又稱酶系統。酶及輔因子組成的完整體系。酶是活細胞組成的具有催化作用的一類蛋白質，催化生物體中間代謝過程的成千上萬的化學反應。有一些酶的活性取決於他們的固有結構，另一些酶，還需要輔因子才有活性。輔因子可以是金屬離子、金屬配位化合物（如VB12輔酶）或複雜的有機物。通常把酶體系稱為全酶，而把去除輔因子後所剩下的蛋白質叫脫輔基酶蛋白。
按反應類型，可分為六大類。I類：氧化還原酶，催化氧化還原反應。II類：轉移酶，催化功能團的轉移。III類：水解酶，催化水解反應。IV類：裂解酶，催化消去反應並形成雙鍵。V類：異構酶，催化異構化反應。VI類：連線酶又稱合成酶，催化鍵的形成，同時使三磷酸腺苷（ATP）分子中高能磷酸鍵斷裂。
