總離子色譜圖是將每個質譜的所有離子加合得到的。同樣,由質譜中任何一個質量的離子也可以得到色譜圖,即質量色譜圖。質量色譜圖是由全掃描質譜中提取一種質量的離子得到的色譜圖,因此,又稱為提取離子色譜圖。假定做質量為m的離子的質量色譜圖,如果某化合物質譜中不存在這種離子,那么該化合物就不會出現色譜峰。一個混合物樣品中可能只有幾個甚至一個化合物出峰。利用這一特點可以識別具有某種特徵的化合物,也可以通過選擇不同質量的離子做質量色譜圖,使正常色譜不能分開的兩個峰實現分離,以便進行定量分析。由於質量色譜圖是採用一種質量的離子作色譜圖。因此,進行定量分析時也要使用同一離子得到的質量色譜圖測定校正因子。
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