簡介
足印圖譜法 foot printing method 為利用DNA與蛋白質結合，在結合的區域不易再受DNA分解酶或化學修飾下而分析與蛋白質相互作用的DNA部位的方法。是與指紋圖譜法對比而提出的術語，意思是分析DNA上印有的蛋白質印跡。
具體作法
用32P標記含有作為目標領域的DNA片段的一個末端。在與蛋白質結合之後，用DNA分解酶（核酸內切酶）在溫和條件下使之發生作用，或在一定條件下用化學方法分解DNA。分解產物可用聚丙烯醯胺凝膠電泳法按鏈長將之分開，用放射自顯影法而測定DNA的片段。在不存在蛋白質的情況下，DNA從標記的末端開始，在不規則的部位被分解，可得到連續的梯狀花紋。與此相反，與蛋白質結合時，因該部分的DNA不分解，花紋就變得不連續的狀態，結合蛋白的部分可在梯狀花紋的空白部分找出。套用此法可分析阻遏物和RNA聚合酶的結合部位。
