tale[靶向基因修飾技術]

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TALE(TranscriptionActivator–Like Effectors)技術是一種靶向基因修飾技術。來自植物細菌Xanthomonassp的TAL蛋白的核酸結合域的胺基酸序列與其靶位點的核酸序列有恆定的對應關係。

結構

:TALE是由12個或以上特異性識別DNA的串聯“蛋白模組”和兩側的N-末端及C-末端序列組成。每個“蛋白模組”包含34個胺基酸,第12和13位殘基是靶向識別的關鍵位點,被稱作重複可變的雙連胺基酸殘基 (RVDs)位點。TALE上的每個RVD僅能識別一個鹼基。

拓展

TALEs首先是在植物病原菌黃單胞菌(Xanthomonas)中發現的。當感染植物時,病原菌分泌的TALEs識別宿主植物靶基因的啟動子區,調控相應基因的表達。TALE蛋白中間含有一個重複區域,該區域由33-35個胺基酸的重複單元組成。每個重複單元的胺基酸序列高度保守,除了第12位和13位的兩個胺基酸可變,即重複單元可變的雙胺基酸殘基(RVD)。TALE單體通過RVD識別DNA靶點上的鹼基,有如下一一對應關係:NI = A, HD = C, NG = T,NN = G 或 A。

轉錄激活因子樣效應子(TAL effectors)已廣泛套用於靶向基因組操作蛋白的製備:通過融合表達核酸酶、轉錄因子或其他功能的結構域構建位點特異的內切酶(TALEN)、靶基因轉錄調控因子(TALE-TFs)或者其他基因組修飾蛋白。TALE融合蛋白通過TALE特異性識別結合染色體上靶序列進行靶向基因組編輯,比如基因敲除、基因敲入(結合使用重組供體質粒),基因組修飾、基因轉錄激活或抑制等。不同於識別3聯體鹼基的鋅指蛋白,TALE單體通過一一對應的關係精確識別單個鹼基(A, T, C, G),因此可以針對基因組上任意目標序列設計組建TALE模組

•靶向任意基因,無細胞類型限制

•靶點在基因組上序列高度特異

•靈活的TALEN,TALE-TF或其他TAL效應子的設計選擇

•完備的多層次服務

•細胞外或者細胞內的功能驗證

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圖 1. TALEN設計示意圖

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圖 2. TALE-TF設計示意圖

服務

TALE定製服務

GeneCopoeia(復能基因)提供TALENs,TALE-TFs和其他基於TALE的靶向基因組修飾因子的設計,構建和驗證服務。

優點

•快速產生TALE質粒或mRNA轉錄子

•進行全序列驗證,可直接用於轉染

•提供功能驗證

•可提供基因敲入的供體質粒

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