劇情簡介
講述的是在2020年11月26日，反政府組織：EXE，為了消除政府有關的人，開發了穿越過去的機器，而察覺到EXE陰謀的泊 進之介，單人潛入到EXE的秘密基地，但EXE的成員卻被神秘一行人打倒，並利用時光機器回到過去，而泊進之介也進入到時間機器，來到了2010年11月26日，可泊 進之介沒來多久，就陷入到某種事件，他久違的戰鬥就這么開始了······
人物介紹
主要人物
| 人物名 | 介紹 |
| 高町奈葉 | 高町家最小的女兒，9歲時就讀私立聖祥大學附屬國小三年級，自稱“平凡的國小三年級生”。後為了幫助受了傷的尤諾尋找聖石之種而成為魔法少女，這是奈葉和魔法的最初相遇。在“聖石之種事件”結束後，再次以“平凡的國小三年級生”生活著，但卻遭到神秘敵人襲擊，之後被從未來來的泊 進之介救了之後，決定再次成為魔法少女來協助泊 進之介 |
| 菲特·泰斯特羅莎 | 普蕾茜亞·泰斯特羅莎以逝世之女：艾麗茜亞·泰斯特羅莎製造的“F計畫”複製人，雖與艾麗茜亞同樣的樣貌，但作為克隆的女兒卻沒有艾麗茜亞的記憶，和兩人在性格、習慣、魔法資質上均存在著根本性的差異，對她而言則是失敗作；一開始為了執行普蕾茜亞收集聖石之種起初與奈葉敵對，不過，奈葉的溫柔的個性使讓菲特內心打開，最後成為奈葉的朋友；在“聖石之種事件”結束後，被送到時空管理局進行審判，被判為無罪，但要處於視察，後來接到有時空傳送的反應在海鳴市就再次回到地球 |
| 克洛諾·哈洛溫 | 時空管理局執行官，魔導師，在“聖石之種事件”結束後，接到有時空傳送的反應在海鳴市與菲特再次回到地球 |
| 尤諾·斯克萊亞 | 居住於米德芝爾達的結界魔導師，在地球進行回收聖石之種的途中，與奈葉相識，還將旭日之心交給她；在“聖石之種事件”結束後，一時回到時空管理局，後來在回到地球的途中遭到襲擊而處於下落不明。 |
| 艾爾芙 | 菲特的使魔，在“聖石之種事件”結束後，和菲特一同接受審判，並被判為無罪，但要處於視察，後來接到有時空傳送的反應在海鳴市就再次回到地球 |
| 泊 進之介 | 從2020年來的未來假面騎士，在一次調查中察覺到EXE的陰謀，就獨人一個潛入EXE的秘密基地，但與Genesis四人組邂逅後，跟著進入時光機器來到10年前，並救了被神秘敵人襲擊的奈葉，之後和奈葉協助戰鬥 |
| 詩島剛 | 從2020年來的另一個未來假面騎士，在泊 進之介失蹤後來到EXE的秘密基地，察覺到泊 進之介可能是回到過去就隨著進入時間機器回到10年前，在非洲的某個地方與一名少年邂逅 |
| 火野映司 | 在2010年的現今假面騎士，從鴻上光生得知有時空傳送的反應後在途中和神秘敵人戰鬥，之後與泊進之介和奈葉相遇 |
| 羽柴信良 | Genesis四人組隊長，假面騎士斬月·真，6年前對從Inves手中保護的葛葉紘汰和其姐葛葉晶有恩，對 Neo Femushinmu的行動一直虎視眈眈，後來在追著斯卡蕾特時來到EXE的秘密基地，並與泊 進之介邂逅，接著直接進入時光機器來到10年前 |
| 西野信二 | Genesis四人組之一，日英混血兒，眼瞳是繼承母親，而膚色和發色則是繼承父親，假面騎士Duke，和羽柴信良是青梅竹馬的關係，在一次追逐來到EXE的秘密基地，並進入到時光機器來到10年前 |
| 結城英司 | Genesis四人組之一，雖是東京人，但其父原是大阪人，所以在語音裡帶有關西腔的元素，假面騎士Sigurd，和羽柴信良、西野信二是同校學生，在一次追逐來到EXE的秘密基地，並進入到時光機器來到10年前 |
| 星野櫻子 | Genesis四人組之一，日俄混血兒，幼小就一直居住在俄羅斯，後來轉校到日本，學年與羽柴信良，西野信二和結城英司一樣，假面騎士Marika，在一次追逐來到EXE的秘密基地，並進入到時光機器來到10年前 |
其他人物
| 人物名 | 身份 |
| 琳蒂·哈洛溫 | 時空管理局總局提督，“阿斯蘭”艦長 |
| 艾蜜·莉米艾特 | 克洛諾執行官的輔佐，“阿斯拉”的管制官和通訊主任 |
| 葛葉紘汰 | 2013年活躍的假面騎士鎧武，起始之男 |
| 葛葉晶 | 葛葉紘汰的姐姐 |
| 拿比素 | Overlord，以靈體化告知葛葉紘汰他有危險 |
| 天空寺尊 | 2015年活躍的假面騎士Ghost，在末尾登場，打爆剩下的Inves |
敵人一欄
| 人物名 | 介紹 |
| 光金 | 由黃金果實誕生的人類，被葛葉紘汰打倒兩次後利用Neo Femushinmu的怨念復活，襲擊了尤諾，並吸收了Neo Femushinmu四人的生命力成為假面騎士Neo Mars |
| 斯卡蕾特 | Neo Femushinmu的首領，Femushinmu一族殘留下來的難民，對殺害同胞的葛葉紘汰懷有怨恨，為了復仇和殘留下來的同胞來到10年前找葛葉紘汰並企圖將他除掉，後被復活的光金吸收生命力而死 |
| 露普 | Neo Femushinmu之一，Femushinmu一族殘留下來的難民，對殺害同胞的葛葉紘汰懷有怨恨，為了復仇和殘留下來的同胞來到10年前找葛葉紘汰並企圖將他除掉，後被復活的光金吸收生命力而死 |
| 史佩特 | Neo Femushinmu之一，Femushinmu一族殘留下來的難民，對殺害同胞的葛葉紘汰懷有怨恨，為了復仇和殘留下來的同胞來到10年前找葛葉紘汰並企圖將他除掉，後被復活的光金吸收生命力而死 |
| 利拉 | Neo Femushinmu之一，Femushinmu一族殘留下來的難民，對殺害同胞的葛葉紘汰懷有怨恨，為了復仇和殘留下來的同胞來到10年前找葛葉紘汰並企圖將他除掉，後被復活的光金吸收生命力而死 |
| 白虎Inves | 詳細說明找假面騎士鎧武-維基百科，自由的百科全書-9.2異域者（Inves） |
| 鹿Inves | |
| 蝙蝠Inves | |
| 野豬Inves | |
| 青龍Inves | |
| 天牛Inves | |
| 貔貅Inves | |
| 獅子Inves | |
| 山羊Inves | |
| 螳螂Yummy | 詳細說明找假面騎士OOO-維基百科，自由的百科全書 |
| 獨角仙Yummy | |
| 鍬形蟲Yummy | |
| Masquerade Dopant | 詳細說明找假面騎士W-維基百科，自由的百科全書 |
本作登場的Shift Car
| 英文名 | 日文名 | 中文名 | 使用類型 | 汽車類型 | 能力 | 備註 |
| Shift Zero Speed | シフトゼロスピード | 變檔零式速度 | 形態變身 | 汽車 | 車身除了顏色是黑色之外和Type Speed完全一致 | |
| Shift Next Special | シフトネクストスベシャル | 變檔次世特殊 | 假面騎士Dark Drive用作變身形態Type Next 假面騎士Drive用作變身形態Type Special | |||
| Star Strike | スターストライク | 星際強襲 | 輪胎交換 | 附帶武器Strike Cannon 帶有光速般的行動能力 | Type Special專用 | |
| Lightning Lance | ライトニングランス | 雷鳴長槍 | 附帶武器Thunder Blade 帶有雷電能力 | |||
| Freeze Saber | フリーズセイバー | 冰結聖劍 | 附帶武器Ice Caliburn |
本作登場的Core Medals
| 代幣名稱 | 種類 | 變身部位 | 顏色 | 總計枚數 | 功能 | 備註 |
| Hasito Taka（哈斯特鷹） | 鳥類 | 頭部 | 紅色 | 1枚 | 可以掃描出敵人體內的硬幣，並擁有鷹的視力，協助瞄準。 | 不能聯組亞種形態 |
| Saberu Taiga（劍齒虎） | 貓系 | 手臂 | 黃色 | 1枚 | 手上裝有銳爪。 | |
| San KanouChuu（三葉蟲） | 昆蟲系 | 腿部 | 綠色 | 1枚 | 腿部裝有強大的金屬裝甲，可對全身增強防禦力。 |
本作登場的Lock Seed
| 英文名稱 | 日文名稱 | 中文名稱 | 編號 | 能力 | 持有者 | 備註 |
| Neo Kin No Ringo | ネオ金のリンゴ | 新金蘋果 | NLS-Gold | 附帶武器音速弩弓及引劍武裝者 | Neo Mars | 音效為“Neo Gold Arms！黃金的果實！” |
