結構
:TALE是由12個或以上特異性識別DNA的串聯“蛋白模組”和兩側的N-末端及C-末端序列組成。每個“蛋白模組”包含34個胺基酸,第12和13位殘基是靶向識別的關鍵位點,被稱作重複可變的雙連胺基酸殘基 (RVDs)位點。TALE上的每個RVD僅能識別一個鹼基。
拓展
TALEs首先是在植物病原菌黃單胞菌(Xanthomonas)中發現的。當感染植物時,病原菌分泌的TALEs識別宿主植物靶基因的啟動子區,調控相應基因的表達。TALE蛋白中間含有一個重複區域,該區域由33-35個胺基酸的重複單元組成。每個重複單元的胺基酸序列高度保守,除了第12位和13位的兩個胺基酸可變,即重複單元可變的雙胺基酸殘基(RVD)。TALE單體通過RVD識別DNA靶點上的鹼基,有如下一一對應關係:NI = A, HD = C, NG = T,NN = G 或 A。
轉錄激活因子樣效應子(TAL effectors)已廣泛套用於靶向基因組操作蛋白的製備:通過融合表達核酸酶、轉錄因子或其他功能的結構域構建位點特異的內切酶(TALEN)、靶基因轉錄調控因子(TALE-TFs)或者其他基因組修飾蛋白。TALE融合蛋白通過TALE特異性識別結合染色體上靶序列進行靶向基因組編輯,比如基因敲除、基因敲入(結合使用重組供體質粒),基因組修飾、基因轉錄激活或抑制等。不同於識別3聯體鹼基的鋅指蛋白,TALE單體通過一一對應的關係精確識別單個鹼基(A, T, C, G),因此可以針對基因組上任意目標序列設計組建TALE模組
•靶向任意基因,無細胞類型限制
•靶點在基因組上序列高度特異
•靈活的TALEN,TALE-TF或其他TAL效應子的設計選擇
•完備的多層次服務
•細胞外或者細胞內的功能驗證
圖 1. TALEN設計示意圖
圖 2. TALE-TF設計示意圖
服務
TALE定製服務
GeneCopoeia(復能基因)提供TALENs,TALE-TFs和其他基於TALE的靶向基因組修飾因子的設計,構建和驗證服務。
優點
•快速產生TALE質粒或mRNA轉錄子
•進行全序列驗證,可直接用於轉染
•提供功能驗證
•可提供基因敲入的供體質粒