概述
蘇木素-伊紅染色，簡稱HE染色，是組織學技術的常規染色方法。恆定優質HE切片應該是紅藍相映，層次濃淡均為分明。
基本步驟
一、石蠟切片蘇木素一伊紅染色法的基本步驟：
脫蠟
（1）二甲苯I 15分鐘
（2）二甲苯II（應完全透明） 10分鐘
逐級降濃度酒精水化
（3）無水酒精I（變為不透明） 1－2分鐘
（4）無水酒精II 1－2分鐘
（5）95% 酒精 1－2分鐘
（6）80% 酒精 1－2分鐘
（7）自來水洗 片刻
染色
（8）蒸餾水片刻
（9）蘇木素液染核 10—15分鐘
（10）自來水洗 片刻
（11）1%鹽酸酒精分化 0.5—1分鐘
（12）流水沖洗 片刻至數小時
（13）碳酸鋰飽和水溶液反藍 1分鐘
（14）流水沖洗 15分鐘至數小時
（15）復染 0．5%伊紅水溶液（對比染色） 2—5分鐘
逐級升濃度酒精脫水（若為醇溶伊紅可直接人90%酒精）
（16）自來水洗（分化伊紅） 片刻
（17）95%酒精I 1－2分鐘
（18）95%酒精 II I—2分鐘
（I9）無水酒精 I 1—2分鐘
（20）無水酒精II l－2分鐘
透明
（21）二甲苯I 5—10分鐘
（22）二甲苯II 5—10分鐘
可作透明度試驗：在黑色背景下以光線照於切片如果見有乳白色斑片系脫水不足，需
再行脫水。
封固
（23）蓋玻片下封固
結果：胞核呈藍色，胞漿呈紅色，紅細胞呈桔紅色，其它成分呈深淺不同紅色。
染色過程中的加熱
為了縮短某些程度的染色時間，通常可用加熱的方法來實現。一般是將切片或塗片浸在染色液內，連同染色皿置於37℃或56℃溫箱內至所需時間。
有的染色需用煮沸或近於煮沸的技術，可將染色液在試管內煮沸後傾在載玻片上；或在注滿染液的載玻片下面直接加熱，直接加熱會因溶劑蒸發而使染色劑發生沉澱。這可在傾人染色劑以前在切片上覆蓋一塊方形濾紙束加以防止。染色完成後沖洗切片時可以很容易地除掉濾紙而又不會損傷切片。
染色時應注意事項
一張優質的HE染色切片，絕非僅指染色而言，它包括很多方面，首先應重視“固定”環節，其次注意脫水、透明、組織浸蠟，包埋和切片等各個步驟。一張因固定、脫水等步驟有所缺陷的切片，染色是不可能鮮艷、透明、層次分明的。解決上述各細節問題的方法已在前面各章節中均提到過。
但在進行HE染色時還應注意以下問題：
1．組織切片的脫蠟步驟應徹底，否則無論進行那種染色都會發生困難。脫蠟時間要充分，若溶蠟劑使用過久應及時更換以免效率降低，若室溫過低，可將溶蠟劑置於溫箱中進行脫蠟。
2．蘇木素染液使用一段時間後表面易出現亮晶狀飄浮物，這可能是液體表面的過氧化物，必須過濾除去，以防沉渣污染組織切片。蘇木素液一般染過三、四百張切片後，著色力會減弱，著色不鮮艷，呈灰藍色時應及時更換新液。
3．染色的時間長短需依據：染劑對組織的染色作用，室溫條件，切片厚薄，固定液的類別，染液的新舊而進行調節。所以在染色時必須使用顯微鏡觀察染色程度以利掌握時間。
4．分化十分重要。分化步驟的準確也是染色成敗的關鍵，若分化失當則必然引起染色不勻或過淡，過深等現象，因此分化後一定要鏡檢，觀察胞核是否清晰，胞漿呈淡白色。否則需再次分化，不然一旦復染後，組織會呈紫藍色即“藍蓋紅”現象。
5．還原液不宜過濃，若鹼性太強易使組織脫落故以淡為宜。
6．伊紅宜淡染，復染過深胞核會不清晰，影響鏡檢。
7．若脫水，透明等步驟不夠徹底，則組織表面會有一層霧狀膜。若有這一現象，應立即更換純酒精脫水，再次透明。在潮濕的季節里應注意酒精的濃度、若降低要及時更換。
8．染色後的組織切片、要將組織四周的污染物痕跡擦掉，以免影響美觀。
9．封固劑要適量，滴加時應小心傾滴，蓋玻片要輕輕放置，以免氣泡產生影響鏡檢。蓋玻片大小選擇要合適，一般要大於組織塊，以防封蓋不全，蓋玻片要放正，標籤貼牢，編號清楚。從而保證切片的封藏和美觀。
10．染好的切片應妥為保存，更應避免日光照射，否則切片容易褪色。
