歷史
創建
前期醫院騎士團標識 由於朝聖者無私的付出讓醫院修會迅速發展，從1110年起修會同意將分散耶路撒冷的領土的財產，可以交給醫院騎士團。
1113年，教廷承認他們是獨立的修會，並賜予他們一系列的經濟、政治特權，如無需繳納十一稅，無需接受任何政權的領導，只受教皇節制。
醫院騎士團 耶路撒冷聖約翰醫院騎士團成立時只是一個行善的組織，從1120年才開始作為一個軍事修會進行活動，以武力保護朝聖者免受異教徒攻擊，並發展成為耶路撒冷王國的一支重要軍事力量，對耶路撒冷的政局也有很大的影響力。
它在耶路撒冷王國擁有7座大的要塞，140多座其它建築。 耶路撒冷王國國王鮑德溫四世去世後，當時醫院騎士團的大團長Roger de Moulins反對居伊（Guido von Lusignan）繼任，可惜沒有成功。後來在1187年哈丁之戰中，醫院騎士團也派出主力參戰，由於指揮上的失誤，包括醫院騎士團、聖殿騎士團在內的基督教軍隊幾乎全軍覆沒，醫院騎士團大團長Roger de Moulins戰死。
守衛羅得島
羅得島 當1453年 君士坦丁堡落入 土耳其人的手裡時，羅得島上的聖若翰騎士團是整個東地中海地區惟一的基督教力量。
在羅得島的抵抗一直持續到1522年。那一年，蘇萊曼一世指揮20萬軍隊乘坐著400艘戰艦來到羅得島，而島上的騎士團只有7000名士兵，雖然實力對比懸殊，但騎士團依然獨立堅守了6個月，土耳其軍隊據說有5萬人在戰鬥中喪生（羅德島圍攻戰）。最後騎士團與土耳其人達成協定，騎士團撤出羅得島，前往歐洲。
前往馬爾他
大戰 土耳其人對騎士團的捲土重來顯然很不安，1565年，蘇萊曼一世派出大軍進攻馬爾他。這場大戰一開始和上次在羅得島的大戰很相似：騎士團苦苦支撐，絕大多數城市都被摧毀，騎士團成員有一半戰死。就在騎士團眼看要支撐不住時，從 西班牙來了一支援軍，戰場局勢頓時扭轉，土耳其軍隊倉惶撤退，損失達到3萬餘人。這次大勝使馬爾他騎士團國獲得了一段時間的和平局面。
1571年，土耳其人認為海軍發展得差不多了，再次起兵企圖消滅騎士團。不過這次他們敗得更慘：還沒到馬爾他，在海上就遇上了以基督教國家組成，由西班牙王國的無敵艦隊為主力的神聖同盟（Holy League）艦隊于勒班陀海域展開了一場海上會戰（詳情參見勒班陀戰役），土耳其艦隊幾乎全被擊沉或俘虜。此後馬爾他騎士團國進入鼎盛時期，帆上標有馬爾他八角十字的戰船在地中海橫行無阻。
馬爾他陷落
騎士團 離開了馬爾他島之後，耶路撒冷聖約翰醫院騎士團就此失去了領土，但作為一個組織仍然存在，雖然騎士團在馬爾他島的主權權利透過1802年亞眠條約（Treaty of Amiens）的簽訂而得到英、法等國的承認，但騎士團卻從未被允許回到該島。爾後騎士團於1834年在羅馬重建總部，終於再次穩定下來。騎士團的軍事使命已經完結，此後主要從事慈善事業。
當代，馬爾他騎士團在聯合國享有永久觀察員實體的地位，但馬爾他騎士團並沒有任何領土，它設在羅馬的總部馬爾他宮，是位於羅馬市孔多迪大街68號，占地1.2萬平方米的大廈。但這並非其領土，該宗土地主權屬於義大利，租借給馬爾他騎士團，同時義大利給予該大樓外交待遇。
醫院騎士團騎士 紅十字會標誌不是來源於醫院騎士團，而是來源於其創始人亨利·杜南的祖國瑞士國旗，圖案相同顏色相反，以表彰其為國際人道做出的傑出貢獻。
演變
宗教革命後，以德意志為首的新教國家的醫院騎士團從騎士團總部獨立出去，但仍然保持聖若翰騎士團的稱號。信仰天主教的馬爾他騎士團則是醫院騎士團的直接繼承者。19世紀之後，醫院騎士團已經不再局限於天主教（雖然多數成員還是天主教徒），例如信仰東正教的高爾察克、葉爾欽，信仰基督新教的隆納·雷根、喬治·布希，都被授予了醫院騎士團的榮譽騎士一銜。
現狀
醫院騎士團 到2013年馬爾他騎士團的騎士約有八千名（另一說有一萬兩千名），成員遍布歐美等國，其中包括 西班牙前國王胡安·卡洛斯、義大利前總理弗朗切斯科·科西加、美國前財政部長威廉·西蒙等名人。
現任大主教Matthew Festing因為發放保險套的醜聞，已經在教皇的建議下辭職。大主教這一職位通常是終生任職的。教皇將任命臨時負責人，直至選出下一任大主教為止。
組織信息
名稱
十字軍時期的醫院騎士團盾 醫院騎士團的口號：“守衛信仰，援助苦難！”（Defence of the faith，assistance to the suffering！）
格言
馬爾他騎士團代表旗 英語：Defence of the faith，assistance to the suffering
拉丁文：Tuitio Fidei et Obsequium Pauperum
義大利語：Sovrano Militare OrdineOspedaliero di San Giovanni di Gerusalemme di Rodi e di Malta
西班牙語：Soberana Orden Maltar y Hospitalaria de San Juan de Jerusalén de Rodas y de Malta
法語：Ordre Souverain Militaire Hospitalier de Saint-Jean de Jérusalem de Rhodes et de Malta
德語：Souv. Ritten - und Hospitalorden vom Hl. Johannes zu Jerusalem genannt von Rhodos und von Malta
國歌
Ave Crux Alba（拉丁文：致敬白色十字）。
官方語言
義大利語。
總部
羅馬馬爾他宮（Palazzo Malta）——羅馬孔多迪大街68號，一幢占地1.2萬平方米的大廈。
面積
約12000平方米。
大教長
Matthew Festing。
憲法
騎士團憲章。
團員
約12500位騎士與女爵。
創立時間
約1050年。
貨幣
歐元。
政治與外交
政治
馬爾他騎士團為一宗教及慈善性質且受國際法承認之主權實體（Sovereign Entity），該組織被賦予發行自己的護照、郵票、貨幣、公共建築及司法獨立等權利。憲法由騎士團憲章及騎士法規所組成，現行憲法是1997年修改過的版本。
職務
首長：大教長（The Prince and Grand Master）由國務委員會選舉出，終身職。大教長必需奉獻自己投入組織事務，並且是全體成員對宗教虔誠信仰的表率，與政務會議同為行政中樞。大教長的行政許可權並不包括公布騎士團憲章、政府令、醫療事務及向教宗報告騎士需求、選舉政務議員、締結國際條約及召開大議會。與騎士團有建立外交關係的國家均承認大教長為騎士團最高領袖，其頭銜是由宗座所贈與的，且羅馬天主教會賦予其樞機主教地位。
事務大臣（The Grand Commander）職責為傳播信念、監督管理各教區之騎士與女爵及向教宗報告騎士團事務，同時也管理總部馬爾他宮周圍之禮拜堂和朝聖事務，也簽署公文和大教長之無法律效力檔案。
外務大臣（The Grand Chancellor）職掌內政及外交，負責對外一切事務及他國或第三團體與政府溝通的中間人。
醫務大臣（The Grand Hospitaller）職掌衛生、社會、人道援助及國際合作事務，是各地修道院、國際分會及其他組織負責人道援助的最高指揮官，並確保天主教受到尊重。
財務大臣（The Receiver of the Common Treasure）職掌財政與預算事務，負責組織與各地分會合作之開銷並監督審計部。財務大臣需向審計部和大教長做經濟、財政和預算報告，並將訊息傳給政務會議，同時也監督組織財產收納、宴請支出及捐獻收入，大教長的禮物也由財務大臣管理，另外騎士團之郵政、居住、科技事務、馬爾他宮和其他財產建築也由財務大臣督導。
行政議會
國務委員會（Council Complete of State）主要是選舉大教長或大教長代理人，根據憲章第二十三條表示，選舉系不記名投票，獲過半票數者即當選。擁有投票權的成員為大教長代理人或過渡期大教長、政務議員、主教、修道院長、法警及兩名代表小型修道院的騎士和十五名國際分會的代表。
大議會（General Chapter）主要是每五年召開選舉政務議員、政策委員及審計員，負責修改及討論憲章及法規和一些重要性議題如宗教地位、人道醫療計畫及對外關係事務。大議會系由各修道院正副院長及各國際分會代表組成。
政務議會（Sovereign Council）是騎士團的行政中樞，由大教長、事務大臣、外務大臣、醫務大臣及財務大臣和由大議會選出之五名成員共十人組成。政務會議由大教長召開，每年最少六次或有特別要求亦需開會。
政策委員會（Government Council）只是政務議會的建議委員會，提供政治、宗教、醫療合作及外交事務的方案，主席亦為大教長，每年最少召開兩次會議。委員會由六個經大議會於不同地域選出的騎士組成。
審計部（Board of Auditors）負責監督及查核組織收入、支出及財產，由部長、四名常任委員及兩名非常委員組成，由大議會選出合法且富有專業經濟及財政背景的騎士組成。審計部同時也是財務大臣的建議委員會。
傳播部（Communications Board）監督組織內部及外部之傳播活動，並協助外務大臣之發展宣傳事務，由部長及六名由組織選出在傳播、管理、公共關係和媒體事務等領域有專業能力的委員。
立法
法務辦公室（The Office of Advocate General）是根據法規成立的合法協調機關，由獨立且熟悉組織事務的專業法學家及學者組織，成員為法務長和兩名辦事員，三者均由大教長指派並經政務議會同意任命，每三年選舉一次。每當組織碰到特別複雜法律事務或必要案件時均需向該辦公室尋求協助。
司法
司法委員會（Juridical Council）負責提供大教長有關司法方面之專業知識，也是政務會議的司法諮詢機構。由正副主席、秘書長和四名委員組成，其成員均由政務會議向大教長推薦任命，被推薦的騎士在憲章、國際法及教規方面都有專業學問。
獨立法院（Magistral Courts）由院長、法官及陪審團所組成，其人選由大教長指派且經政務議會同意任命，審判常規依照教廷之規定，若國際法及憲章未提及之要求，獨立法院通常也是國際糾紛的仲裁機關。
外交關係
馬爾他騎士團與世界上104個國家建立正式外交關係（包括摩納哥及俄羅斯等國），但其中大多數都不是以天主教為主要信仰之國家。除此之外，馬爾他騎士團還在歐盟駐有大使。馬爾他騎士團與歐盟及國際紅十字會一樣依照國際法以非國家身份參與國際組織。教廷為表示其主權獨立地位，因此各國駐義大利大使不得兼為駐教廷大使，而義大利也是惟一在自己首都派駐大使的國家，但馬爾他騎士團的情形則更為特殊，通常各國駐教廷大使均兼為駐馬爾他騎士團大使。
與馬爾他騎士團具有特殊外交關係國有六國，分別是：法國、德國、比利時、瑞士、盧森堡和加拿大。
另有五國未與馬爾他騎士團建立外交關係並不承認其護照，分別是：荷蘭、芬蘭、瑞典、冰島及希臘。
2017年3月，台灣“東森新聞雲”援引美國《福布斯》雜誌的文章稱，台灣近年來與歐洲小國馬爾他騎士團關係良好，合作密切，馬爾他騎士團有望成為“外交新盟友”。
報導稱，儘管彼此沒有對“外交關係”做出承諾，但雙方“關係升溫”。馬爾他騎士團聯絡主任狄羅比亞特此前曾在聲明中表示，“基於彼此合作，我們有信心與台灣發展出更深厚的關係”。台“外交部”2017年3月14日回應稱，“台灣與馬爾他騎士團共享人道慈善的價值，援外宗旨相互契合。未來將與馬爾他騎士團深化合作，加強夥伴關係” 。
