馮雲山事件
馮雲山被捕下桂平縣監獄，拜上帝會兄弟來請他想辦法救馮雲山。玉昆說：「而今官府極怕說造反，上下遮掩，混過日子，斷不敢辦這個案件。但『衙門口朝南開，兩手無錢別進來』，官府全都是吸血鬼，一到衙門，就非錢不行」。拜上帝會兄弟皺眉說：「說到錢就千難萬難。我們都是燒炭窮人，那裡得錢去填貪官，對我們來說，辦不辦不還是一樣」！玉昆說：「不是的，官府不敢辦，就有辦法了。籌款也是有辦法的，只要大家齊心，積少成多，你們豈不聞集腋成裘的老話嗎？」於是他給拜上帝會定出「科炭」籌款的辦法，積聚起一筆大款，向官府行賄，馮雲山得釋放。這是金田起義前一件關係極為重大的大事。它充分地暴露清朝統治力量的腐朽，打下地主階級的氣焰，增長革命的威風，使暴動從醞釀迅速走上成熟階段。玉昆立了大功，他加入平在山拜上帝會。
法令——刑法
自金田起義，法令多由玉昆制定。建都天京後，天朝刑部事務即由他擔任。這時候，清朝江南大營就盤踞在天京東門外孝陵衛，敵對分子屢屢蠢動，里外勾結，進行顛覆勾當。玉昆牢牢地掌握著這一個農民專政的工具—刑法，雷厲地去鎮壓敵對分子，為保衛天京、保衛太平天國政權建立了功績。5月。升夏官正丞相。楊秀清以玉昆精明幹練，予以重任，命朝內官自檢點以下都到他的衙門聽令。
革職復職
甲寅4年2月，升衛國侯。3月，玉昆因秉公執法，不肯曲循楊秀清的同庚叔私意，法外加杖燕王府牧馬某甲事，被楊秀清重杖三百，革去侯爵，降為伍卒，事說楊秀清傳。經石達開向楊秀清求情，得入翼王府襄理文書。 8月復職，改封衙天侯，仍司天朝刑部事務。
鑄炮造船
乙榮5年夏，任為提督軍務，出鎮漢陽。這年冬，領軍隨石達開經略江西。11月12、13日（夏曆11月初十、十一日），大軍分路攻克瑞州、臨江兩郡。玉昆駐軍臨江郡，鑄炮造船，以圖南昌。當年玉昆監鑄的大炮，今天還保存有一尊300斤重的鐵炮。
主持江西軍務
丙辰6年3月，石達開奉命歸天京攻江南大營，以玉昆代主持江西軍務。
陣亡
丁巳7年10月16日（夏曆10月初8日），在救吉安郡戰役中陣亡。
追封
庚申10年，太平天國論平在山勛舊，追封玉昆為義爵。
