簡介
不等鞭毛門（學名：Heterokontophyta）是真核生物的主線，已知的下轄物種超過10萬個品種，當中大多數屬於單細胞的硅藻綱 。大至多細胞的大型海草，小至單細胞的各種浮游硅藻。這些藻類擁有葉綠體。其他值得注意的成員還有寄生性的卵菌綱，是不少植物性瘟疫的元兇，如愛爾蘭馬鈴薯饑荒及近日的橡樹突然死亡，都是由卵菌綱生物引起的。
下屬綱
褐藻門 海黍子一、有色類(藻類生物)
1、Actihrysophyceae(axodines)
2、硅藻綱（Bacillariophyceae）
3、Bolidophyceae
4、金藻綱（Chrysophyceae）
5、大眼藻綱(Eustigmatophyceae)
6、Pelagophyceae
7、褐藻綱（Phaeophyceae）
8、Phaeothamniophyceae
9、綠胞藻綱(Raphidophyte或Chloromonadophyceae)
10、Synurophyceae
11、黃綠藻綱（Xanthophyceae）
二、無色類(真菌類生物)
1、Bicosoecea
2、絲壺菌綱(Hyphochytridiomycetes)
3、Labyrinthulomycetes(slimenets)
4、卵菌綱(Oomycetes)
5、Opalinea
6、Proteromonadea
7、芽囊原蟲綱（Blastocystis）
