航點
孟加拉：達卡 (齊亞國際機場)
不丹：帕羅 （基地）
印度：嘎亞 、加爾各答 (錢德拉·鮑斯國際機場)、新德里 (英迪拉·甘地國際機場)
尼泊爾：加德滿都
泰國：曼谷 (素萬那普國際機場)
機隊
不丹皇家航空空客391客機2架 空客A319-100型客機（平均機齡8年）
1架 ATR-42客機（機齡17年）
1架 空客A320-200型客機（已退役）
國際合作
自尼泊爾地震後，受到打擊的旅遊業和航空業也面臨復甦的難題。目四川航空和不丹航空已達成了戰略合作意向，準備將川航成都直飛加德滿都航線牽手不丹航空公司的加德滿都飛不丹航線，聯手推出尼泊爾和不丹的旅遊產品，來拉動尼泊爾旅遊的復甦。
四川國際旅行社尼泊爾營運中心相關負責人表示，目前國內前往不丹旅遊還是非常火爆，不過因為沒有直航航班，此前前往不丹國內旅客都是從印度、泰國曼谷等地轉機，川航銜接上不丹航空的航班後，從尼泊爾轉機前往不丹會更加快捷，同時能夠帶動尼泊爾的旅遊，預計這條線路將在2015年7-8月投放市場。
安全事故
不丹皇家航空公司據Kuenselonline報導，當地時間2016年4月16日，一架載有103名乘客的不丹皇家航空客機（航班號為KB140）在印度古瓦哈蒂機場進近過程中，被冰雹砸中。機上無人受傷。該航班計畫從不丹經古瓦哈蒂飛往曼谷。不丹皇家航空表示，根據天氣預報，古瓦哈蒂機場當時的能見度不錯，僅僅有陣雨。但是在KB140航班進近過程中，飛行員突然遇到嚴重冰雹。
