1935年獲得宏博獎學金赴德國留學，先於德國高速公路實習四個月後，進入德國漢諾瓦工業大學；
1937年以《新中國鐵路網之研究》博士論文，獲得博士學位，同年因八年抗戰爆發返國。於德國留學時，認識妻子李定文教授，回國後陸續任教於同濟大學、成功大學；
1971起擔任國立成功大學校長，是成大改制國立大學後之首任校長；
1978年奉準榮退，退休後長居於台灣台南市；
1991年其妻李定文教授病逝；
1992年創立倪李氏獎學金；
1996年1月12日病逝於其推動而設立的成大醫院；
2006年成功大學將該校土木系與環工系所共用的大地工程館改名為“卓群大樓”，以紀念倪超對該校所作的貢獻。
