早年經歷
何塞·馬里亞·利納雷斯·利薩拉蘇，1808年7月10日出生於西班牙帝國拉普拉塔總督轄區上秘魯（今玻利維亞）波托西省蒂卡拉的一個富裕的農場主家庭，父親約瑟·拉蒙·布魯諾·利納雷斯是農場主，母親是瑪麗亞·何塞法·利薩拉蘇。何塞·馬里亞·利納雷斯是來自西班牙納瓦拉地區的上層階級家庭的後代，他有7個兄弟姐妹。
何塞·馬里亞·利納雷斯早年在波托西城的國立皮欽查學院接受教育，後前往丘基薩卡城（今蘇克雷）的聖弗朗西斯科·哈維爾王家教廷大學學習，利納雷斯在學校學習期間，成績優異，表現突出。
1825年，玻利維亞共和國正式獨立，年僅17歲的利納雷斯因為學習成績突出優異，在丘基薩卡城受到西蒙·玻利瓦爾和安東尼奧·何塞·蘇克雷兩位南美解放者的接見，玻利瓦爾獎賞了一些黃金給利納雷斯，以資助他繼續完成學業，到了蘇克雷執政時期，利納雷斯以他卓越的學術才能在波托西的國立皮欽查學院擔任教師，過了兩年後，他再次前往丘基薩卡城的聖弗朗西斯科·哈維爾王家教廷大學學習，期間利納雷斯為丘基薩卡城的中等教育建設發揮了重要作用。
從政經歷
何塞·馬里亞·利納雷斯利納雷斯在年輕時便積極從政，他最初是玻利維亞總統安德烈斯·聖克魯斯的支持者，在秘魯-玻利維亞邦聯時期（1836年~1839年），利納雷斯曾擔任眾議員、波托西城的行政長官及中央政府的國務部長，在何塞·米格爾·德·貝拉斯科第三次出任玻利維亞總統期間（1839年~1841年），利納雷斯出任玻利維亞駐西班牙全權公使，期間他致力於研究社會科學，並通過外交手段換得西班牙對玻利維亞獨立的承認。不久後利納雷斯返回玻利維亞，再次當選為為眾議員，後當選為參議員，1848年出任參議院議長。
1848年12月，曼努埃爾·伊西多羅·貝爾蘇將軍奪取政權，出任玻利維亞總統，利納雷斯反對貝爾蘇軍政府的統治，他前往西班牙定居，並在當地研習法律，在西班牙期間，利納雷斯繼承了家族在西班牙的貴族頭銜，得到了大量的金錢補貼，而他將這些財富幾乎全部用於政治活動當中，這也導致他生活一度十分困頓。在貝爾蘇執政後期，利納雷斯返回玻利維亞，之後他經常參與密謀推翻貝爾蘇總統的活動，並在秘魯、智利、阿根廷等國輾轉活動。
1855年5月1日，利納雷斯以獨立的政治家身份參加了總統選舉，在此次競選中，他獲得了4119張選票（占總票數的29.8%），負于貝爾蘇政府支持的官方候選人豪爾赫·科爾多瓦將軍，他的失敗是正常的，因為當時政府操縱了那次選舉。
總統生涯
奪取政權
何塞·馬里亞·利納雷斯總統利納雷斯在1855年5月競選總統失敗後，決定以武力推翻軍事政權，當年9月14日，利納雷斯在玻利維亞秘魯邊境的奧馬蘇約斯地區發動起義，但以失敗告終，起義軍遭到玻利維亞政府軍的鎮壓，利納雷斯本人也被迫四處逃亡，在逃亡期間，他繼續籌劃反對軍政權的起義， 並積極組織起義軍隊，1857年9月，利納雷斯率領起義軍隊在科恰班巴發動暴動，並在9月9日推翻豪爾赫·科爾多瓦政府，迫使科爾多瓦總統流亡國外。利納雷斯在1857年9月9日出任玻利維亞臨時總統，1858年3月正式就職玻利維亞總統，同年9月，他宣布自己為獨裁者。
治理國家
印有利納雷斯總統肖像的郵票在治理國家方面，利納雷斯總統力圖重新組織國家行政管理，改革政府部門的弊端，提高行政、司法和財政機構的效能，使地方政府更有工作效率；為了減少國家的行政的支出，利納雷斯總統首先削減了自己的薪金，然後他又減少了各部部長和雇員的薪金，並停止向為玻利維亞獨立做出突出貢獻的軍人發放補貼金。
為了消除玻利維亞國內長年不斷的軍事叛亂，利納雷斯總統著手整頓玻利維亞軍隊，他一方面強調軍隊要對政府忠誠，力圖使軍隊效忠於政府，受政府的領導和控制，另一方面削減軍隊人數，將玻利維亞國內常備軍的人數從6000人削減至1200~1500人，儘管如此，玻利維亞國內軍費開支仍占當時政府總支出的41%。
經濟政策
何塞·馬里亞·利納雷斯在經濟方面，利納雷斯明顯的表現出了對自由貿易的支持，他實行更加自由的貿易政策，促進國際貿易。1858年，國家廢除對金雞納（奎寧）樹皮的壟斷，降低了保護國民紡織工業的關稅，把粗棉布的進口稅減少到13%，並採取貨幣措施為提供保證。利納雷斯執政期間，對國家的公共信貸進行了全面重組，政府鑄造銀幣的活動恢復了正常，實現了償還國內債務的目標。
利納雷斯政府在支持自由貿易的同時，也加強了國家對礦業生產的限制，政府規定除銀礦之外的所有礦產都可以進入玻利維亞市場，但必須在玻利維亞國內提煉，玻利維亞政府加強了對水銀的銷售限制，國家對水銀生產進行壟斷，而礦產提煉離不開水銀；利納雷斯鼓勵礦主們建立由政府全力支持的利益集團“卡馬達”，以此來表示支持他們的要求；1857年，玻利維亞在梅希約內斯地區發現了硝酸鹽礦。
發展教育
何塞·馬里亞·利納雷斯在教育方面，利納雷斯政府成功的為地方教育籌措了資金，利納雷斯總統提出了“教育革命”的計畫，規定教育必須有新的方向，必須包括體育、智育和德育（宗教教育）三個基本要素，並強調要克服忽視職業教育的缺陷，為發展工業創造條件， 該計畫要求培訓教師的學院必須開設會計、工商地理、英語、法語（必修）、德語（必修）等課程；要求工藝和職業學校必須開設數學、石頭和木頭加工、繪畫、音樂、工商地理等課程；要求農業和園藝學校必須開設農業化學、植物學、動物學、獸醫學等課程；要求技術學校必須開設數學和套用數學、天文、物理、化學、力學、通史和專史、自然史、幾何製圖和透視製圖、地貌學、大地測量學、政治經濟學和工業經濟學一般原理、立法與行政一般原理等課程。
國內局勢
利納雷斯的改革思想過於苛刻，規章過於嚴厲，他在1858年9月正式建立了獨裁統治，最終導致國內產生了強大的反對派，他對軍隊的整頓遭到軍人的激烈反對；儘管在玻利維亞國內利納雷斯有以托馬斯·弗里亞斯和阿道弗·巴利維安兩人為首的“紅派”集團的支持，但反對派發動更大規模的反對利納雷斯政府的運動；1860年，玻利維亞政府軍在的的喀喀湖邊的科帕卡巴納屠殺了起義的印第安人，同時將一點陣圖謀叛亂的少校砍了頭，由於軍隊內部對利納雷斯總統的不滿、反對派的不斷活動加上印第安人的起義，利納雷斯總統的統治地位不斷被削弱。
下台流亡
利納雷斯總統對軍隊的整頓引起了軍人的怨恨，1861年1月14日，玻利維亞政府的戰爭部長何塞·馬里亞·德阿查將軍夥同利納雷斯的義子魯珀特·費爾南德斯以及拉巴斯城的行政長官曼努埃爾·安東尼奧·桑切斯發動政變，推翻利納雷斯總統，迫使利納雷斯流亡國外。
利納雷斯下台後，流亡智利，受到智利政府的接納，1861年10月23日，利納雷斯在智利的港口城市瓦爾帕萊索逝世，享年53歲。
家庭成員
利納雷斯的妻子是瑪麗亞·妮薇絲·弗里亞斯（出生於1831年），兩人共有2個女兒，分別是:何塞法·索菲婭·利納雷斯·弗里亞斯（1853年~1931年）和歐亨尼婭·利納雷斯·弗里亞斯（出生於1860年）。
人物評價
利納雷斯是玻利維亞歷史上第一位正式的文職總統，儘管他在執政期間存在很多問題，但是他統治時期標誌著玻利維亞權力已經開始向新的經濟實力轉移，並結束了政府在玻利維亞礦業開採中的壟斷地位，利納雷斯政府在沒有徹底地改變玻利維亞國民經濟狀況的情形下，卻開啟了長期變革的航船，這種做法為19世紀自由經濟思想在玻利維亞取得勝利奠定了基礎，歷史證明，利納雷斯政府的改革也是19世紀玻利維亞一次前所未有的改革。
人物紀念
1897年，玻利維亞政府發行印有利納雷斯肖像的郵票1897年，玻利維亞政府發行了印有利納雷斯總統肖像的郵票， 玻利維亞的何塞·馬里亞·利納雷斯州（Provincia de José María Linares）是為了紀念利納雷斯而命名的。
