組織作用

醫學方面
許多化學藥物、抗生素的治療原理,基本上是它們能選擇性地作用於致病微生物體內的某一酶系,從而阻斷該病原微生物的正常代謝,導致它們的死亡。而這種藥物對人體無害或危害較小。例如磺胺類藥物就是作用於病菌體內葉酸(見維生素)合成酶的活性部位,阻斷葉酸的合成,導致細菌死亡。但人體的維生素是靠從食物中直接攝取,人體內不存在這種酶,因此磺胺類藥物對人類沒有毒害。又如青黴素的作用機制雖然尚未徹底搞清楚,但目前已經知道它是作用於細菌細胞壁的結構成分──肽聚糖的合成酶,造成不可逆抑制。動物細胞沒有細胞壁,因而青黴素對於人及動物從藥理作用上講是安全的。
此外,酶也可直接用作藥物。尿激酶可以激活纖溶酶原,使之變為纖溶酶,纖溶酶有較強的水解纖維蛋白的能力,可溶解血栓。溶菌酶可降解細菌細胞壁的粘多糖,可用於治療咽喉炎、鼻炎、口腔潰瘍等病。