醫學孢粉學花粉有一層由孢粉素組成的外壁，它是一種複雜的碳、氫、氧化合物，它能耐酸、鹼，極難氧化，在高溫下也難溶解，因此可以保存成化石。孢粉粒的直徑一般在10～200微米之間，體輕，有些還具有氣囊，可以分布到較大範圍。如松、雲杉、椴等花粉均可飄飛1000多公里。這就使得孢粉化石可以在較大範圍內用於地層對比和古植被、古氣候分析判斷等。
不過在孢粉的研究方法中也存在一定的困難，如對現代孢粉研究得不夠(僅約幾萬種，為現代植物20多萬種的1/3至1/4)。化石孢粉的分類則更困難。小而易飄飛，各種植物孢粉產量不一，大小各異、飄飛遠近不同，降落速度也不一樣，對於正確恢復某一特定植物群的面貌有一定困難。
醫學孢粉學是研究植物的孢子、花粉(簡稱孢粉)的形態、分類及其在各個領域中套用的一門科學。醫學孢粉學可以分為兩個領域，現代孢粉學及古孢粉學。英國加的夫大學的海德和威廉斯於1945年最先創用孢粉學一詞。
醫學孢粉學研究的基礎部分為植物學的一部分，主要為孢粉的形態、分類及生理、生化等方面。其套用部分則各有側重，古孢粉學或稱地質孢粉學主要為地層對比、尋找有關礦產，尤其是煤和石油以及其他陸相沉積礦產服務。還套用於古生態、古環境、古地理、古氣候學的研究。
