中性基因

中性基因是一大類相對於顯性基因而存在的遺傳基因，平時它呈休眠狀態，其攜帶的遺傳信息不顯現。但他能被一些內外因素激活顯現，而當相關內外因素消失時，它又會恢復休眠狀態。

基因變異

分子水平研究發現生物基因組中存在中性基因變異：不同等位基因間鹼基序列存在差異，但無表型選擇作用。中性基因頻率改變不是選擇壓力引起，而主要是有遺傳漂變引起。中性基因變異可能有以下幾種情況：

1胺基酸序列改變、性狀變異，但無選擇意義（中性性狀）；

2胺基酸序列改變，但蛋白質功能不發生改變（中性突變）；

3胺基酸序列不改變（同義突變）

現有分子水平的研究表明，中性基因往往比那些功能上重要的基因在物種間差異要大的多。也就是說：中性基因的進化速率快於功能上重要的基因。