生涯
青年時代
幼時因父親庶子出身而受到排擠，後來在其父前往甲信時留在京都。天正元年（1572年），在其父授意下，正式宣布脫離近衛本家，自立一門，即御院近衛家。
傳奇婚姻
作為公家後代，而且還是前關白的嫡子，其父信澄極其反對他的婚事。公武不和，這是一個難以解決的心結。但是孝直頂住了來自多方的壓力，甚至三位正卿的語言威脅都不能阻攔。最終，孝直與他所愛的一名貧寒武家女成親，並立下一夫一妻的誓言。
但是由於孝直身體羸弱，不納側室，子嗣不昌，直至38歲才擁有嫡子流輝。
不久其正室又誕下一女，取名為光。
過早病亡
1593年，近衛孝直因心臟衰竭死於京都，享年44歲。先於其父而去的他，留下了一個六歲的繼承人與四歲的女兒。
而信澄此時也正是上位之時，可謂是悲喜交加。
近衛信澄死後，流輝年幼，難以復興家業，最終導致榮極一時的御院近衛家沒落。
其他
後事
其子近衛流輝在近衛信澄死後繼承家業，面臨望月信繁與近衛顯家的派系鬥爭，無力插手，最終被二人利用，導致其女近衛光在近衛信澄斡旋下，嫁與望月信繁之孫望月信平為正室，宣告兩家和解。
著作
傳說著有《京洛文選》、《茶經》等，因年代久遠，資料迭失，已不可考。現存三首和歌選入大正琴原的《中世和歌集》。
家族重要人物
近衛基實(1143年－1166年)近衛基通(1160年－1223年)
近衛家實(1179年－1242年)
近衛兼經(1210年－1259年)
近衛信澄(1520年－1602年)
近衛前久(1536年－1612年)
近衛信尹(1565年－1614年)
近衛信尋(1599年－1649年)
近衛基熙(1648年－1722年)
近衛家熙(1667年－1736年)
近衛篤麿(1863年－1904年)
近衛文麿(1891年－1945年)
