三葉草模式

三葉草模式

三葉草模式( cloverleaf model)是轉運RNA(tRNA)的二級結構模式。是R.W.Holley等(1965)根據酵母丙氨酸tRNA的一級結構提出來的。因形成最多的鹼基配對使分子發生曲折呈三葉草葉狀而得名。

基本信息

區段

此模式不僅符合過去已被確定的一級結構tRNA的所有性質,而且為許多物理學及化學上的實驗結果所支持。tRNA上存在著形成華生-克里格型的鹼基配對部分〔莖(stem)〕和不形成華生-克里格鹼基配對的部分〔環(loop)〕,並可分為四個區段。

自5′末端算起的第一個環和其鄰接的莖一起組成了二氫尿苷區段(D區段),是由於tR-NA上多次出現的修飾鹼基二氫尿苷酸組成的環。

第二是由7個核苷酸所組成的環和由5個鹼基對組成的莖(stem)所構成的反密碼子(anticodon)區段,環中央的三個鹼基是反密碼子。

第三區段是因tRNA的種類不同長度有所不同的S區段(extraloop或是微區段)。

第四區段TC區的環具有GTC排列,除真核生物起始的tRNA等少數例外外,其他大部分tR-NA均有這種結構。這個區段與tRNA結合核糖體有關。5′末端和3′末端形成的莖部,被稱為“胺基酸枝”(amino acid arm)(CCA莖或胺基酸的受體莖),也就是胺基酸結合在3′末端CCA的腺苷上的。可能是在三葉草模式的二級結構基礎上進一步摺疊,形成tRNA的三級結構。

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