歷史淵源
電子科學與工程系的歷史可追溯到上世紀五十年代初先後由魏榮爵和鮑家善教授在南京大學創設的聲學和無線電物理學學科與專業。自設立以來，這兩個專業先後為新中國培養了大批從事套用物理學和電子信息科學技術的高級科技人才，為新中國的社會主義建設和科學技術的發展做出了重要的貢獻。
進入上世紀八十年代，電子與信息科學技術呈加速度發展，並逐漸影響社會、經濟、軍事等人類各個領域。為了適應電子與信息科學技術的快速發展對人才的迫切需求和南京大學自身學科發展的需要，1984年，以聲學和無線電物理學學科（專業）和有關電子技術教研室（組）為基礎，正是組建了信息物理學系。1994年，更名為電子科學與工程系。
發展現狀
自1984年建系以來，在學校和系歷屆黨政的正確領導下，在全體教職員工的艱苦努力下，電子科學與工程系在學科建設、人才培養和科學研究等各方面得到了蓬勃的發展和長足的進步。
學科建設
電子系現有聲學、無線電物理學、電路與系統、信號與信息處理以及通信與信息系統五個二級學科。這些學科橫跨物理學、電子科學與技術和信息與通訊工程三個一級學科，其中聲學和無線電物理學均為國家重點學科。
師資力量
電子系師資力量較雄厚，擁有正副教授50餘名，其中包括中國科學院院士2人和博士生導師22人。近幾年來，我系致力於學術梯隊的建設，注重引進和培養優秀中青年骨幹和學術帶頭人。現有“長江學者獎勵計畫”特聘教授、“國家傑出青年科學基金”獲得者和教育部“跨世紀優秀人才”等一批優秀青年學者,他們已經成為各學科新世紀的學術骨幹和學術帶頭人。
辦學規模
電子系專業設定全面，設有電子信息科學與技術、通信工程、聲學和生物醫學工程四個本科專業，信號與信息處理、通信與信息系統、電路與系統、聲學和無線電物理學五個碩士點，以及聲學和無線電物理學兩個博士點和博士後流動站。近幾年，每年招收全日制本科生200名左右，碩士和博士研究生80名左右，接受博士後研究人員10人左右。包括專科和“成教”學生在內，在校學生總數已達到2000人，辦學規模名列學校前茅。
人才培養
在人才培養方面，我系一貫注重基礎教學，強調寬口徑的培養模式。目前，全系擁有10餘個電子信息類本科基礎教學實驗室，提供了電子、信息和計算機等方面良好的基礎實驗訓練條件。在面向新世紀的教學改革中，由世界銀行貸款、“211工程”和“985工程”項目興建的具有國際先進水平的電子信息科學基礎實驗中心初步投入使用。
研究機構
電子系現有“近代聲學”國家重點實驗室、聲學研究所、生物醫學電子工程研究所、通信技術研究所、超導電子學研究所、軟體研發中心和微波技術研究室等科研機構。“近代聲學”國家重點實驗室是我國僅有的兩個國家級聲學基礎研究基地之一。聲學研究所的科學研究橫跨從基礎到套用的大多數聲學前沿領域，其學術水平長期處於國內領先水平，在國際上享有較高的學術聲譽。生物醫學電子工程研究所、通信技術研究所和軟體研發中心等科研單位直接面向國民經濟主戰場，注重科研成果的轉化，在國民經濟建設中發揮了積極的作用。微波技術研究室堅持從基礎研究到套用研究的發展主線，所研製成的新型電磁隱形材料已經產業化，為我國國防現代化做出了重要貢獻。近幾年來，超導電子學研究所異軍突起，已經成為我國主要的超導電子科學研究基地，在我國電子科學技術發展中正在發揮日益突出的作用。
電子系電子信息類學科的建設生機勃勃,已經在嵌入式系統設計、電子設計自動化、生物識別技術和現代信號與圖像處理等IT前沿領域形成了紮實的學科基礎,其套用開發深入國民經濟主戰場,顯示出強勁的活力和社會吸引力。
發展目標
目前，電子科學與工程系已經成為南京大學最具活力、最具發展前景的院系之一。
新世紀裡，電子系將堅持“以學科建設為龍頭，以隊伍建設為核心”的指導方針，加強優勢，發揮特色，努力開拓新的學科生長點，不斷提高辦學水平，使之成為有較高國際影響的高水平電子與信息科學技術人才培養和科學研究基地。
