安全性能
Touch ID不存儲用戶的任何指紋圖像，只保存代表指紋的數字字元。iPhone 5s的A7處理器採用了新的高級安全架構，其中有一塊名為Secure Enclave的區域用以專門保護密碼和指紋數據。只有Secure Enclave可以訪問指紋數據，而且它還把這些數據同處理器和系統隔開，因而這些永遠不會被存儲在蘋果的伺服器上，也不會被同步到iCloud或其他地方。除了Touch ID之外，它們不會被匹配到其他指紋庫中。
技術套用
Touch IDiPhone上的指紋感測器做到了“一機一Touch ID”，即如果你把一台機器上的Touch ID感測器拆卸下來，裝到另一台iPhone上，那么這個Touch ID就無法使用了。除了更換Touch ID感測器之外，測試人員還嘗試更換接口、更換主機板，但是依然無法使用。
當Touch ID感測器被裝回原來的機器上時，它又能正常使用了，所以了解到了蘋果此前從未披露過的技術：硬體鎖定。為了驗證這一技術，測試人員拿出兩台此前從未打開指紋識別功能的iPhone 5s，將它們的Touch ID感測器互相交換，結果兩台都無法使用指紋識別功能。隨後再換回原來的手機，它們的指紋識別功能又正常了。因此我們可以確定：每個Touch ID組件只與一個處理器匹配。
套用意義
Touch ID凝聚的科技對此，數據安全專家尼克·阿諾特（Nick Arnott）表示：“其中的原理比較複雜。一種可能的解釋是蘋果阻止了任何Touch ID和Secure Enclave之間的任何數據嗅探和截取，實現了特定處理器配對特定的Touch ID。否則假如有人將用戶的指紋感測器更換，就可以在用戶不知情的情況下竊取到指紋數據。蘋果的技術降低了這一風險，這意味著不法之徒想要‘調包’感測器的話，需要單獨破解每台設備。
對於重視安全性的用戶來說，這個發現當然是個好訊息。不過這讓iPhone的維修更為複雜，假如你的Touch ID不小心壞了，或者拆螢幕的時候不小心碰斷了Touch ID的某根線纜，或許你就再也無法在你的手機上使用指紋識別功能了。
目前，Touch ID僅允許Apple授權的API和系統接觸，其他程式無權直接訪問Touch ID或者存放指紋的Secure Enclave區域。Apple也無法獲取和備份至iCloud雲端
二代更新
蘋果在2015新品發布會上提及全新的iPhone 6s、iPhone 6s Plus採用第二代Touch ID，新的Touch ID識別速度更快；實際體驗中只要輕輕觸碰一下即可，以往要按壓半秒鐘的指紋識別過程，現在基本是一觸即發。 iPhone 7和iPhone 7 Plus上，也採用了第二代Touch ID。
