位置
該站位於中關村北大街與成府路交匯丁字路口，北京大學東門。沿中關村北大街呈南北向布置。
此車站最初規劃階段為“成府路站”，這個站名不能確切地表明其具體地理方位，北京大學校方建議，改為“北大東門站”或“燕園站”，捷運建設單位根據命名相關細則最終站名確定為“北京大學東門站”。
結構
北京大學東門站站內立體圖該站是地下二層車站，地下一層為避開路面以下地下既有管線採用分離式站廳，地下二層是站台層，島式站台設計。
為避免捷運車輛運行產生的振動對北京大學東部區域的實驗區域大量精密儀器工作產生的影響，在捷運線路北京大學東門區段內採用“鋼彈簧浮置板道床”，使捷運列車經過該區段軌道時的橫向振動，經軌道下彈簧的吸收後，儘可能改變成沿軌道縱向振動，從而最大程度地降低振動干擾。
設施
站廳層設有客服中心、自助售票機、查詢機、2處自動ATM提款機；站台層南側設衛生間1個，還設有候車椅、多媒體乘客信息查詢系統機，可查詢公告信息、乘客須知、周邊環境、首末車時間、新聞等。懸掛顯示屏顯示電視轉播、本次列車及下次列車到達時間等。
裝飾
北京大學東門站壁畫北京大學東門車站內裝飾壁畫選取了北京大學具有歷史代表性的標誌性元素，構成了站內壁畫的主體物象，湖水樹石穿插其中，烘托出百年老校的莊重校園氣氛及文化底蘊。
出入口
該站共有4個出站口：A西北口、B東北口、C東南口、D西南口，分別位於丁字路口四角。
首末車時間
開往安河橋北：5:50-23:50
開往天宮院：5:09-22:29（全程）-22:54（終點站公益西橋）
周邊公交線路
中關園站：307(巴溝村-回龍觀公交場站)、355(廖公莊公交場站-育新小區)、365(永豐公交場站-閔莊南里)、498(中央黨校北門-新街口豁口)、549路(四通橋東-廂白旗橋)、579(頤和園-杏壇路南口)、601(祁家墳-捷運北宮門站)、614(單村-大鐘寺)、681(龍錦苑公交場站-海淀中街)、696(香山-黃港村)、697(菜戶營橋東-西苑)、699(巴溝村-回龍觀公交場站)、717(菜戶營橋東-捷運西二旗站)、982(北京西站南廣場-土井村西口)、特4(國防大學-前門)、特6(北京西站-韓家川南站)、特18(西苑樞紐站-北京西站)、運通105(中苑賓館-上地五街東口)、運通110(半壁店-來廣營北)
中關園北站：331(香山-新街口豁口)、365、375(韓家川-西直門北)、429(志新橋西-東北旺中路)、438(西直門北-永豐公交場站)、498、562(中央黨校北門-北太平橋西)、579、594(頤和園北宮門-望京橋西)、601、614、681、717、982、特4、特6、特19(西苑樞紐站-北京西站)、運通105、運通126（廂白旗橋-上地六街東口）
臨近車站
| 下行 | 線路 | 上行 |
| 開往天宮院站 （下一站：中關村站） 距離887米 | 4號線 | 開往安河橋北站 （下一站：圓明園站） 距離1295米 |
