買一艘長達105米的高桅橫帆船，並將於2010年部署35輛俄制BMP－3F兩棲戰車。阿古斯還說，蘇西洛總統已經決定，如財政狀況允許，將在2014年購買兩艘潛艇。
阿古斯說，2010年印尼海軍的任務重點是防守與外國接壤的海域疆界。印尼有92個外圍島嶼與外國接壤。
