貝喙鯨亞科包括貝喙鯨屬Berardius , 古喙鯨屬Archaeoziphius及小貝喙鯨屬Microberardius。貝喙鯨亞科Berardiinae不同於其他喙鯨科成員頂部前端或有頂間表面存有瘤結 , 下顎骨有兩對擴大的牙齒 , 其中一對是外露 , 這特徵於古喙鯨屬Archaeoziphius及小貝喙鯨屬Microberardius是出現的。貝喙鯨亞科和其他喙鯨科成員有大多的近祖共性(symplesiomorphies) , 包括有狹且幼的前上頜骨弧形脊突, 較低的上枕骨(supraoccipital)。
非洲小貝喙鯨Microberardius africanus和貝喙鯨屬不同之處在於非洲小貝喙鯨Microberardius africanus體型細小 , 吻中管前方被較厚的犁骨vomer填滿 , 吻突隨尺寸的增大而寬闊 。非洲小貝喙鯨Microberardius africanus有較狹的吻基 , 上頜弧形脊突並不延至吻基之外。非洲小貝喙鯨Microberardius africanus和古喙鯨屬Archaeoziphius不同之處在於前上頜骨有輕微凹形的骨溝囊premaxillary sac fossa , 有較高的上頜骨弧形脊突premaxillary crest, 鼻骨nasals前方突出。
於南非也發現了貝喙鯨亞科的化石包括一固磨損的吻管及頭頂 , 前上頜弧形脊突 , 吻突和拿加喙鯨屬Nenga相似。 化石的前上頜弧形脊突較長 , 鼻骨較長且橫斷較幼。在鼻骨後部 , 橫向壓縮的前沿和圓狀的頂間骨間的縫合清楚可見 , 而頂間骨interparietal於阿氏貝喙鯨及小貝喙鯨Microberardius是有的 , 因此這具化石是被劃歸成貝喙鯨亞科。
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