該中心是由中國科學院北京基因組研究所和吉林紫鑫藥業股份有限公司共同發起建立的集基礎研究、資源保護和套用開發為一體，以長白山脈傳統中草藥相關生物物種為對象，以加速中醫藥科學現代化進程為目標的研究套用平台。該中心的建立將整體提升吉林省道地中藥材整體科研水平，保障吉林省中藥資源可持續發展，強化合理開發和綜合利用，促進中醫藥隊伍整體素質提升，提高東北地區傳統中藥學術水平和中醫藥科技創新能力，著力打造吉林省中醫藥科研、轉化、發展的成功實踐。
中藥是我國的國粹，也是世界醫藥學的重要組成部分，據全國中藥資源普查表明：我國現有中藥資源達12807種，其中藥用植物11146種，占87%；藥用動物1581種，占12%；礦物類藥80種, 不足1%。而吉林省是國家生態建設試點省和國家重點建設的國家中藥現代化科技產業基地，有著豐富的中藥材資源，全省共有藥用生物資源443 科2790 余種，大力發展中藥材產業，不僅可以將資源優勢轉化為經濟優勢，並且還可以推動吉林省中醫藥創新發展，調整醫藥產業和產品結構，以及相關產業的發展產生綜合帶動作用，同時對推進吉林省生態省建設和調整農業產業結構都具有十分重要的現實意義。
長白山是中國三大中藥材基因庫之一，動物、植物和礦物藥材達1000種之多，占全國總量的1/3左右，有人參、鹿茸、五味子、關龍膽、細辛、林蛙、北芪等多種道地中藥材。
中國北方藥用物種基因組學轉化研究中心將依託中國科學院整體科技力量，以道地基因為主要研究手段，開展長白山脈特色道地藥材的資源保護和科學套用，提高中藥產品的科技含量，促進人參中藥現代化的發展。
